Protein–RNA interactions for Protein: Q12072

IOC2, ISWI one complex protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
IOC2Q12072 RPP2BYDR382W 333 nt12.86□□□□□ -0.35
IOC2Q12072 ABZ2YMR289W 1125 nt12.8□□□□□ -0.36
IOC2Q12072 UTP6YDR449C 1323 nt12.8□□□□□ -0.36
IOC2Q12072 YPL168WYPL168W 1293 nt12.79□□□□□ -0.36
IOC2Q12072 PHO92YDR374C 921 nt12.78□□□□□ -0.36
IOC2Q12072 SHU1YHL006C 453 nt12.77□□□□□ -0.37
IOC2Q12072 SKG1YKR100C 1068 nt12.77□□□□□ -0.37
IOC2Q12072 YLR122CYLR122C 378 nt12.77□□□□□ -0.37
IOC2Q12072 FIS1YIL065C 468 nt12.76□□□□□ -0.37
IOC2Q12072 DAL1YIR027C 1383 nt12.76□□□□□ -0.37
IOC2Q12072 NEM1YHR004C 1341 nt12.75□□□□□ -0.37
IOC2Q12072 YKL097CYKL097C 411 nt12.75□□□□□ -0.37
IOC2Q12072 SRB2YHR041C 633 nt12.74□□□□□ -0.37
IOC2Q12072 FPR4YLR449W 1179 nt12.74□□□□□ -0.37
IOC2Q12072 INM2YDR287W 879 nt12.71□□□□□ -0.37
IOC2Q12072 YHL044WYHL044W 708 nt12.69□□□□□ -0.38
IOC2Q12072 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt12.67□□□□□ -0.38
IOC2Q12072 PHO4YFR034C 939 nt12.64□□□□□ -0.39
IOC2Q12072 AST1YBL069W 1290 nt12.64□□□□□ -0.39
IOC2Q12072 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.58□□□□□ -0.4
IOC2Q12072 WWM1YFL010C 636 nt12.57□□□□□ -0.4
IOC2Q12072 YBL100CYBL100C 315 nt12.57□□□□□ -0.4
IOC2Q12072 BDH2YAL061W 1254 nt12.56□□□□□ -0.4
IOC2Q12072 RPM1RPM1 483 nt12.52□□□□□ -0.41
IOC2Q12072 STD1YOR047C 1335 nt12.52□□□□□ -0.41
IOC2Q12072 MEP2YNL142W 1500 nt12.52□□□□□ -0.41
IOC2Q12072 YGR021WYGR021W 873 nt12.51□□□□□ -0.41
IOC2Q12072 URE2YNL229C 1065 nt12.5□□□□□ -0.41
IOC2Q12072 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt12.48□□□□□ -0.41
IOC2Q12072 PEX27YOR193W 1131 nt12.47□□□□□ -0.41
IOC2Q12072 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt12.46□□□□□ -0.41
IOC2Q12072 YPS1YLR120C 1710 nt12.45□□□□□ -0.42
IOC2Q12072 HOM6YJR139C 1080 nt12.44□□□□□ -0.42
IOC2Q12072 FAR3YMR052W 615 nt12.43□□□□□ -0.42
IOC2Q12072 TOM20YGR082W 552 nt12.41□□□□□ -0.42
IOC2Q12072 FUN26YAL022C 1554 nt12.4□□□□□ -0.42
IOC2Q12072 YDR008CYDR008C 351 nt12.4□□□□□ -0.42
IOC2Q12072 LSM3YLR438C-A 270 nt12.4□□□□□ -0.42
IOC2Q12072 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.39□□□□□ -0.43
IOC2Q12072 FPS1YLL043W 2010 nt12.37□□□□□ -0.43
IOC2Q12072 TRM9YML014W 840 nt12.35□□□□□ -0.43
IOC2Q12072 YDR095CYDR095C 411 nt12.34□□□□□ -0.43
IOC2Q12072 MNP1YGL068W 585 nt12.34□□□□□ -0.43
IOC2Q12072 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.34□□□□□ -0.43
IOC2Q12072 GTT3YEL017W 1014 nt12.33□□□□□ -0.44
IOC2Q12072 HMT1YBR034C 1047 nt12.33□□□□□ -0.44
IOC2Q12072 YPL071CYPL071C 471 nt12.3□□□□□ -0.44
IOC2Q12072 ALF1YNL148C 765 nt12.29□□□□□ -0.44
IOC2Q12072 YBR220CYBR220C 1683 nt12.27□□□□□ -0.45
IOC2Q12072 DCW1YKL046C 1350 nt12.27□□□□□ -0.45
IOC2Q12072 RKM5YLR137W 1104 nt12.26□□□□□ -0.45
IOC2Q12072 CCT6YDR188W 1641 nt12.23□□□□□ -0.45
IOC2Q12072 YOR139CYOR139C 393 nt12.22□□□□□ -0.45
IOC2Q12072 PUS9YDL036C 1389 nt12.21□□□□□ -0.45
IOC2Q12072 HAS1YMR290C 1518 nt12.21□□□□□ -0.46
IOC2Q12072 FTR1YER145C 1215 nt12.2□□□□□ -0.46
IOC2Q12072 IRC14YOR135C 342 nt12.18□□□□□ -0.46
IOC2Q12072 NPL3YDR432W 1245 nt12.17□□□□□ -0.46
IOC2Q12072 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.16□□□□□ -0.46
IOC2Q12072 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.16□□□□□ -0.46
IOC2Q12072 YOL037CYOL037C 354 nt12.16□□□□□ -0.46
IOC2Q12072 RPP2AYOL039W 321 nt12.12□□□□□ -0.47
IOC2Q12072 PCH2YBR186W 1695 nt12.11□□□□□ -0.47
IOC2Q12072 LCP5YER127W 1074 nt12.1□□□□□ -0.47
IOC2Q12072 GUT2YIL155C 1950 nt12.1□□□□□ -0.47
IOC2Q12072 MPS2YGL075C 1164 nt12.09□□□□□ -0.47
IOC2Q12072 YLR036CYLR036C 612 nt12.09□□□□□ -0.47
IOC2Q12072 LSM12YHR121W 564 nt12.08□□□□□ -0.48
IOC2Q12072 EMI2YDR516C 1503 nt12.07□□□□□ -0.48
IOC2Q12072 YMR090WYMR090W 684 nt12.07□□□□□ -0.48
IOC2Q12072 PTP1YDL230W 1008 nt12.06□□□□□ -0.48
IOC2Q12072 SIS1YNL007C 1059 nt12.06□□□□□ -0.48
IOC2Q12072 CUS2YNL286W 858 nt12.06□□□□□ -0.48
IOC2Q12072 UBC12YLR306W 567 nt12.04□□□□□ -0.48
IOC2Q12072 MET8YBR213W 825 nt12.04□□□□□ -0.48
IOC2Q12072 ARC19YKL013C 516 nt12.03□□□□□ -0.48
IOC2Q12072 URH1YDR400W 1023 nt12.02□□□□□ -0.49
IOC2Q12072 NEJ1YLR265C 1029 nt12.02□□□□□ -0.49
IOC2Q12072 UME6YDR207C 2511 nt11.99□□□□□ -0.49
IOC2Q12072 CAC2YML102W 1407 nt11.99□□□□□ -0.49
IOC2Q12072 SDH1YKL148C 1923 nt11.98□□□□□ -0.49
IOC2Q12072 SEC11YIR022W 504 nt11.98□□□□□ -0.49
IOC2Q12072 YNL040WYNL040W 1371 nt11.97□□□□□ -0.49
IOC2Q12072 YEL074WYEL074W 339 nt11.97□□□□□ -0.49
IOC2Q12072 YJL107CYJL107C 1164 nt11.97□□□□□ -0.49
IOC2Q12072 IDI1YPL117C 867 nt11.97□□□□□ -0.49
IOC2Q12072 YDL221WYDL221W 552 nt11.95□□□□□ -0.5
IOC2Q12072 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt11.95□□□□□ -0.5
IOC2Q12072 COX3Q0275 810 nt11.94□□□□□ -0.5
IOC2Q12072 NUF2YOL069W 1356 nt11.93□□□□□ -0.5
IOC2Q12072 SKI6YGR195W 741 nt11.93□□□□□ -0.5
IOC2Q12072 YML079WYML079W 606 nt11.93□□□□□ -0.5
IOC2Q12072 PIB2YGL023C 1908 nt11.93□□□□□ -0.5
IOC2Q12072 CLB6YGR109C 1143 nt11.92□□□□□ -0.5
IOC2Q12072 RUF21RUF21 707 nt11.92□□□□□ -0.5
IOC2Q12072 THP3YPR045C 1413 nt11.92□□□□□ -0.5
IOC2Q12072 YPR1YDR368W 939 nt11.9□□□□□ -0.5
IOC2Q12072 ART5YGR068C 1761 nt11.89□□□□□ -0.51
IOC2Q12072 YHM2YMR241W 945 nt11.88□□□□□ -0.51
IOC2Q12072 YLR281CYLR281C 468 nt11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 40.2 ms