Protein–RNA interactions for Protein: Q12042

YPL162C, Vacuolar membrane protein YPL162C, yeastyeast

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL162CQ12042 CCT6YDR188W 1641 nt9.68□□□□□ -0.86
YPL162CQ12042 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt9.68□□□□□ -0.86
YPL162CQ12042 SCC4YER147C 1875 nt9.66□□□□□ -0.86
YPL162CQ12042 YJL225CYJL225C 5277 nt9.64□□□□□ -0.87
YPL162CQ12042 CAC2YML102W 1407 nt9.64□□□□□ -0.87
YPL162CQ12042 PIB2YGL023C 1908 nt9.62□□□□□ -0.87
YPL162CQ12042 RPP2AYOL039W 321 nt9.59□□□□□ -0.87
YPL162CQ12042 MNP1YGL068W 585 nt9.58□□□□□ -0.88
YPL162CQ12042 RKM5YLR137W 1104 nt9.58□□□□□ -0.88
YPL162CQ12042 PTP1YDL230W 1008 nt9.57□□□□□ -0.88
YPL162CQ12042 RTF1YGL244W 1677 nt9.55□□□□□ -0.88
YPL162CQ12042 YOL037CYOL037C 354 nt9.53□□□□□ -0.88
YPL162CQ12042 YSC84YHR016C 1407 nt9.52□□□□□ -0.89
YPL162CQ12042 SIS1YNL007C 1059 nt9.52□□□□□ -0.89
YPL162CQ12042 IRC15YPL017C 1500 nt9.5□□□□□ -0.89
YPL162CQ12042 RDN37-1RDN37-1 5354 nt9.47□□□□□ -0.89
YPL162CQ12042 RDN37-2RDN37-2 5354 nt9.47□□□□□ -0.89
YPL162CQ12042 NPL3YDR432W 1245 nt9.47□□□□□ -0.89
YPL162CQ12042 GIS3YLR094C 1509 nt9.46□□□□□ -0.89
YPL162CQ12042 BOR1YNL275W 1731 nt9.46□□□□□ -0.89
YPL162CQ12042 UME6YDR207C 2511 nt9.46□□□□□ -0.9
YPL162CQ12042 YHL050CYHL050C 2094 nt9.43□□□□□ -0.9
YPL162CQ12042 YCH1YGR203W 447 nt9.43□□□□□ -0.9
YPL162CQ12042 BOP3YNL042W 1191 nt9.43□□□□□ -0.9
YPL162CQ12042 Q0182Q0182 405 nt9.41□□□□□ -0.9
YPL162CQ12042 PTK1YKL198C 1989 nt9.39□□□□□ -0.91
YPL162CQ12042 PET9YBL030C 957 nt9.37□□□□□ -0.91
YPL162CQ12042 YOR139CYOR139C 393 nt9.33□□□□□ -0.92
YPL162CQ12042 ART5YGR068C 1761 nt9.32□□□□□ -0.92
YPL162CQ12042 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt9.31□□□□□ -0.92
YPL162CQ12042 GFD2YCL036W 1701 nt9.31□□□□□ -0.92
YPL162CQ12042 RRT12YCR045C 1476 nt9.29□□□□□ -0.92
YPL162CQ12042 YJL152WYJL152W 360 nt9.28□□□□□ -0.92
YPL162CQ12042 YNL195CYNL195C 786 nt9.25□□□□□ -0.93
YPL162CQ12042 RTS2YOR077W 699 nt9.25□□□□□ -0.93
YPL162CQ12042 TIR4YOR009W 1464 nt9.25□□□□□ -0.93
YPL162CQ12042 WHI5YOR083W 888 nt9.21□□□□□ -0.94
YPL162CQ12042 YLR281CYLR281C 468 nt9.2□□□□□ -0.94
YPL162CQ12042 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt9.2□□□□□ -0.94
YPL162CQ12042 YMR057CYMR057C 372 nt9.19□□□□□ -0.94
YPL162CQ12042 CUE1YMR264W 612 nt9.19□□□□□ -0.94
YPL162CQ12042 YFL054CYFL054C 1941 nt9.19□□□□□ -0.94
YPL162CQ12042 IMP2'YIL154C 1041 nt9.18□□□□□ -0.94
YPL162CQ12042 MCH5YOR306C 1566 nt9.18□□□□□ -0.94
YPL162CQ12042 YIL100WYIL100W 354 nt9.17□□□□□ -0.94
YPL162CQ12042 YLR236CYLR236C 324 nt9.16□□□□□ -0.94
YPL162CQ12042 SPT8YLR055C 1809 nt9.16□□□□□ -0.94
YPL162CQ12042 IDH1YNL037C 1083 nt9.14□□□□□ -0.95
YPL162CQ12042 NCP1YHR042W 2076 nt9.12□□□□□ -0.95
YPL162CQ12042 ALG12YNR030W 1656 nt9.08□□□□□ -0.96
YPL162CQ12042 PUS2YGL063W 1113 nt9.08□□□□□ -0.96
YPL162CQ12042 HSP60YLR259C 1719 nt9.07□□□□□ -0.96
YPL162CQ12042 DSK2YMR276W 1122 nt9.04□□□□□ -0.96
YPL162CQ12042 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt9.01□□□□□ -0.97
YPL162CQ12042 IMT4tM(CAU)E 72 nt9.01□□□□□ -0.97
YPL162CQ12042 IMT3tM(CAU)J3 72 nt9.01□□□□□ -0.97
YPL162CQ12042 IMT1tM(CAU)O1 72 nt9.01□□□□□ -0.97
YPL162CQ12042 IMT2tM(CAU)P 72 nt9.01□□□□□ -0.97
YPL162CQ12042 GBP2YCL011C 1284 nt9.01□□□□□ -0.97
YPL162CQ12042 TCD2YKL027W 1344 nt8.97□□□□□ -0.97
YPL162CQ12042 SWE1YJL187C 2460 nt8.93□□□□□ -0.98
YPL162CQ12042 GLK1YCL040W 1503 nt8.92□□□□□ -0.98
YPL162CQ12042 FMP52YER004W 696 nt8.92□□□□□ -0.98
YPL162CQ12042 YDR433WYDR433W 441 nt8.91□□□□□ -0.98
YPL162CQ12042 FMP45YDL222C 930 nt8.85□□□□□ -0.99
YPL162CQ12042 LCB1YMR296C 1677 nt8.85□□□□□ -0.99
YPL162CQ12042 RRD1YIL153W 1182 nt8.84□□□□□ -0.99
YPL162CQ12042 ERV46YAL042W 1248 nt8.84□□□□□ -0.99
YPL162CQ12042 NAR1YNL240C 1476 nt8.83□□□□□ -1
YPL162CQ12042 YKR040CYKR040C 504 nt8.81□□□□□ -1
YPL162CQ12042 YCL042WYCL042W 360 nt8.81□□□□□ -1
YPL162CQ12042 DED1YOR204W 1815 nt8.76□□□□□ -1.01
YPL162CQ12042 LPX1YOR084W 1164 nt8.75□□□□□ -1.01
YPL162CQ12042 YPR011CYPR011C 981 nt8.75□□□□□ -1.01
YPL162CQ12042 SOR2YDL246C 1074 nt8.74□□□□□ -1.01
YPL162CQ12042 SNF6YHL025W 999 nt8.74□□□□□ -1.01
YPL162CQ12042 SOR1YJR159W 1074 nt8.74□□□□□ -1.01
YPL162CQ12042 FUR4YBR021W 1902 nt8.74□□□□□ -1.01
YPL162CQ12042 PCM1YEL058W 1674 nt8.73□□□□□ -1.01
YPL162CQ12042 AAC1YMR056C 930 nt8.73□□□□□ -1.01
YPL162CQ12042 MXR2YCL033C 507 nt8.73□□□□□ -1.01
YPL162CQ12042 CWP1YKL096W 720 nt8.72□□□□□ -1.01
YPL162CQ12042 PRP4YPR178W 1398 nt8.7□□□□□ -1.02
YPL162CQ12042 SIM1YIL123W 1431 nt8.69□□□□□ -1.02
YPL162CQ12042 FMT1YBL013W 1206 nt8.67□□□□□ -1.02
YPL162CQ12042 BIO4YNR057C 714 nt8.67□□□□□ -1.02
YPL162CQ12042 LYS4YDR234W 2082 nt8.66□□□□□ -1.02
YPL162CQ12042 ADH2YMR303C 1047 nt8.66□□□□□ -1.02
YPL162CQ12042 MOT3YMR070W 1473 nt8.65□□□□□ -1.02
YPL162CQ12042 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt8.65□□□□□ -1.02
YPL162CQ12042 YEL076CYEL076C 651 nt8.65□□□□□ -1.02
YPL162CQ12042 YLR464WYLR464W 651 nt8.65□□□□□ -1.02
YPL162CQ12042 DPS1YLL018C 1674 nt8.65□□□□□ -1.03
YPL162CQ12042 FRD1YEL047C 1413 nt8.63□□□□□ -1.03
YPL162CQ12042 CMP2YML057W 1815 nt8.61□□□□□ -1.03
YPL162CQ12042 BMT6YLR063W 1098 nt8.6□□□□□ -1.03
YPL162CQ12042 YIH1YCR059C 777 nt8.59□□□□□ -1.03
YPL162CQ12042 CYT2YKL087C 675 nt8.59□□□□□ -1.03
YPL162CQ12042 RNQ1YCL028W 1218 nt8.59□□□□□ -1.03
YPL162CQ12042 BIO5YNR056C 1686 nt8.59□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 57.1 ms