Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.67□□□□□ -0.38
PUF2Q12221 SIS1YNL007C 1059 nt12.65□□□□□ -0.38
PUF2Q12221 PTP1YDL230W 1008 nt12.58□□□□□ -0.4
PUF2Q12221 RPP2AYOL039W 321 nt12.58□□□□□ -0.4
PUF2Q12221 DCW1YKL046C 1350 nt12.56□□□□□ -0.4
PUF2Q12221 YPR011CYPR011C 981 nt12.55□□□□□ -0.4
PUF2Q12221 TIR4YOR009W 1464 nt12.54□□□□□ -0.4
PUF2Q12221 YJL152WYJL152W 360 nt12.54□□□□□ -0.4
PUF2Q12221 YLR236CYLR236C 324 nt12.53□□□□□ -0.4
PUF2Q12221 YCH1YGR203W 447 nt12.51□□□□□ -0.41
PUF2Q12221 DSK2YMR276W 1122 nt12.5□□□□□ -0.41
PUF2Q12221 ART5YGR068C 1761 nt12.49□□□□□ -0.41
PUF2Q12221 CAC2YML102W 1407 nt12.47□□□□□ -0.41
PUF2Q12221 GFD2YCL036W 1701 nt12.43□□□□□ -0.42
PUF2Q12221 FMP45YDL222C 930 nt12.42□□□□□ -0.42
PUF2Q12221 IMP2'YIL154C 1041 nt12.39□□□□□ -0.43
PUF2Q12221 YMR057CYMR057C 372 nt12.38□□□□□ -0.43
PUF2Q12221 PET9YBL030C 957 nt12.37□□□□□ -0.43
PUF2Q12221 MOT3YMR070W 1473 nt12.37□□□□□ -0.43 RIP-Chip
PUF2Q12221 EMI2YDR516C 1503 nt12.36□□□□□ -0.43
PUF2Q12221 IDH1YNL037C 1083 nt12.33□□□□□ -0.44
PUF2Q12221 RTS2YOR077W 699 nt12.31□□□□□ -0.44
PUF2Q12221 SSA4YER103W 1929 nt12.31□□□□□ -0.44
PUF2Q12221 LPX1YOR084W 1164 nt12.3□□□□□ -0.44 RIP-Chip
PUF2Q12221 YDL221WYDL221W 552 nt12.28□□□□□ -0.44
PUF2Q12221 IRC15YPL017C 1500 nt12.27□□□□□ -0.44
PUF2Q12221 GBP2YCL011C 1284 nt12.24□□□□□ -0.45
PUF2Q12221 YDR433WYDR433W 441 nt12.23□□□□□ -0.45
PUF2Q12221 ERV46YAL042W 1248 nt12.23□□□□□ -0.45
PUF2Q12221 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.23□□□□□ -0.45
PUF2Q12221 FPS1YLL043W 2010 nt12.2□□□□□ -0.46 RIP-Chip
PUF2Q12221 MXR2YCL033C 507 nt12.19□□□□□ -0.46
PUF2Q12221 GIS3YLR094C 1509 nt12.17□□□□□ -0.46
PUF2Q12221 YMR090WYMR090W 684 nt12.17□□□□□ -0.46
PUF2Q12221 SPP1YPL138C 1062 nt12.14□□□□□ -0.47
PUF2Q12221 YKR040CYKR040C 504 nt12.11□□□□□ -0.47
PUF2Q12221 CUE1YMR264W 612 nt12.11□□□□□ -0.47
PUF2Q12221 SDH1YKL148C 1923 nt12.09□□□□□ -0.47
PUF2Q12221 YBR220CYBR220C 1683 nt12.09□□□□□ -0.47
PUF2Q12221 DED1YOR204W 1815 nt12.08□□□□□ -0.48
PUF2Q12221 RRD1YIL153W 1182 nt12.07□□□□□ -0.48
PUF2Q12221 TCD2YKL027W 1344 nt12.07□□□□□ -0.48
PUF2Q12221 SCC4YER147C 1875 nt12.05□□□□□ -0.48
PUF2Q12221 FMT1YBL013W 1206 nt11.96□□□□□ -0.49
PUF2Q12221 YIL100WYIL100W 354 nt11.94□□□□□ -0.5
PUF2Q12221 FRD1YEL047C 1413 nt11.93□□□□□ -0.5
PUF2Q12221 RTG1YOL067C 534 nt11.88□□□□□ -0.51
PUF2Q12221 SOR2YDL246C 1074 nt11.85□□□□□ -0.51
PUF2Q12221 SOR1YJR159W 1074 nt11.85□□□□□ -0.51
PUF2Q12221 MRPL8YJL063C 717 nt11.84□□□□□ -0.51
PUF2Q12221 YCL042WYCL042W 360 nt11.83□□□□□ -0.52
PUF2Q12221 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.81□□□□□ -0.52
PUF2Q12221 YEL076CYEL076C 651 nt11.81□□□□□ -0.52
PUF2Q12221 FMP52YER004W 696 nt11.81□□□□□ -0.52
PUF2Q12221 YLR464WYLR464W 651 nt11.81□□□□□ -0.52
PUF2Q12221 BDF1YLR399C 2061 nt11.81□□□□□ -0.52 RIP-Chip
PUF2Q12221 CWP1YKL096W 720 nt11.8□□□□□ -0.52
PUF2Q12221 PTH1YHR189W 573 nt11.78□□□□□ -0.52
PUF2Q12221 ADH2YMR303C 1047 nt11.78□□□□□ -0.52
PUF2Q12221 RRT12YCR045C 1476 nt11.77□□□□□ -0.52
PUF2Q12221 YSC84YHR016C 1407 nt11.76□□□□□ -0.53
PUF2Q12221 YHL050CYHL050C 2094 nt11.72□□□□□ -0.53
PUF2Q12221 ADO1YJR105W 1023 nt11.71□□□□□ -0.53
PUF2Q12221 YNL195CYNL195C 786 nt11.71□□□□□ -0.53
PUF2Q12221 PCM1YEL058W 1674 nt11.71□□□□□ -0.54
PUF2Q12221 TAT1YBR069C 1860 nt11.66□□□□□ -0.54
PUF2Q12221 SNF6YHL025W 999 nt11.64□□□□□ -0.55
PUF2Q12221 YLR235CYLR235C 399 nt11.64□□□□□ -0.55
PUF2Q12221 YKL030WYKL030W 606 nt11.61□□□□□ -0.55 RIP-Chip
PUF2Q12221 LCB1YMR296C 1677 nt11.61□□□□□ -0.55
PUF2Q12221 HUA1YGR268C 597 nt11.59□□□□□ -0.55
PUF2Q12221 DIC1YLR348C 897 nt11.59□□□□□ -0.55
PUF2Q12221 SEC11YIR022W 504 nt11.55□□□□□ -0.56
PUF2Q12221 YIH1YCR059C 777 nt11.53□□□□□ -0.56
PUF2Q12221 RNQ1YCL028W 1218 nt11.52□□□□□ -0.57
PUF2Q12221 PCH2YBR186W 1695 nt11.52□□□□□ -0.57
PUF2Q12221 TIM23YNR017W 669 nt11.51□□□□□ -0.57 RIP-Chip
PUF2Q12221 BIO4YNR057C 714 nt11.51□□□□□ -0.57
PUF2Q12221 UBX6YJL048C 1191 nt11.5□□□□□ -0.57
PUF2Q12221 Q0182Q0182 405 nt11.49□□□□□ -0.57
PUF2Q12221 SIM1YIL123W 1431 nt11.49□□□□□ -0.57
PUF2Q12221 YLR179CYLR179C 606 nt11.46□□□□□ -0.57
PUF2Q12221 GUT2YIL155C 1950 nt11.45□□□□□ -0.58 RIP-Chip
PUF2Q12221 YLL053CYLL053C 459 nt11.45□□□□□ -0.58 RIP-Chip
PUF2Q12221 WSC2YNL283C 1512 nt11.39□□□□□ -0.59
PUF2Q12221 NCP1YHR042W 2076 nt11.39□□□□□ -0.59
PUF2Q12221 YDR094WYDR094W 336 nt11.36□□□□□ -0.59
PUF2Q12221 FTR1YER145C 1215 nt11.36□□□□□ -0.59 RIP-Chip
PUF2Q12221 PIB2YGL023C 1908 nt11.35□□□□□ -0.59
PUF2Q12221 GAL1YBR020W 1587 nt11.34□□□□□ -0.59
PUF2Q12221 AHT1YHR093W 549 nt11.34□□□□□ -0.59
PUF2Q12221 YPR064WYPR064W 420 nt11.33□□□□□ -0.6
PUF2Q12221 TRM5YHR070W 1500 nt11.32□□□□□ -0.6
PUF2Q12221 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.32□□□□□ -0.6
PUF2Q12221 ATF2YGR177C 1608 nt11.3□□□□□ -0.6
PUF2Q12221 TAD3YLR316C 969 nt11.29□□□□□ -0.6
PUF2Q12221 RTF1YGL244W 1677 nt11.29□□□□□ -0.6
PUF2Q12221 BOP3YNL042W 1191 nt11.27□□□□□ -0.61
PUF2Q12221 AQY1YPR192W 918 nt11.26□□□□□ -0.61
PUF2Q12221 CRR1YLR213C 1269 nt11.25□□□□□ -0.61
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