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Protein–RNA interactions for Protein: Q12090
REX3, RNA exonuclease 3, yeast
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404 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
REX3
Q12090
WHI5
YOR083W
888 nt
11.44
□□□□□ -0.58
REX3
Q12090
YHR165W-A
YHR165W-A
312 nt
11.4
□□□□□ -0.58
REX3
Q12090
YDR095C
YDR095C
411 nt
11.39
□□□□□ -0.59
REX3
Q12090
YLR154C-G
YLR154C-G
150 nt
11.35
□□□□□ -0.59
REX3
Q12090
YJL152W
YJL152W
360 nt
11.3
□□□□□ -0.6
REX3
Q12090
IMP2'
YIL154C
1041 nt
11.29
□□□□□ -0.6
REX3
Q12090
SIS1
YNL007C
1059 nt
11.26
□□□□□ -0.61
REX3
Q12090
SPT5
YML010W
3192 nt
11.23
□□□□□ -0.61
REX3
Q12090
DSK2
YMR276W
1122 nt
11.23
□□□□□ -0.61
REX3
Q12090
RPP2A
YOL039W
321 nt
11.23
□□□□□ -0.61
REX3
Q12090
MEP2
YNL142W
1500 nt
11.2
□□□□□ -0.62
REX3
Q12090
SSA4
YER103W
1929 nt
11.17
□□□□□ -0.62
REX3
Q12090
FMP45
YDL222C
930 nt
11.15
□□□□□ -0.62
REX3
Q12090
YCH1
YGR203W
447 nt
11.13
□□□□□ -0.63
REX3
Q12090
IDH1
YNL037C
1083 nt
11.13
□□□□□ -0.63
REX3
Q12090
TIR4
YOR009W
1464 nt
11.06
□□□□□ -0.64
REX3
Q12090
PET9
YBL030C
957 nt
11.06
□□□□□ -0.64
REX3
Q12090
ART5
YGR068C
1761 nt
11.05
□□□□□ -0.64
REX3
Q12090
YLR236C
YLR236C
324 nt
11.05
□□□□□ -0.64
REX3
Q12090
PTP1
YDL230W
1008 nt
11.03
□□□□□ -0.64
REX3
Q12090
YCL048W-A
YCL048W-A
240 nt
11.03
□□□□□ -0.64
REX3
Q12090
YPR011C
YPR011C
981 nt
11.01
□□□□□ -0.65
REX3
Q12090
YDR433W
YDR433W
441 nt
10.99
□□□□□ -0.65
REX3
Q12090
YMR057C
YMR057C
372 nt
10.99
□□□□□ -0.65
REX3
Q12090
YMR090W
YMR090W
684 nt
10.99
□□□□□ -0.65
REX3
Q12090
CAC2
YML102W
1407 nt
10.99
□□□□□ -0.65
REX3
Q12090
GBP2
YCL011C
1284 nt
10.98
□□□□□ -0.65
REX3
Q12090
DCW1
YKL046C
1350 nt
10.98
□□□□□ -0.65
REX3
Q12090
GFD2
YCL036W
1701 nt
10.96
□□□□□ -0.65
REX3
Q12090
EMI2
YDR516C
1503 nt
10.92
□□□□□ -0.66
REX3
Q12090
ERV46
YAL042W
1248 nt
10.91
□□□□□ -0.66
REX3
Q12090
LPX1
YOR084W
1164 nt
10.9
□□□□□ -0.66
REX3
Q12090
YKR040C
YKR040C
504 nt
10.87
□□□□□ -0.67
REX3
Q12090
TCD2
YKL027W
1344 nt
10.86
□□□□□ -0.67
REX3
Q12090
YDL221W
YDL221W
552 nt
10.85
□□□□□ -0.67
REX3
Q12090
RTS2
YOR077W
699 nt
10.84
□□□□□ -0.67
REX3
Q12090
RPM1
RPM1
483 nt
10.82
□□□□□ -0.68
REX3
Q12090
BDF1
YLR399C
2061 nt
10.8
□□□□□ -0.68
REX3
Q12090
MXR2
YCL033C
507 nt
10.78
□□□□□ -0.68
REX3
Q12090
IRC15
YPL017C
1500 nt
10.76
□□□□□ -0.69
REX3
Q12090
CUE1
YMR264W
612 nt
10.76
□□□□□ -0.69
REX3
Q12090
UME6
YDR207C
2511 nt
10.74
□□□□□ -0.69
REX3
Q12090
YIL100W
YIL100W
354 nt
10.74
□□□□□ -0.69
REX3
Q12090
MRPL8
YJL063C
717 nt
10.73
□□□□□ -0.69
REX3
Q12090
GIS3
YLR094C
1509 nt
10.7
□□□□□ -0.7
REX3
Q12090
SPP1
YPL138C
1062 nt
10.7
□□□□□ -0.7
REX3
Q12090
ADO1
YJR105W
1023 nt
10.69
□□□□□ -0.7
REX3
Q12090
YCL042W
YCL042W
360 nt
10.69
□□□□□ -0.7
REX3
Q12090
SDH1
YKL148C
1923 nt
10.67
□□□□□ -0.7
REX3
Q12090
SCC4
YER147C
1875 nt
10.66
□□□□□ -0.7
REX3
Q12090
TAT1
YBR069C
1860 nt
10.65
□□□□□ -0.7
REX3
Q12090
RRD1
YIL153W
1182 nt
10.64
□□□□□ -0.71
REX3
Q12090
DED1
YOR204W
1815 nt
10.61
□□□□□ -0.71
REX3
Q12090
YEL076C-A
YEL076C-A
651 nt
10.6
□□□□□ -0.71
REX3
Q12090
YEL076C
YEL076C
651 nt
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□□□□□ -0.71
REX3
Q12090
FMP52
YER004W
696 nt
10.6
□□□□□ -0.71
REX3
Q12090
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YLR464W
651 nt
10.6
□□□□□ -0.71
REX3
Q12090
YNL195C
YNL195C
786 nt
10.59
□□□□□ -0.71
REX3
Q12090
YBR220C
YBR220C
1683 nt
10.59
□□□□□ -0.71
REX3
Q12090
FRD1
YEL047C
1413 nt
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□□□□□ -0.72
REX3
Q12090
SOR2
YDL246C
1074 nt
10.53
□□□□□ -0.72
REX3
Q12090
SOR1
YJR159W
1074 nt
10.53
□□□□□ -0.72
REX3
Q12090
RTG1
YOL067C
534 nt
10.53
□□□□□ -0.72
REX3
Q12090
HUA1
YGR268C
597 nt
10.52
□□□□□ -0.73
REX3
Q12090
CWP1
YKL096W
720 nt
10.52
□□□□□ -0.73
REX3
Q12090
YLR235C
YLR235C
399 nt
10.52
□□□□□ -0.73
REX3
Q12090
FMT1
YBL013W
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□□□□□ -0.73
REX3
Q12090
PTH1
YHR189W
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□□□□□ -0.73
REX3
Q12090
FRE6
YLL051C
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10.46
□□□□□ -0.73
REX3
Q12090
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YKL030W
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10.45
□□□□□ -0.74
REX3
Q12090
SNF6
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10.44
□□□□□ -0.74
REX3
Q12090
ADH2
YMR303C
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□□□□□ -0.74
REX3
Q12090
PCM1
YEL058W
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10.41
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Q12090
YSC84
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REX3
Q12090
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YMR296C
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□□□□□ -0.75
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Q12090
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Q12090
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REX3
Q12090
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Q12090
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Q12090
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REX3
Q12090
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YLR179C
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REX3
Q12090
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REX3
Q12090
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YIL123W
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REX3
Q12090
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YPR064W
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REX3
Q12090
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YHL050C
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□□□□□ -0.77
REX3
Q12090
UBX6
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REX3
Q12090
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YDR094W
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□□□□□ -0.77
REX3
Q12090
tL(GAG)G
tL(GAG)G
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10.2
□□□□□ -0.78
REX3
Q12090
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YLL053C
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□□□□□ -0.78
REX3
Q12090
BIO4
YNR057C
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10.17
□□□□□ -0.78
REX3
Q12090
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10.16
□□□□□ -0.78
REX3
Q12090
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REX3
Q12090
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□□□□□ -0.79
REX3
Q12090
FTR1
YER145C
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10.12
□□□□□ -0.79
REX3
Q12090
GUT2
YIL155C
1950 nt
10.1
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REX3
Q12090
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549 nt
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□□□□□ -0.79
REX3
Q12090
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YLR246W
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10.09
□□□□□ -0.79
REX3
Q12090
DDR2
YOL052C-A
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□□□□□ -0.8
REX3
Q12090
GAL1
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10.08
□□□□□ -0.8
REX3
Q12090
YFL067W
YFL067W
528 nt
10.06
□□□□□ -0.8
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