Protein–RNA interactions for Protein: Q08905

FRE3, Ferric reductase transmembrane component 3, yeastyeast

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
FRE3Q08905 PTP1YDL230W 1008 nt11.03□□□□□ -0.64
FRE3Q08905 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.03□□□□□ -0.64
FRE3Q08905 RPP2AYOL039W 321 nt11.02□□□□□ -0.65
FRE3Q08905 SCC4YER147C 1875 nt11.01□□□□□ -0.65
FRE3Q08905 HOM6YJR139C 1080 nt11□□□□□ -0.65
FRE3Q08905 CCT6YDR188W 1641 nt10.97□□□□□ -0.65
FRE3Q08905 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.96□□□□□ -0.65
FRE3Q08905 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.96□□□□□ -0.65
FRE3Q08905 MNP1YGL068W 585 nt10.92□□□□□ -0.66
FRE3Q08905 IRC15YPL017C 1500 nt10.91□□□□□ -0.66
FRE3Q08905 GIS3YLR094C 1509 nt10.86□□□□□ -0.67
FRE3Q08905 RKM5YLR137W 1104 nt10.86□□□□□ -0.67
FRE3Q08905 PIB2YGL023C 1908 nt10.86□□□□□ -0.67
FRE3Q08905 SIS1YNL007C 1059 nt10.85□□□□□ -0.67
FRE3Q08905 YSC84YHR016C 1407 nt10.83□□□□□ -0.68
FRE3Q08905 RTF1YGL244W 1677 nt10.77□□□□□ -0.69
FRE3Q08905 YHL050CYHL050C 2094 nt10.74□□□□□ -0.69
FRE3Q08905 ART5YGR068C 1761 nt10.7□□□□□ -0.7
FRE3Q08905 GFD2YCL036W 1701 nt10.7□□□□□ -0.7
FRE3Q08905 YOL037CYOL037C 354 nt10.68□□□□□ -0.7
FRE3Q08905 NPL3YDR432W 1245 nt10.67□□□□□ -0.7
FRE3Q08905 RTS2YOR077W 699 nt10.67□□□□□ -0.7
FRE3Q08905 BOP3YNL042W 1191 nt10.66□□□□□ -0.7
FRE3Q08905 PET9YBL030C 957 nt10.65□□□□□ -0.7
FRE3Q08905 UME6YDR207C 2511 nt10.63□□□□□ -0.71
FRE3Q08905 RRT12YCR045C 1476 nt10.63□□□□□ -0.71
FRE3Q08905 YCH1YGR203W 447 nt10.63□□□□□ -0.71
FRE3Q08905 YOR139CYOR139C 393 nt10.62□□□□□ -0.71
FRE3Q08905 PTK1YKL198C 1989 nt10.6□□□□□ -0.71
FRE3Q08905 YJL152WYJL152W 360 nt10.6□□□□□ -0.71
FRE3Q08905 TIR4YOR009W 1464 nt10.58□□□□□ -0.72
FRE3Q08905 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.58□□□□□ -0.72
FRE3Q08905 CUE1YMR264W 612 nt10.57□□□□□ -0.72
FRE3Q08905 YNL195CYNL195C 786 nt10.57□□□□□ -0.72
FRE3Q08905 YMR057CYMR057C 372 nt10.55□□□□□ -0.72
FRE3Q08905 WHI5YOR083W 888 nt10.47□□□□□ -0.73
FRE3Q08905 YIL100WYIL100W 354 nt10.46□□□□□ -0.73
FRE3Q08905 BOR1YNL275W 1731 nt10.46□□□□□ -0.74
FRE3Q08905 YJL225CYJL225C 5277 nt10.45□□□□□ -0.74
FRE3Q08905 YLR281CYLR281C 468 nt10.45□□□□□ -0.74
FRE3Q08905 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.44□□□□□ -0.74
FRE3Q08905 NCP1YHR042W 2076 nt10.41□□□□□ -0.74
FRE3Q08905 YLR236CYLR236C 324 nt10.39□□□□□ -0.75
FRE3Q08905 YFL054CYFL054C 1941 nt10.39□□□□□ -0.75
FRE3Q08905 SPT8YLR055C 1809 nt10.33□□□□□ -0.76
FRE3Q08905 PUS2YGL063W 1113 nt10.33□□□□□ -0.76
FRE3Q08905 IDH1YNL037C 1083 nt10.31□□□□□ -0.76
FRE3Q08905 IMP2'YIL154C 1041 nt10.27□□□□□ -0.77
FRE3Q08905 GBP2YCL011C 1284 nt10.26□□□□□ -0.77
FRE3Q08905 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.25□□□□□ -0.77
FRE3Q08905 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.25□□□□□ -0.77
FRE3Q08905 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.25□□□□□ -0.77
FRE3Q08905 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.25□□□□□ -0.77
FRE3Q08905 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.25□□□□□ -0.77
FRE3Q08905 DSK2YMR276W 1122 nt10.22□□□□□ -0.77
FRE3Q08905 TCD2YKL027W 1344 nt10.17□□□□□ -0.78
FRE3Q08905 LCB1YMR296C 1677 nt10.16□□□□□ -0.78
FRE3Q08905 YDR433WYDR433W 441 nt10.14□□□□□ -0.79
FRE3Q08905 HSP60YLR259C 1719 nt10.13□□□□□ -0.79
FRE3Q08905 MCH5YOR306C 1566 nt10.12□□□□□ -0.79
FRE3Q08905 SWE1YJL187C 2460 nt10.11□□□□□ -0.79
FRE3Q08905 RRD1YIL153W 1182 nt10.11□□□□□ -0.79
FRE3Q08905 YPR011CYPR011C 981 nt10.09□□□□□ -0.79
FRE3Q08905 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.07□□□□□ -0.8
FRE3Q08905 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.07□□□□□ -0.8
FRE3Q08905 FMP45YDL222C 930 nt10.07□□□□□ -0.8
FRE3Q08905 ALG12YNR030W 1656 nt10.06□□□□□ -0.8
FRE3Q08905 FMP52YER004W 696 nt10.06□□□□□ -0.8
FRE3Q08905 DED1YOR204W 1815 nt10.05□□□□□ -0.8
FRE3Q08905 MXR2YCL033C 507 nt10.03□□□□□ -0.8
FRE3Q08905 YKR040CYKR040C 504 nt10□□□□□ -0.81
FRE3Q08905 GLK1YCL040W 1503 nt10□□□□□ -0.81
FRE3Q08905 ERV46YAL042W 1248 nt9.99□□□□□ -0.81
FRE3Q08905 LPX1YOR084W 1164 nt9.99□□□□□ -0.81
FRE3Q08905 YCL042WYCL042W 360 nt9.99□□□□□ -0.81
FRE3Q08905 CWP1YKL096W 720 nt9.98□□□□□ -0.81
FRE3Q08905 FMT1YBL013W 1206 nt9.98□□□□□ -0.81
FRE3Q08905 PCM1YEL058W 1674 nt9.98□□□□□ -0.81
FRE3Q08905 LYS4YDR234W 2082 nt9.96□□□□□ -0.81
FRE3Q08905 SNF6YHL025W 999 nt9.94□□□□□ -0.82
FRE3Q08905 ADH2YMR303C 1047 nt9.94□□□□□ -0.82
FRE3Q08905 SIM1YIL123W 1431 nt9.93□□□□□ -0.82
FRE3Q08905 SOR2YDL246C 1074 nt9.88□□□□□ -0.83
FRE3Q08905 SOR1YJR159W 1074 nt9.88□□□□□ -0.83
FRE3Q08905 FUR4YBR021W 1902 nt9.86□□□□□ -0.83
FRE3Q08905 FRD1YEL047C 1413 nt9.85□□□□□ -0.83
FRE3Q08905 BIO4YNR057C 714 nt9.84□□□□□ -0.83
FRE3Q08905 AAC1YMR056C 930 nt9.78□□□□□ -0.84
FRE3Q08905 NAR1YNL240C 1476 nt9.78□□□□□ -0.84
FRE3Q08905 PRP4YPR178W 1398 nt9.77□□□□□ -0.84
FRE3Q08905 YIH1YCR059C 777 nt9.76□□□□□ -0.85
FRE3Q08905 RNQ1YCL028W 1218 nt9.76□□□□□ -0.85
FRE3Q08905 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt9.74□□□□□ -0.85
FRE3Q08905 YEL076CYEL076C 651 nt9.74□□□□□ -0.85
FRE3Q08905 YLR464WYLR464W 651 nt9.74□□□□□ -0.85
FRE3Q08905 YLL053CYLL053C 459 nt9.73□□□□□ -0.85
FRE3Q08905 DPS1YLL018C 1674 nt9.72□□□□□ -0.85
FRE3Q08905 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt9.71□□□□□ -0.86
FRE3Q08905 ERF2YLR246W 1080 nt9.71□□□□□ -0.86
FRE3Q08905 SPP1YPL138C 1062 nt9.71□□□□□ -0.86
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