Protein–RNA interactions for Protein: Q08004

BUD20, Bud site selection protein 20, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BUD20Q08004 DCW1YKL046C 1350 nt12.59□□□□□ -0.39
BUD20Q08004 SSA4YER103W 1929 nt12.58□□□□□ -0.39
BUD20Q08004 YOL037CYOL037C 354 nt12.55□□□□□ -0.4
BUD20Q08004 NPL3YDR432W 1245 nt12.54□□□□□ -0.4
BUD20Q08004 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.53□□□□□ -0.4
BUD20Q08004 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.53□□□□□ -0.4
BUD20Q08004 PTP1YDL230W 1008 nt12.52□□□□□ -0.41
BUD20Q08004 SIS1YNL007C 1059 nt12.51□□□□□ -0.41
BUD20Q08004 RPP2AYOL039W 321 nt12.51□□□□□ -0.41
BUD20Q08004 BUR6YER159C 429 nt12.46□□□□□ -0.41
BUD20Q08004 CAC2YML102W 1407 nt12.44□□□□□ -0.42
BUD20Q08004 BMT5YIL096C 1011 nt12.42□□□□□ -0.42
BUD20Q08004 EMI2YDR516C 1503 nt12.4□□□□□ -0.42
BUD20Q08004 ART5YGR068C 1761 nt12.35□□□□□ -0.43
BUD20Q08004 Q0010Q0010 387 nt12.34□□□□□ -0.43
BUD20Q08004 TIR4YOR009W 1464 nt12.32□□□□□ -0.44
BUD20Q08004 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.31□□□□□ -0.44
BUD20Q08004 GFD2YCL036W 1701 nt12.31□□□□□ -0.44
BUD20Q08004 YDL221WYDL221W 552 nt12.3□□□□□ -0.44
BUD20Q08004 YLR281CYLR281C 468 nt12.3□□□□□ -0.44
BUD20Q08004 WHI5YOR083W 888 nt12.28□□□□□ -0.44
BUD20Q08004 YMR090WYMR090W 684 nt12.25□□□□□ -0.45
BUD20Q08004 IRC15YPL017C 1500 nt12.25□□□□□ -0.45
BUD20Q08004 PET9YBL030C 957 nt12.24□□□□□ -0.45
BUD20Q08004 Q0144Q0144 330 nt12.23□□□□□ -0.45
BUD20Q08004 YCH1YGR203W 447 nt12.21□□□□□ -0.45
BUD20Q08004 YJL152WYJL152W 360 nt12.21□□□□□ -0.45
BUD20Q08004 YBR220CYBR220C 1683 nt12.2□□□□□ -0.46
BUD20Q08004 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.2□□□□□ -0.46
BUD20Q08004 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.2□□□□□ -0.46
BUD20Q08004 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.2□□□□□ -0.46
BUD20Q08004 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.2□□□□□ -0.46
BUD20Q08004 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.2□□□□□ -0.46
BUD20Q08004 YMR057CYMR057C 372 nt12.18□□□□□ -0.46
BUD20Q08004 RTS2YOR077W 699 nt12.18□□□□□ -0.46
BUD20Q08004 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt12.17□□□□□ -0.46
BUD20Q08004 SDH1YKL148C 1923 nt12.16□□□□□ -0.46
BUD20Q08004 SEM1YDR363W-A 270 nt12.15□□□□□ -0.46
BUD20Q08004 PUS2YGL063W 1113 nt12.15□□□□□ -0.46
BUD20Q08004 GIS3YLR094C 1509 nt12.15□□□□□ -0.46
BUD20Q08004 BDF1YLR399C 2061 nt12.11□□□□□ -0.47
BUD20Q08004 SRN2YLR119W 642 nt12.11□□□□□ -0.47
BUD20Q08004 SCC4YER147C 1875 nt12.08□□□□□ -0.48
BUD20Q08004 ARA2YMR041C 1008 nt12.07□□□□□ -0.48
BUD20Q08004 FPS1YLL043W 2010 nt12.04□□□□□ -0.48
BUD20Q08004 YPR011CYPR011C 981 nt12.04□□□□□ -0.48
BUD20Q08004 CUE1YMR264W 612 nt12.03□□□□□ -0.48
BUD20Q08004 YLR236CYLR236C 324 nt12.02□□□□□ -0.49
BUD20Q08004 DSK2YMR276W 1122 nt12□□□□□ -0.49
BUD20Q08004 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.98□□□□□ -0.49
BUD20Q08004 IMP2'YIL154C 1041 nt11.95□□□□□ -0.5
BUD20Q08004 IDH1YNL037C 1083 nt11.95□□□□□ -0.5
BUD20Q08004 TAT1YBR069C 1860 nt11.94□□□□□ -0.5
BUD20Q08004 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt11.92□□□□□ -0.5
BUD20Q08004 GBP2YCL011C 1284 nt11.9□□□□□ -0.5
BUD20Q08004 YLR122CYLR122C 378 nt11.88□□□□□ -0.51
BUD20Q08004 FMP45YDL222C 930 nt11.85□□□□□ -0.51
BUD20Q08004 YIL100WYIL100W 354 nt11.85□□□□□ -0.51
BUD20Q08004 RRD1YIL153W 1182 nt11.82□□□□□ -0.52
BUD20Q08004 ARP10YDR106W 855 nt11.81□□□□□ -0.52
BUD20Q08004 LPX1YOR084W 1164 nt11.81□□□□□ -0.52
BUD20Q08004 YSC84YHR016C 1407 nt11.8□□□□□ -0.52
BUD20Q08004 YDR433WYDR433W 441 nt11.8□□□□□ -0.52
BUD20Q08004 DED1YOR204W 1815 nt11.79□□□□□ -0.52
BUD20Q08004 RRT12YCR045C 1476 nt11.79□□□□□ -0.52
BUD20Q08004 ERV46YAL042W 1248 nt11.78□□□□□ -0.52
BUD20Q08004 ABZ2YMR289W 1125 nt11.78□□□□□ -0.52
BUD20Q08004 MXR2YCL033C 507 nt11.78□□□□□ -0.52
BUD20Q08004 YHL050CYHL050C 2094 nt11.77□□□□□ -0.53
BUD20Q08004 TCD2YKL027W 1344 nt11.76□□□□□ -0.53
BUD20Q08004 YCR099CYCR099C 468 nt11.73□□□□□ -0.53
BUD20Q08004 MET8YBR213W 825 nt11.72□□□□□ -0.53
BUD20Q08004 SEC11YIR022W 504 nt11.71□□□□□ -0.53
BUD20Q08004 FMT1YBL013W 1206 nt11.7□□□□□ -0.54
BUD20Q08004 YNL195CYNL195C 786 nt11.7□□□□□ -0.54
BUD20Q08004 YKR040CYKR040C 504 nt11.69□□□□□ -0.54
BUD20Q08004 PCH2YBR186W 1695 nt11.68□□□□□ -0.54
BUD20Q08004 AI3Q0060 1248 nt11.67□□□□□ -0.54
BUD20Q08004 Q0142Q0142 177 nt11.67□□□□□ -0.54
BUD20Q08004 GUT2YIL155C 1950 nt11.64□□□□□ -0.55
BUD20Q08004 CLB6YGR109C 1143 nt11.62□□□□□ -0.55
BUD20Q08004 FMP52YER004W 696 nt11.61□□□□□ -0.55
BUD20Q08004 TOM20YGR082W 552 nt11.61□□□□□ -0.55
BUD20Q08004 PET20YPL159C 762 nt11.6□□□□□ -0.55
BUD20Q08004 SPP1YPL138C 1062 nt11.58□□□□□ -0.56
BUD20Q08004 FRD1YEL047C 1413 nt11.58□□□□□ -0.56
BUD20Q08004 UTP6YDR449C 1323 nt11.58□□□□□ -0.56
BUD20Q08004 SOR2YDL246C 1074 nt11.55□□□□□ -0.56
BUD20Q08004 SOR1YJR159W 1074 nt11.55□□□□□ -0.56
BUD20Q08004 CWP1YKL096W 720 nt11.55□□□□□ -0.56
BUD20Q08004 ADH2YMR303C 1047 nt11.55□□□□□ -0.56
BUD20Q08004 PCM1YEL058W 1674 nt11.54□□□□□ -0.56
BUD20Q08004 PIB2YGL023C 1908 nt11.51□□□□□ -0.57
BUD20Q08004 YCL042WYCL042W 360 nt11.51□□□□□ -0.57
BUD20Q08004 Q0017Q0017 162 nt11.47□□□□□ -0.57
BUD20Q08004 AI5_BETAQ0075 1065 nt11.46□□□□□ -0.57
BUD20Q08004 LCP5YER127W 1074 nt11.46□□□□□ -0.57
BUD20Q08004 snR78snR78 87 nt11.45□□□□□ -0.58
BUD20Q08004 SKG1YKR100C 1068 nt11.45□□□□□ -0.58
BUD20Q08004 LCB1YMR296C 1677 nt11.45□□□□□ -0.58
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