Protein–RNA interactions for Protein: Q08818

MSC6, Meiotic sister-chromatid recombination protein 6, mitochondrial, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSC6Q08818 YCH1YGR203W 447 nt13.74□□□□□ -0.21
MSC6Q08818 MRPL8YJL063C 717 nt13.7□□□□□ -0.22
MSC6Q08818 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.65□□□□□ -0.22
MSC6Q08818 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.65□□□□□ -0.22
MSC6Q08818 ALF1YNL148C 765 nt13.6□□□□□ -0.23
MSC6Q08818 YJL152WYJL152W 360 nt13.54□□□□□ -0.24
MSC6Q08818 LPX1YOR084W 1164 nt13.51□□□□□ -0.25
MSC6Q08818 ADO1YJR105W 1023 nt13.5□□□□□ -0.25
MSC6Q08818 ERV46YAL042W 1248 nt13.5□□□□□ -0.25
MSC6Q08818 IDH1YNL037C 1083 nt13.46□□□□□ -0.25
MSC6Q08818 YPS1YLR120C 1710 nt13.45□□□□□ -0.26
MSC6Q08818 YDR095CYDR095C 411 nt13.45□□□□□ -0.26
MSC6Q08818 SPP1YPL138C 1062 nt13.43□□□□□ -0.26
MSC6Q08818 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt13.42□□□□□ -0.26
MSC6Q08818 YEL076CYEL076C 651 nt13.42□□□□□ -0.26
MSC6Q08818 YLR464WYLR464W 651 nt13.42□□□□□ -0.26
MSC6Q08818 SIS1YNL007C 1059 nt13.41□□□□□ -0.26
MSC6Q08818 YDR433WYDR433W 441 nt13.37□□□□□ -0.27
MSC6Q08818 YKR040CYKR040C 504 nt13.36□□□□□ -0.27
MSC6Q08818 RTG1YOL067C 534 nt13.36□□□□□ -0.27
MSC6Q08818 UBX6YJL048C 1191 nt13.31□□□□□ -0.28
MSC6Q08818 TIR4YOR009W 1464 nt13.29□□□□□ -0.28
MSC6Q08818 GBP2YCL011C 1284 nt13.29□□□□□ -0.28
MSC6Q08818 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.28□□□□□ -0.28
MSC6Q08818 RPP2AYOL039W 321 nt13.21□□□□□ -0.29
MSC6Q08818 MXR2YCL033C 507 nt13.21□□□□□ -0.29
MSC6Q08818 CAC2YML102W 1407 nt13.18□□□□□ -0.3
MSC6Q08818 ART5YGR068C 1761 nt13.13□□□□□ -0.31
MSC6Q08818 HUA1YGR268C 597 nt13.12□□□□□ -0.31
MSC6Q08818 PET9YBL030C 957 nt13.12□□□□□ -0.31
MSC6Q08818 YMR057CYMR057C 372 nt13.11□□□□□ -0.31
MSC6Q08818 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt13.1□□□□□ -0.31
MSC6Q08818 PTP1YDL230W 1008 nt13.09□□□□□ -0.31
MSC6Q08818 TCD2YKL027W 1344 nt13.08□□□□□ -0.32
MSC6Q08818 YDR094WYDR094W 336 nt13.04□□□□□ -0.32
MSC6Q08818 GFD2YCL036W 1701 nt13.02□□□□□ -0.33
MSC6Q08818 MEP2YNL142W 1500 nt13□□□□□ -0.33
MSC6Q08818 FRD1YEL047C 1413 nt12.96□□□□□ -0.33
MSC6Q08818 DED1YOR204W 1815 nt12.95□□□□□ -0.34
MSC6Q08818 SPT5YML010W 3192 nt12.91□□□□□ -0.34
MSC6Q08818 RRD1YIL153W 1182 nt12.9□□□□□ -0.34
MSC6Q08818 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt12.89□□□□□ -0.35
MSC6Q08818 NME1NME1 340 nt12.89□□□□□ -0.35
MSC6Q08818 FPS1YLL043W 2010 nt12.86□□□□□ -0.35
MSC6Q08818 PTH1YHR189W 573 nt12.84□□□□□ -0.35
MSC6Q08818 YKL030WYKL030W 606 nt12.84□□□□□ -0.35
MSC6Q08818 YLR235CYLR235C 399 nt12.83□□□□□ -0.36
MSC6Q08818 YCL042WYCL042W 360 nt12.83□□□□□ -0.36
MSC6Q08818 SOR2YDL246C 1074 nt12.8□□□□□ -0.36
MSC6Q08818 SOR1YJR159W 1074 nt12.8□□□□□ -0.36
MSC6Q08818 DCW1YKL046C 1350 nt12.8□□□□□ -0.36
MSC6Q08818 FMT1YBL013W 1206 nt12.79□□□□□ -0.36
MSC6Q08818 RTS2YOR077W 699 nt12.77□□□□□ -0.37
MSC6Q08818 LCB1YMR296C 1677 nt12.73□□□□□ -0.37
MSC6Q08818 CUE1YMR264W 612 nt12.7□□□□□ -0.38
MSC6Q08818 IRC15YPL017C 1500 nt12.69□□□□□ -0.38
MSC6Q08818 EMI2YDR516C 1503 nt12.68□□□□□ -0.38
MSC6Q08818 FMP52YER004W 696 nt12.67□□□□□ -0.38
MSC6Q08818 YDL221WYDL221W 552 nt12.63□□□□□ -0.39
MSC6Q08818 CWP1YKL096W 720 nt12.6□□□□□ -0.39
MSC6Q08818 SSA4YER103W 1929 nt12.58□□□□□ -0.39
MSC6Q08818 GIS3YLR094C 1509 nt12.57□□□□□ -0.4
MSC6Q08818 YFR018CYFR018C 1092 nt12.57□□□□□ -0.4
MSC6Q08818 YMR090WYMR090W 684 nt12.57□□□□□ -0.4
MSC6Q08818 ADH2YMR303C 1047 nt12.56□□□□□ -0.4
MSC6Q08818 PAU16YKL224C 372 nt12.55□□□□□ -0.4
MSC6Q08818 TIM23YNR017W 669 nt12.55□□□□□ -0.4
MSC6Q08818 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt12.54□□□□□ -0.4
MSC6Q08818 YIL100WYIL100W 354 nt12.54□□□□□ -0.4
MSC6Q08818 RRT5YFR032C 870 nt12.5□□□□□ -0.41
MSC6Q08818 SBA1YKL117W 651 nt12.49□□□□□ -0.41
MSC6Q08818 DIC1YLR348C 897 nt12.49□□□□□ -0.41
MSC6Q08818 YLR179CYLR179C 606 nt12.44□□□□□ -0.42
MSC6Q08818 PCM1YEL058W 1674 nt12.43□□□□□ -0.42
MSC6Q08818 PRE6YOL038W 765 nt12.43□□□□□ -0.42
MSC6Q08818 YPR064WYPR064W 420 nt12.43□□□□□ -0.42
MSC6Q08818 SNF6YHL025W 999 nt12.42□□□□□ -0.42
MSC6Q08818 TAD3YLR316C 969 nt12.39□□□□□ -0.43
MSC6Q08818 SCC4YER147C 1875 nt12.39□□□□□ -0.43
MSC6Q08818 RNQ1YCL028W 1218 nt12.38□□□□□ -0.43
MSC6Q08818 SDH1YKL148C 1923 nt12.38□□□□□ -0.43
MSC6Q08818 YIH1YCR059C 777 nt12.34□□□□□ -0.43
MSC6Q08818 AHT1YHR093W 549 nt12.34□□□□□ -0.43
MSC6Q08818 WSC2YNL283C 1512 nt12.33□□□□□ -0.44
MSC6Q08818 YBR220CYBR220C 1683 nt12.26□□□□□ -0.45
MSC6Q08818 YFL066CYFL066C 1179 nt12.25□□□□□ -0.45
MSC6Q08818 PEX25YPL112C 1185 nt12.22□□□□□ -0.45
MSC6Q08818 YNL195CYNL195C 786 nt12.21□□□□□ -0.45
MSC6Q08818 YLL053CYLL053C 459 nt12.19□□□□□ -0.46
MSC6Q08818 AQY1YPR192W 918 nt12.19□□□□□ -0.46
MSC6Q08818 BDF1YLR399C 2061 nt12.18□□□□□ -0.46
MSC6Q08818 NAT4YMR069W 858 nt12.17□□□□□ -0.46
MSC6Q08818 YSP3YOR003W 1437 nt12.16□□□□□ -0.46
MSC6Q08818 YSC84YHR016C 1407 nt12.15□□□□□ -0.46
MSC6Q08818 FTR1YER145C 1215 nt12.15□□□□□ -0.46
MSC6Q08818 BDH1YAL060W 1149 nt12.15□□□□□ -0.46
MSC6Q08818 BIO4YNR057C 714 nt12.12□□□□□ -0.47
MSC6Q08818 GAL1YBR020W 1587 nt12.11□□□□□ -0.47
MSC6Q08818 YNL115CYNL115C 1935 nt12.11□□□□□ -0.47
MSC6Q08818 YLR415CYLR415C 339 nt12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 29.3 ms