Protein–RNA interactions for Protein: Q08972

NEW1, [NU+] prion formation protein 1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEW1Q08972 RKM5YLR137W 1104 nt13.38□□□□□ -0.27
NEW1Q08972 ART5YGR068C 1761 nt13.32□□□□□ -0.28
NEW1Q08972 SDH1YKL148C 1923 nt13.32□□□□□ -0.28
NEW1Q08972 IRC15YPL017C 1500 nt13.29□□□□□ -0.28
NEW1Q08972 GFD2YCL036W 1701 nt13.27□□□□□ -0.28
NEW1Q08972 TAT1YBR069C 1860 nt13.25□□□□□ -0.29
NEW1Q08972 RTS2YOR077W 699 nt13.23□□□□□ -0.29
NEW1Q08972 SCC4YER147C 1875 nt13.22□□□□□ -0.29
NEW1Q08972 GIS3YLR094C 1509 nt13.22□□□□□ -0.29
NEW1Q08972 TIR4YOR009W 1464 nt13.18□□□□□ -0.3
NEW1Q08972 PET9YBL030C 957 nt13.18□□□□□ -0.3
NEW1Q08972 MOT3YMR070W 1473 nt13.12□□□□□ -0.31
NEW1Q08972 YMR057CYMR057C 372 nt13.11□□□□□ -0.31
NEW1Q08972 YCH1YGR203W 447 nt13.09□□□□□ -0.31
NEW1Q08972 YJL152WYJL152W 360 nt13.08□□□□□ -0.32
NEW1Q08972 YOL037CYOL037C 354 nt13.08□□□□□ -0.32
NEW1Q08972 NPL3YDR432W 1245 nt13.06□□□□□ -0.32
NEW1Q08972 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.03□□□□□ -0.32
NEW1Q08972 CUE1YMR264W 612 nt13.02□□□□□ -0.33
NEW1Q08972 YOR139CYOR139C 393 nt13.02□□□□□ -0.33
NEW1Q08972 YSC84YHR016C 1407 nt12.96□□□□□ -0.34
NEW1Q08972 PCH2YBR186W 1695 nt12.93□□□□□ -0.34
NEW1Q08972 SEC11YIR022W 504 nt12.92□□□□□ -0.34
NEW1Q08972 FPS1YLL043W 2010 nt12.92□□□□□ -0.34
NEW1Q08972 YIL100WYIL100W 354 nt12.9□□□□□ -0.34
NEW1Q08972 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.89□□□□□ -0.35
NEW1Q08972 RRT12YCR045C 1476 nt12.88□□□□□ -0.35
NEW1Q08972 WHI5YOR083W 888 nt12.86□□□□□ -0.35
NEW1Q08972 GUT2YIL155C 1950 nt12.85□□□□□ -0.35
NEW1Q08972 YLR236CYLR236C 324 nt12.85□□□□□ -0.35
NEW1Q08972 YHL050CYHL050C 2094 nt12.85□□□□□ -0.35
NEW1Q08972 YNL195CYNL195C 786 nt12.84□□□□□ -0.35
NEW1Q08972 YLR281CYLR281C 468 nt12.82□□□□□ -0.36
NEW1Q08972 IDH1YNL037C 1083 nt12.67□□□□□ -0.38
NEW1Q08972 GBP2YCL011C 1284 nt12.65□□□□□ -0.38
NEW1Q08972 PUS2YGL063W 1113 nt12.64□□□□□ -0.39
NEW1Q08972 PIB2YGL023C 1908 nt12.62□□□□□ -0.39
NEW1Q08972 RTF1YGL244W 1677 nt12.62□□□□□ -0.39
NEW1Q08972 RRD1YIL153W 1182 nt12.57□□□□□ -0.4
NEW1Q08972 BOP3YNL042W 1191 nt12.56□□□□□ -0.4
NEW1Q08972 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.54□□□□□ -0.4
NEW1Q08972 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.54□□□□□ -0.4
NEW1Q08972 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.54□□□□□ -0.4
NEW1Q08972 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.54□□□□□ -0.4
NEW1Q08972 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.54□□□□□ -0.4
NEW1Q08972 DSK2YMR276W 1122 nt12.54□□□□□ -0.4
NEW1Q08972 TCD2YKL027W 1344 nt12.53□□□□□ -0.4
NEW1Q08972 IMP2'YIL154C 1041 nt12.51□□□□□ -0.41
NEW1Q08972 DED1YOR204W 1815 nt12.49□□□□□ -0.41
NEW1Q08972 YDR433WYDR433W 441 nt12.49□□□□□ -0.41
NEW1Q08972 YPR011CYPR011C 981 nt12.49□□□□□ -0.41
NEW1Q08972 PAC11YDR488C 1602 nt12.47□□□□□ -0.41
NEW1Q08972 MXR2YCL033C 507 nt12.45□□□□□ -0.42
NEW1Q08972 NCP1YHR042W 2076 nt12.42□□□□□ -0.42
NEW1Q08972 FMT1YBL013W 1206 nt12.42□□□□□ -0.42
NEW1Q08972 PTK1YKL198C 1989 nt12.41□□□□□ -0.42
NEW1Q08972 FMP52YER004W 696 nt12.41□□□□□ -0.42
NEW1Q08972 LCB1YMR296C 1677 nt12.41□□□□□ -0.42
NEW1Q08972 FMP45YDL222C 930 nt12.4□□□□□ -0.42
NEW1Q08972 PCM1YEL058W 1674 nt12.38□□□□□ -0.43
NEW1Q08972 CWP1YKL096W 720 nt12.38□□□□□ -0.43
NEW1Q08972 ADH2YMR303C 1047 nt12.35□□□□□ -0.43
NEW1Q08972 LPX1YOR084W 1164 nt12.35□□□□□ -0.43
NEW1Q08972 SIM1YIL123W 1431 nt12.34□□□□□ -0.43
NEW1Q08972 SNF6YHL025W 999 nt12.29□□□□□ -0.44
NEW1Q08972 ERV46YAL042W 1248 nt12.29□□□□□ -0.44
NEW1Q08972 YCL042WYCL042W 360 nt12.28□□□□□ -0.44
NEW1Q08972 YKR040CYKR040C 504 nt12.26□□□□□ -0.45
NEW1Q08972 YFL054CYFL054C 1941 nt12.25□□□□□ -0.45
NEW1Q08972 SOR2YDL246C 1074 nt12.22□□□□□ -0.45
NEW1Q08972 SOR1YJR159W 1074 nt12.22□□□□□ -0.45
NEW1Q08972 BIO4YNR057C 714 nt12.22□□□□□ -0.45
NEW1Q08972 FRD1YEL047C 1413 nt12.19□□□□□ -0.46
NEW1Q08972 LYS4YDR234W 2082 nt12.12□□□□□ -0.47
NEW1Q08972 SPT8YLR055C 1809 nt12.09□□□□□ -0.47
NEW1Q08972 YIH1YCR059C 777 nt12.09□□□□□ -0.47
NEW1Q08972 YLL053CYLL053C 459 nt12.07□□□□□ -0.48
NEW1Q08972 RNQ1YCL028W 1218 nt12.05□□□□□ -0.48
NEW1Q08972 ERF2YLR246W 1080 nt12.03□□□□□ -0.48
NEW1Q08972 SPP1YPL138C 1062 nt12.01□□□□□ -0.49
NEW1Q08972 DIC1YLR348C 897 nt12□□□□□ -0.49
NEW1Q08972 CRR1YLR213C 1269 nt11.99□□□□□ -0.49
NEW1Q08972 PTH1YHR189W 573 nt11.98□□□□□ -0.49
NEW1Q08972 ATF2YGR177C 1608 nt11.96□□□□□ -0.5
NEW1Q08972 FTR1YER145C 1215 nt11.94□□□□□ -0.5
NEW1Q08972 SWE1YJL187C 2460 nt11.92□□□□□ -0.5
NEW1Q08972 HEM12YDR047W 1089 nt11.92□□□□□ -0.5
NEW1Q08972 MIC10YCL057C-A 294 nt11.92□□□□□ -0.5
NEW1Q08972 TRM5YHR070W 1500 nt11.91□□□□□ -0.5
NEW1Q08972 GAL1YBR020W 1587 nt11.9□□□□□ -0.5
NEW1Q08972 YFL067WYFL067W 528 nt11.88□□□□□ -0.51
NEW1Q08972 DDR2YOL052C-A 186 nt11.88□□□□□ -0.51
NEW1Q08972 SNG1YGR197C 1644 nt11.86□□□□□ -0.51
NEW1Q08972 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.85□□□□□ -0.51
NEW1Q08972 YLR235CYLR235C 399 nt11.84□□□□□ -0.51
NEW1Q08972 NVJ2YPR091C 2313 nt11.83□□□□□ -0.52
NEW1Q08972 TIM23YNR017W 669 nt11.81□□□□□ -0.52
NEW1Q08972 YLR179CYLR179C 606 nt11.8□□□□□ -0.52
NEW1Q08972 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.78□□□□□ -0.52
NEW1Q08972 RAX1YOR301W 1308 nt11.78□□□□□ -0.52
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