Protein–RNA interactions for Protein: Q12186

MSL5, Branchpoint-bridging protein, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSL5Q12186 ADO1YJR105W 1023 nt11.19□□□□□ -0.62
MSL5Q12186 PHO4YFR034C 939 nt11.16□□□□□ -0.62
MSL5Q12186 CCT6YDR188W 1641 nt11.14□□□□□ -0.63
MSL5Q12186 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.13□□□□□ -0.63
MSL5Q12186 YEL076CYEL076C 651 nt11.13□□□□□ -0.63
MSL5Q12186 YLR464WYLR464W 651 nt11.13□□□□□ -0.63
MSL5Q12186 UBX6YJL048C 1191 nt11.12□□□□□ -0.63
MSL5Q12186 LPX1YOR084W 1164 nt11.07□□□□□ -0.64
MSL5Q12186 ERV46YAL042W 1248 nt11.06□□□□□ -0.64
MSL5Q12186 SPP1YPL138C 1062 nt11.05□□□□□ -0.64
MSL5Q12186 RTG1YOL067C 534 nt11.03□□□□□ -0.64
MSL5Q12186 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.02□□□□□ -0.65
MSL5Q12186 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.02□□□□□ -0.65
MSL5Q12186 SIS1YNL007C 1059 nt11.01□□□□□ -0.65
MSL5Q12186 NVJ2YPR091C 2313 nt11□□□□□ -0.65
MSL5Q12186 YJL152WYJL152W 360 nt10.99□□□□□ -0.65
MSL5Q12186 IDH1YNL037C 1083 nt10.98□□□□□ -0.65
MSL5Q12186 ALF1YNL148C 765 nt10.96□□□□□ -0.65
MSL5Q12186 YDR433WYDR433W 441 nt10.92□□□□□ -0.66
MSL5Q12186 YKR040CYKR040C 504 nt10.92□□□□□ -0.66
MSL5Q12186 PAC11YDR488C 1602 nt10.84□□□□□ -0.67
MSL5Q12186 HUA1YGR268C 597 nt10.83□□□□□ -0.68
MSL5Q12186 YDR094WYDR094W 336 nt10.82□□□□□ -0.68
MSL5Q12186 GBP2YCL011C 1284 nt10.81□□□□□ -0.68
MSL5Q12186 YDR095CYDR095C 411 nt10.79□□□□□ -0.68
MSL5Q12186 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.77□□□□□ -0.69
MSL5Q12186 MXR2YCL033C 507 nt10.77□□□□□ -0.69
MSL5Q12186 YPS1YLR120C 1710 nt10.76□□□□□ -0.69
MSL5Q12186 TIR4YOR009W 1464 nt10.75□□□□□ -0.69
MSL5Q12186 CAC2YML102W 1407 nt10.66□□□□□ -0.7
MSL5Q12186 TCD2YKL027W 1344 nt10.62□□□□□ -0.71
MSL5Q12186 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.62□□□□□ -0.71
MSL5Q12186 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.61□□□□□ -0.71
MSL5Q12186 RPP2AYOL039W 321 nt10.59□□□□□ -0.71
MSL5Q12186 YMR057CYMR057C 372 nt10.57□□□□□ -0.72
MSL5Q12186 PET9YBL030C 957 nt10.56□□□□□ -0.72
MSL5Q12186 ART5YGR068C 1761 nt10.56□□□□□ -0.72
MSL5Q12186 FRD1YEL047C 1413 nt10.56□□□□□ -0.72
MSL5Q12186 YKL030WYKL030W 606 nt10.52□□□□□ -0.73
MSL5Q12186 PTH1YHR189W 573 nt10.5□□□□□ -0.73
MSL5Q12186 DED1YOR204W 1815 nt10.49□□□□□ -0.73
MSL5Q12186 PTP1YDL230W 1008 nt10.49□□□□□ -0.73
MSL5Q12186 Q0182Q0182 405 nt10.48□□□□□ -0.73
MSL5Q12186 YLR235CYLR235C 399 nt10.48□□□□□ -0.73
MSL5Q12186 SBA1YKL117W 651 nt10.47□□□□□ -0.73
MSL5Q12186 GFD2YCL036W 1701 nt10.47□□□□□ -0.73
MSL5Q12186 RRD1YIL153W 1182 nt10.45□□□□□ -0.74
MSL5Q12186 YCL042WYCL042W 360 nt10.43□□□□□ -0.74
MSL5Q12186 PAU16YKL224C 372 nt10.41□□□□□ -0.74
MSL5Q12186 LCB1YMR296C 1677 nt10.41□□□□□ -0.74
MSL5Q12186 SOR2YDL246C 1074 nt10.39□□□□□ -0.75
MSL5Q12186 SOR1YJR159W 1074 nt10.39□□□□□ -0.75
MSL5Q12186 FMT1YBL013W 1206 nt10.36□□□□□ -0.75
MSL5Q12186 YFR018CYFR018C 1092 nt10.35□□□□□ -0.75
MSL5Q12186 MEP2YNL142W 1500 nt10.34□□□□□ -0.75
MSL5Q12186 RRT5YFR032C 870 nt10.34□□□□□ -0.75
MSL5Q12186 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.29□□□□□ -0.76
MSL5Q12186 RTS2YOR077W 699 nt10.27□□□□□ -0.77
MSL5Q12186 PRE6YOL038W 765 nt10.26□□□□□ -0.77
MSL5Q12186 FMP52YER004W 696 nt10.24□□□□□ -0.77
MSL5Q12186 TIM23YNR017W 669 nt10.22□□□□□ -0.77
MSL5Q12186 CWP1YKL096W 720 nt10.21□□□□□ -0.77
MSL5Q12186 CUE1YMR264W 612 nt10.19□□□□□ -0.78
MSL5Q12186 DCW1YKL046C 1350 nt10.18□□□□□ -0.78
MSL5Q12186 DIC1YLR348C 897 nt10.17□□□□□ -0.78
MSL5Q12186 SNF6YHL025W 999 nt10.16□□□□□ -0.78
MSL5Q12186 ADH2YMR303C 1047 nt10.16□□□□□ -0.78
MSL5Q12186 SPT5YML010W 3192 nt10.16□□□□□ -0.78
MSL5Q12186 IRC15YPL017C 1500 nt10.14□□□□□ -0.79
MSL5Q12186 YLR179CYLR179C 606 nt10.14□□□□□ -0.79
MSL5Q12186 YPR064WYPR064W 420 nt10.14□□□□□ -0.79
MSL5Q12186 TAD3YLR316C 969 nt10.1□□□□□ -0.79
MSL5Q12186 EMI2YDR516C 1503 nt10.09□□□□□ -0.79
MSL5Q12186 UME6YDR207C 2511 nt10.08□□□□□ -0.8
MSL5Q12186 SSA4YER103W 1929 nt10.07□□□□□ -0.8
MSL5Q12186 YDL221WYDL221W 552 nt10.07□□□□□ -0.8
MSL5Q12186 YIL100WYIL100W 354 nt10.06□□□□□ -0.8
MSL5Q12186 GIS3YLR094C 1509 nt10.06□□□□□ -0.8
MSL5Q12186 NAT4YMR069W 858 nt10.05□□□□□ -0.8
MSL5Q12186 WSC2YNL283C 1512 nt10.04□□□□□ -0.8
MSL5Q12186 YFL066CYFL066C 1179 nt10.04□□□□□ -0.8
MSL5Q12186 AHT1YHR093W 549 nt10.04□□□□□ -0.8
MSL5Q12186 PEX25YPL112C 1185 nt10.02□□□□□ -0.81
MSL5Q12186 RNQ1YCL028W 1218 nt10.02□□□□□ -0.81
MSL5Q12186 PCM1YEL058W 1674 nt10.02□□□□□ -0.81
MSL5Q12186 YMR090WYMR090W 684 nt9.99□□□□□ -0.81
MSL5Q12186 YIH1YCR059C 777 nt9.98□□□□□ -0.81
MSL5Q12186 RPM1RPM1 483 nt9.97□□□□□ -0.81
MSL5Q12186 GLK1YCL040W 1503 nt9.96□□□□□ -0.82
MSL5Q12186 BDF1YLR399C 2061 nt9.92□□□□□ -0.82
MSL5Q12186 YSP3YOR003W 1437 nt9.92□□□□□ -0.82
MSL5Q12186 MSF1YPR047W 1410 nt9.92□□□□□ -0.82
MSL5Q12186 YNL115CYNL115C 1935 nt9.91□□□□□ -0.82
MSL5Q12186 BDH1YAL060W 1149 nt9.9□□□□□ -0.82
MSL5Q12186 AQY1YPR192W 918 nt9.89□□□□□ -0.83
MSL5Q12186 YMR244WYMR244W 1068 nt9.88□□□□□ -0.83
MSL5Q12186 SCC4YER147C 1875 nt9.86□□□□□ -0.83
MSL5Q12186 YLR415CYLR415C 339 nt9.86□□□□□ -0.83
MSL5Q12186 YSC84YHR016C 1407 nt9.85□□□□□ -0.83
MSL5Q12186 THI74YDR438W 1113 nt9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 502.9 ms