Protein–RNA interactions for Protein: Q08438

VHS3, Phosphopantothenoylcysteine decarboxylase subunit VHS3, yeastyeast

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS3Q08438 MOT3YMR070W 1473 nt12.56□□□□□ -0.4
VHS3Q08438 IRC15YPL017C 1500 nt12.54□□□□□ -0.4
VHS3Q08438 SCC4YER147C 1875 nt12.54□□□□□ -0.4
VHS3Q08438 ART5YGR068C 1761 nt12.5□□□□□ -0.41
VHS3Q08438 GFD2YCL036W 1701 nt12.49□□□□□ -0.41
VHS3Q08438 PET9YBL030C 957 nt12.49□□□□□ -0.41
VHS3Q08438 GIS3YLR094C 1509 nt12.47□□□□□ -0.41
VHS3Q08438 MNP1YGL068W 585 nt12.47□□□□□ -0.41
VHS3Q08438 YKL097CYKL097C 411 nt12.47□□□□□ -0.41
VHS3Q08438 RKM5YLR137W 1104 nt12.47□□□□□ -0.41
VHS3Q08438 YCH1YGR203W 447 nt12.46□□□□□ -0.41
VHS3Q08438 YJL225CYJL225C 5277 nt12.44□□□□□ -0.42
VHS3Q08438 SEC11YIR022W 504 nt12.43□□□□□ -0.42
VHS3Q08438 RTS2YOR077W 699 nt12.35□□□□□ -0.43
VHS3Q08438 PCH2YBR186W 1695 nt12.35□□□□□ -0.43
VHS3Q08438 TIR4YOR009W 1464 nt12.33□□□□□ -0.44
VHS3Q08438 CUE1YMR264W 612 nt12.32□□□□□ -0.44
VHS3Q08438 PAC11YDR488C 1602 nt12.32□□□□□ -0.44
VHS3Q08438 GUT2YIL155C 1950 nt12.28□□□□□ -0.44
VHS3Q08438 YMR057CYMR057C 372 nt12.25□□□□□ -0.45
VHS3Q08438 YSC84YHR016C 1407 nt12.25□□□□□ -0.45
VHS3Q08438 NPL3YDR432W 1245 nt12.22□□□□□ -0.45
VHS3Q08438 YOL037CYOL037C 354 nt12.22□□□□□ -0.45
VHS3Q08438 YIL100WYIL100W 354 nt12.19□□□□□ -0.46
VHS3Q08438 YNL195CYNL195C 786 nt12.19□□□□□ -0.46
VHS3Q08438 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.18□□□□□ -0.46
VHS3Q08438 YHL050CYHL050C 2094 nt12.16□□□□□ -0.46
VHS3Q08438 YJL152WYJL152W 360 nt12.15□□□□□ -0.46
VHS3Q08438 YLR236CYLR236C 324 nt12.15□□□□□ -0.46
VHS3Q08438 FPS1YLL043W 2010 nt12.15□□□□□ -0.47
VHS3Q08438 RRT12YCR045C 1476 nt12.12□□□□□ -0.47
VHS3Q08438 RDN37-1RDN37-1 5354 nt12.1□□□□□ -0.47
VHS3Q08438 RDN37-2RDN37-2 5354 nt12.1□□□□□ -0.47
VHS3Q08438 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.08□□□□□ -0.48
VHS3Q08438 PIB2YGL023C 1908 nt12.04□□□□□ -0.48
VHS3Q08438 RTF1YGL244W 1677 nt12.03□□□□□ -0.48
VHS3Q08438 NVJ2YPR091C 2313 nt12.02□□□□□ -0.49
VHS3Q08438 BOP3YNL042W 1191 nt12.01□□□□□ -0.49
VHS3Q08438 YOR139CYOR139C 393 nt11.99□□□□□ -0.49
VHS3Q08438 WHI5YOR083W 888 nt11.96□□□□□ -0.49
VHS3Q08438 YLR281CYLR281C 468 nt11.94□□□□□ -0.5
VHS3Q08438 IDH1YNL037C 1083 nt11.86□□□□□ -0.51
VHS3Q08438 PTK1YKL198C 1989 nt11.83□□□□□ -0.52
VHS3Q08438 NCP1YHR042W 2076 nt11.82□□□□□ -0.52
VHS3Q08438 IMP2'YIL154C 1041 nt11.79□□□□□ -0.52
VHS3Q08438 GBP2YCL011C 1284 nt11.79□□□□□ -0.52
VHS3Q08438 FMP52YER004W 696 nt11.77□□□□□ -0.53
VHS3Q08438 RRD1YIL153W 1182 nt11.77□□□□□ -0.53
VHS3Q08438 TCD2YKL027W 1344 nt11.74□□□□□ -0.53
VHS3Q08438 LCB1YMR296C 1677 nt11.69□□□□□ -0.54
VHS3Q08438 PUS2YGL063W 1113 nt11.69□□□□□ -0.54
VHS3Q08438 DSK2YMR276W 1122 nt11.67□□□□□ -0.54
VHS3Q08438 DED1YOR204W 1815 nt11.67□□□□□ -0.54
VHS3Q08438 PCM1YEL058W 1674 nt11.65□□□□□ -0.55
VHS3Q08438 YFL054CYFL054C 1941 nt11.62□□□□□ -0.55
VHS3Q08438 SIM1YIL123W 1431 nt11.6□□□□□ -0.55
VHS3Q08438 FMT1YBL013W 1206 nt11.59□□□□□ -0.55
VHS3Q08438 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.58□□□□□ -0.56
VHS3Q08438 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.58□□□□□ -0.56
VHS3Q08438 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.58□□□□□ -0.56
VHS3Q08438 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.58□□□□□ -0.56
VHS3Q08438 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.58□□□□□ -0.56
VHS3Q08438 YDR433WYDR433W 441 nt11.57□□□□□ -0.56
VHS3Q08438 SNF6YHL025W 999 nt11.54□□□□□ -0.56
VHS3Q08438 CWP1YKL096W 720 nt11.54□□□□□ -0.56
VHS3Q08438 SPT8YLR055C 1809 nt11.53□□□□□ -0.56
VHS3Q08438 FMP45YDL222C 930 nt11.53□□□□□ -0.56
VHS3Q08438 ADH2YMR303C 1047 nt11.53□□□□□ -0.56
VHS3Q08438 SOR2YDL246C 1074 nt11.5□□□□□ -0.57
VHS3Q08438 SOR1YJR159W 1074 nt11.5□□□□□ -0.57
VHS3Q08438 YPR011CYPR011C 981 nt11.5□□□□□ -0.57
VHS3Q08438 BIO4YNR057C 714 nt11.49□□□□□ -0.57
VHS3Q08438 YCL042WYCL042W 360 nt11.49□□□□□ -0.57
VHS3Q08438 ERV46YAL042W 1248 nt11.48□□□□□ -0.57
VHS3Q08438 MXR2YCL033C 507 nt11.48□□□□□ -0.57
VHS3Q08438 LYS4YDR234W 2082 nt11.47□□□□□ -0.57
VHS3Q08438 YKR040CYKR040C 504 nt11.46□□□□□ -0.57
VHS3Q08438 ERF2YLR246W 1080 nt11.41□□□□□ -0.58
VHS3Q08438 YIH1YCR059C 777 nt11.4□□□□□ -0.58
VHS3Q08438 LPX1YOR084W 1164 nt11.4□□□□□ -0.58
VHS3Q08438 FRD1YEL047C 1413 nt11.36□□□□□ -0.59
VHS3Q08438 RNQ1YCL028W 1218 nt11.36□□□□□ -0.59
VHS3Q08438 CRR1YLR213C 1269 nt11.34□□□□□ -0.59
VHS3Q08438 SWE1YJL187C 2460 nt11.34□□□□□ -0.59
VHS3Q08438 YLL053CYLL053C 459 nt11.33□□□□□ -0.6
VHS3Q08438 BOR1YNL275W 1731 nt11.26□□□□□ -0.61
VHS3Q08438 YFL067WYFL067W 528 nt11.26□□□□□ -0.61
VHS3Q08438 HEM12YDR047W 1089 nt11.24□□□□□ -0.61
VHS3Q08438 FTR1YER145C 1215 nt11.23□□□□□ -0.61
VHS3Q08438 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.23□□□□□ -0.61
VHS3Q08438 ATF2YGR177C 1608 nt11.22□□□□□ -0.61
VHS3Q08438 DIC1YLR348C 897 nt11.21□□□□□ -0.61
VHS3Q08438 RAX1YOR301W 1308 nt11.17□□□□□ -0.62
VHS3Q08438 GAL1YBR020W 1587 nt11.17□□□□□ -0.62
VHS3Q08438 DDR2YOL052C-A 186 nt11.17□□□□□ -0.62
VHS3Q08438 SNG1YGR197C 1644 nt11.17□□□□□ -0.62
VHS3Q08438 MIC10YCL057C-A 294 nt11.16□□□□□ -0.62
VHS3Q08438 TRM5YHR070W 1500 nt11.15□□□□□ -0.62
VHS3Q08438 AQY1YPR192W 918 nt11.15□□□□□ -0.62
VHS3Q08438 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.12□□□□□ -0.63
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