Protein–RNA interactions for Protein: Q12241

VAM3, Syntaxin VAM3, yeastyeast

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VAM3Q12241 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.68□□□□□ -0.7
VAM3Q12241 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.68□□□□□ -0.7
VAM3Q12241 HOM6YJR139C 1080 nt10.68□□□□□ -0.7
VAM3Q12241 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.67□□□□□ -0.7
VAM3Q12241 SIS1YNL007C 1059 nt10.64□□□□□ -0.71
VAM3Q12241 SCC4YER147C 1875 nt10.59□□□□□ -0.71
VAM3Q12241 MNP1YGL068W 585 nt10.58□□□□□ -0.72
VAM3Q12241 IRC15YPL017C 1500 nt10.55□□□□□ -0.72
VAM3Q12241 SEC11YIR022W 504 nt10.54□□□□□ -0.72
VAM3Q12241 RKM5YLR137W 1104 nt10.53□□□□□ -0.72
VAM3Q12241 PCH2YBR186W 1695 nt10.5□□□□□ -0.73
VAM3Q12241 GIS3YLR094C 1509 nt10.49□□□□□ -0.73
VAM3Q12241 ART5YGR068C 1761 nt10.47□□□□□ -0.73
VAM3Q12241 GFD2YCL036W 1701 nt10.47□□□□□ -0.73
VAM3Q12241 GUT2YIL155C 1950 nt10.43□□□□□ -0.74
VAM3Q12241 PET9YBL030C 957 nt10.43□□□□□ -0.74
VAM3Q12241 YOL037CYOL037C 354 nt10.42□□□□□ -0.74
VAM3Q12241 YJL225CYJL225C 5277 nt10.41□□□□□ -0.74
VAM3Q12241 YCH1YGR203W 447 nt10.4□□□□□ -0.74
VAM3Q12241 YOR139CYOR139C 393 nt10.39□□□□□ -0.75
VAM3Q12241 RTS2YOR077W 699 nt10.38□□□□□ -0.75
VAM3Q12241 YSC84YHR016C 1407 nt10.36□□□□□ -0.75
VAM3Q12241 NPL3YDR432W 1245 nt10.35□□□□□ -0.75
VAM3Q12241 CUE1YMR264W 612 nt10.33□□□□□ -0.76
VAM3Q12241 TIR4YOR009W 1464 nt10.29□□□□□ -0.76
VAM3Q12241 YHL050CYHL050C 2094 nt10.28□□□□□ -0.76
VAM3Q12241 YNL195CYNL195C 786 nt10.27□□□□□ -0.77
VAM3Q12241 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.27□□□□□ -0.77
VAM3Q12241 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.27□□□□□ -0.77
VAM3Q12241 YIL100WYIL100W 354 nt10.25□□□□□ -0.77
VAM3Q12241 YMR057CYMR057C 372 nt10.23□□□□□ -0.77
VAM3Q12241 UME6YDR207C 2511 nt10.23□□□□□ -0.77
VAM3Q12241 PIB2YGL023C 1908 nt10.22□□□□□ -0.77
VAM3Q12241 RRT12YCR045C 1476 nt10.22□□□□□ -0.77
VAM3Q12241 RTF1YGL244W 1677 nt10.22□□□□□ -0.77
VAM3Q12241 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.19□□□□□ -0.78
VAM3Q12241 YLR236CYLR236C 324 nt10.17□□□□□ -0.78
VAM3Q12241 BOP3YNL042W 1191 nt10.17□□□□□ -0.78
VAM3Q12241 YLR281CYLR281C 468 nt10.16□□□□□ -0.78
VAM3Q12241 WHI5YOR083W 888 nt10.13□□□□□ -0.79
VAM3Q12241 YJL152WYJL152W 360 nt10.12□□□□□ -0.79
VAM3Q12241 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.07□□□□□ -0.8
VAM3Q12241 PTK1YKL198C 1989 nt10.03□□□□□ -0.8
VAM3Q12241 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10□□□□□ -0.81
VAM3Q12241 IMT4tM(CAU)E 72 nt10□□□□□ -0.81
VAM3Q12241 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10□□□□□ -0.81
VAM3Q12241 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10□□□□□ -0.81
VAM3Q12241 IMT2tM(CAU)P 72 nt10□□□□□ -0.81
VAM3Q12241 PUS2YGL063W 1113 nt9.99□□□□□ -0.81
VAM3Q12241 NCP1YHR042W 2076 nt9.97□□□□□ -0.81
VAM3Q12241 IMP2'YIL154C 1041 nt9.96□□□□□ -0.82
VAM3Q12241 IDH1YNL037C 1083 nt9.94□□□□□ -0.82
VAM3Q12241 DSK2YMR276W 1122 nt9.92□□□□□ -0.82
VAM3Q12241 GBP2YCL011C 1284 nt9.86□□□□□ -0.83
VAM3Q12241 YFL054CYFL054C 1941 nt9.86□□□□□ -0.83
VAM3Q12241 RPM1RPM1 483 nt9.85□□□□□ -0.83
VAM3Q12241 LCB1YMR296C 1677 nt9.84□□□□□ -0.83
VAM3Q12241 FMP52YER004W 696 nt9.82□□□□□ -0.84
VAM3Q12241 YPR011CYPR011C 981 nt9.82□□□□□ -0.84
VAM3Q12241 SPT8YLR055C 1809 nt9.79□□□□□ -0.84
VAM3Q12241 RRD1YIL153W 1182 nt9.78□□□□□ -0.84
VAM3Q12241 TCD2YKL027W 1344 nt9.77□□□□□ -0.85
VAM3Q12241 YDR433WYDR433W 441 nt9.75□□□□□ -0.85
VAM3Q12241 FMP45YDL222C 930 nt9.74□□□□□ -0.85
VAM3Q12241 ERV46YAL042W 1248 nt9.74□□□□□ -0.85
VAM3Q12241 SIM1YIL123W 1431 nt9.73□□□□□ -0.85
VAM3Q12241 DED1YOR204W 1815 nt9.72□□□□□ -0.85
VAM3Q12241 PCM1YEL058W 1674 nt9.71□□□□□ -0.85
VAM3Q12241 LPX1YOR084W 1164 nt9.69□□□□□ -0.86
VAM3Q12241 YKR040CYKR040C 504 nt9.67□□□□□ -0.86
VAM3Q12241 MXR2YCL033C 507 nt9.67□□□□□ -0.86
VAM3Q12241 BOR1YNL275W 1731 nt9.67□□□□□ -0.86
VAM3Q12241 LYS4YDR234W 2082 nt9.64□□□□□ -0.87
VAM3Q12241 SNF6YHL025W 999 nt9.64□□□□□ -0.87
VAM3Q12241 FMT1YBL013W 1206 nt9.63□□□□□ -0.87
VAM3Q12241 CWP1YKL096W 720 nt9.61□□□□□ -0.87
VAM3Q12241 BIO4YNR057C 714 nt9.61□□□□□ -0.87
VAM3Q12241 SWE1YJL187C 2460 nt9.61□□□□□ -0.87
VAM3Q12241 SOR2YDL246C 1074 nt9.6□□□□□ -0.87
VAM3Q12241 SOR1YJR159W 1074 nt9.6□□□□□ -0.87
VAM3Q12241 ADH2YMR303C 1047 nt9.6□□□□□ -0.87
VAM3Q12241 YCL042WYCL042W 360 nt9.58□□□□□ -0.88
VAM3Q12241 ERF2YLR246W 1080 nt9.56□□□□□ -0.88
VAM3Q12241 FRD1YEL047C 1413 nt9.55□□□□□ -0.88
VAM3Q12241 YIH1YCR059C 777 nt9.5□□□□□ -0.89
VAM3Q12241 CRR1YLR213C 1269 nt9.5□□□□□ -0.89
VAM3Q12241 MCH5YOR306C 1566 nt9.49□□□□□ -0.89
VAM3Q12241 HSP60YLR259C 1719 nt9.47□□□□□ -0.89
VAM3Q12241 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt9.45□□□□□ -0.9
VAM3Q12241 YLL053CYLL053C 459 nt9.45□□□□□ -0.9
VAM3Q12241 RNQ1YCL028W 1218 nt9.45□□□□□ -0.9
VAM3Q12241 SPP1YPL138C 1062 nt9.43□□□□□ -0.9
VAM3Q12241 HEM12YDR047W 1089 nt9.42□□□□□ -0.9
VAM3Q12241 GLK1YCL040W 1503 nt9.41□□□□□ -0.9
VAM3Q12241 YFL067WYFL067W 528 nt9.4□□□□□ -0.9
VAM3Q12241 RAX1YOR301W 1308 nt9.39□□□□□ -0.91
VAM3Q12241 ATF2YGR177C 1608 nt9.38□□□□□ -0.91
VAM3Q12241 SNG1YGR197C 1644 nt9.35□□□□□ -0.91
VAM3Q12241 FUR4YBR021W 1902 nt9.35□□□□□ -0.91
VAM3Q12241 FTR1YER145C 1215 nt9.35□□□□□ -0.91
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