Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
F13bQ07968 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
F13bQ07968 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
F13bQ07968 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
F13bQ07968 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
F13bQ07968 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
F13bQ07968 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
F13bQ07968 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
F13bQ07968 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
F13bQ07968 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
F13bQ07968 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
F13bQ07968 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
F13bQ07968 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
F13bQ07968 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
F13bQ07968 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
F13bQ07968 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
F13bQ07968 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
F13bQ07968 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
F13bQ07968 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
F13bQ07968 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
F13bQ07968 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
F13bQ07968 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
F13bQ07968 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
F13bQ07968 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
F13bQ07968 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
F13bQ07968 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
F13bQ07968 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
F13bQ07968 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
F13bQ07968 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
F13bQ07968 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
F13bQ07968 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
F13bQ07968 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
F13bQ07968 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
F13bQ07968 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
F13bQ07968 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
F13bQ07968 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
F13bQ07968 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
F13bQ07968 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
F13bQ07968 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
F13bQ07968 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
F13bQ07968 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
F13bQ07968 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
F13bQ07968 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
F13bQ07968 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
F13bQ07968 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
F13bQ07968 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
F13bQ07968 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
F13bQ07968 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
F13bQ07968 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
F13bQ07968 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
F13bQ07968 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
F13bQ07968 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
F13bQ07968 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
F13bQ07968 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
F13bQ07968 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
F13bQ07968 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
F13bQ07968 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
F13bQ07968 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
F13bQ07968 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
F13bQ07968 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
F13bQ07968 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
F13bQ07968 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
F13bQ07968 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
F13bQ07968 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
F13bQ07968 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
F13bQ07968 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
F13bQ07968 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
F13bQ07968 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
F13bQ07968 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
F13bQ07968 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
F13bQ07968 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
F13bQ07968 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
F13bQ07968 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
F13bQ07968 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
F13bQ07968 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
F13bQ07968 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
F13bQ07968 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
F13bQ07968 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
F13bQ07968 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
F13bQ07968 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
F13bQ07968 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
F13bQ07968 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
F13bQ07968 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
F13bQ07968 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
F13bQ07968 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
F13bQ07968 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
F13bQ07968 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
F13bQ07968 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
F13bQ07968 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
F13bQ07968 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
F13bQ07968 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
F13bQ07968 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
F13bQ07968 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
F13bQ07968 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
F13bQ07968 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
F13bQ07968 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
F13bQ07968 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
F13bQ07968 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
F13bQ07968 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
F13bQ07968 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms