Protein–RNA interactions for Protein: Q07657

SHS1, Seventh homolog of septin 1, yeastyeast

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHS1Q07657 SIS1YNL007C 1059 nt13.22□□□□□ -0.29
SHS1Q07657 MEP2YNL142W 1500 nt13.16□□□□□ -0.3
SHS1Q07657 DSK2YMR276W 1122 nt13.15□□□□□ -0.3
SHS1Q07657 YPR011CYPR011C 981 nt13.15□□□□□ -0.3
SHS1Q07657 YLR236CYLR236C 324 nt13.13□□□□□ -0.31
SHS1Q07657 IMP2'YIL154C 1041 nt13.12□□□□□ -0.31
SHS1Q07657 RPP2AYOL039W 321 nt13.11□□□□□ -0.31
SHS1Q07657 PTP1YDL230W 1008 nt13.09□□□□□ -0.31
SHS1Q07657 MOT3YMR070W 1473 nt13.08□□□□□ -0.32
SHS1Q07657 TIR4YOR009W 1464 nt13.06□□□□□ -0.32
SHS1Q07657 YCH1YGR203W 447 nt13.06□□□□□ -0.32
SHS1Q07657 YJL152WYJL152W 360 nt13.06□□□□□ -0.32
SHS1Q07657 FMP45YDL222C 930 nt13.04□□□□□ -0.32
SHS1Q07657 ART5YGR068C 1761 nt12.97□□□□□ -0.33
SHS1Q07657 DCW1YKL046C 1350 nt12.96□□□□□ -0.33
SHS1Q07657 PET9YBL030C 957 nt12.94□□□□□ -0.34
SHS1Q07657 IDH1YNL037C 1083 nt12.94□□□□□ -0.34
SHS1Q07657 GFD2YCL036W 1701 nt12.93□□□□□ -0.34
SHS1Q07657 CAC2YML102W 1407 nt12.92□□□□□ -0.34
SHS1Q07657 ERV46YAL042W 1248 nt12.89□□□□□ -0.35
SHS1Q07657 LPX1YOR084W 1164 nt12.88□□□□□ -0.35
SHS1Q07657 YMR057CYMR057C 372 nt12.86□□□□□ -0.35
SHS1Q07657 EMI2YDR516C 1503 nt12.81□□□□□ -0.36
SHS1Q07657 GBP2YCL011C 1284 nt12.8□□□□□ -0.36
SHS1Q07657 YDR433WYDR433W 441 nt12.79□□□□□ -0.36
SHS1Q07657 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.76□□□□□ -0.37
SHS1Q07657 YDL221WYDL221W 552 nt12.74□□□□□ -0.37
SHS1Q07657 YKR040CYKR040C 504 nt12.74□□□□□ -0.37
SHS1Q07657 IRC15YPL017C 1500 nt12.73□□□□□ -0.37
SHS1Q07657 RTS2YOR077W 699 nt12.72□□□□□ -0.37
SHS1Q07657 FPS1YLL043W 2010 nt12.71□□□□□ -0.38
SHS1Q07657 SPP1YPL138C 1062 nt12.7□□□□□ -0.38
SHS1Q07657 MXR2YCL033C 507 nt12.7□□□□□ -0.38
SHS1Q07657 SSA4YER103W 1929 nt12.67□□□□□ -0.38
SHS1Q07657 YMR090WYMR090W 684 nt12.66□□□□□ -0.38
SHS1Q07657 MRPL8YJL063C 717 nt12.64□□□□□ -0.39
SHS1Q07657 TCD2YKL027W 1344 nt12.63□□□□□ -0.39
SHS1Q07657 CUE1YMR264W 612 nt12.63□□□□□ -0.39
SHS1Q07657 GIS3YLR094C 1509 nt12.62□□□□□ -0.39
SHS1Q07657 RRD1YIL153W 1182 nt12.61□□□□□ -0.39
SHS1Q07657 DED1YOR204W 1815 nt12.6□□□□□ -0.39
SHS1Q07657 RTG1YOL067C 534 nt12.55□□□□□ -0.4
SHS1Q07657 SDH1YKL148C 1923 nt12.54□□□□□ -0.4
SHS1Q07657 YBR220CYBR220C 1683 nt12.51□□□□□ -0.41
SHS1Q07657 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.5□□□□□ -0.41
SHS1Q07657 YEL076CYEL076C 651 nt12.5□□□□□ -0.41
SHS1Q07657 YLR464WYLR464W 651 nt12.5□□□□□ -0.41
SHS1Q07657 FRD1YEL047C 1413 nt12.5□□□□□ -0.41
SHS1Q07657 SCC4YER147C 1875 nt12.49□□□□□ -0.41
SHS1Q07657 FMT1YBL013W 1206 nt12.48□□□□□ -0.41
SHS1Q07657 ADO1YJR105W 1023 nt12.45□□□□□ -0.42
SHS1Q07657 SOR2YDL246C 1074 nt12.44□□□□□ -0.42
SHS1Q07657 SOR1YJR159W 1074 nt12.44□□□□□ -0.42
SHS1Q07657 YIL100WYIL100W 354 nt12.43□□□□□ -0.42
SHS1Q07657 FMP52YER004W 696 nt12.39□□□□□ -0.43
SHS1Q07657 YCL042WYCL042W 360 nt12.38□□□□□ -0.43
SHS1Q07657 PTH1YHR189W 573 nt12.29□□□□□ -0.44
SHS1Q07657 CWP1YKL096W 720 nt12.28□□□□□ -0.44
SHS1Q07657 ADH2YMR303C 1047 nt12.27□□□□□ -0.45
SHS1Q07657 HUA1YGR268C 597 nt12.26□□□□□ -0.45
SHS1Q07657 YLR235CYLR235C 399 nt12.25□□□□□ -0.45
SHS1Q07657 YKL030WYKL030W 606 nt12.22□□□□□ -0.45
SHS1Q07657 PCM1YEL058W 1674 nt12.2□□□□□ -0.46
SHS1Q07657 UBX6YJL048C 1191 nt12.17□□□□□ -0.46
SHS1Q07657 YNL195CYNL195C 786 nt12.17□□□□□ -0.46
SHS1Q07657 LCB1YMR296C 1677 nt12.16□□□□□ -0.46
SHS1Q07657 RRT12YCR045C 1476 nt12.16□□□□□ -0.46
SHS1Q07657 BDF1YLR399C 2061 nt12.16□□□□□ -0.46
SHS1Q07657 SNF6YHL025W 999 nt12.15□□□□□ -0.46
SHS1Q07657 YSC84YHR016C 1407 nt12.14□□□□□ -0.47
SHS1Q07657 YHL050CYHL050C 2094 nt12.12□□□□□ -0.47
SHS1Q07657 DIC1YLR348C 897 nt12.11□□□□□ -0.47
SHS1Q07657 YIH1YCR059C 777 nt12.08□□□□□ -0.48
SHS1Q07657 TIM23YNR017W 669 nt12.07□□□□□ -0.48
SHS1Q07657 RNQ1YCL028W 1218 nt12.07□□□□□ -0.48
SHS1Q07657 YDR094WYDR094W 336 nt12.06□□□□□ -0.48
SHS1Q07657 TAT1YBR069C 1860 nt12.02□□□□□ -0.48
SHS1Q07657 SEC11YIR022W 504 nt12.01□□□□□ -0.49
SHS1Q07657 YLR179CYLR179C 606 nt11.98□□□□□ -0.49
SHS1Q07657 BIO4YNR057C 714 nt11.98□□□□□ -0.49
SHS1Q07657 SIM1YIL123W 1431 nt11.94□□□□□ -0.5
SHS1Q07657 YLL053CYLL053C 459 nt11.94□□□□□ -0.5
SHS1Q07657 WSC2YNL283C 1512 nt11.93□□□□□ -0.5
SHS1Q07657 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.93□□□□□ -0.5
SHS1Q07657 AHT1YHR093W 549 nt11.91□□□□□ -0.5
SHS1Q07657 YPR064WYPR064W 420 nt11.91□□□□□ -0.5
SHS1Q07657 PCH2YBR186W 1695 nt11.91□□□□□ -0.5
SHS1Q07657 FTR1YER145C 1215 nt11.88□□□□□ -0.51
SHS1Q07657 TAD3YLR316C 969 nt11.86□□□□□ -0.51
SHS1Q07657 AQY1YPR192W 918 nt11.85□□□□□ -0.51
SHS1Q07657 GAL1YBR020W 1587 nt11.84□□□□□ -0.51
SHS1Q07657 GUT2YIL155C 1950 nt11.83□□□□□ -0.52
SHS1Q07657 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.82□□□□□ -0.52
SHS1Q07657 YFR018CYFR018C 1092 nt11.82□□□□□ -0.52
SHS1Q07657 NCP1YHR042W 2076 nt11.82□□□□□ -0.52
SHS1Q07657 TRM5YHR070W 1500 nt11.8□□□□□ -0.52
SHS1Q07657 ATF2YGR177C 1608 nt11.76□□□□□ -0.53
SHS1Q07657 ERF2YLR246W 1080 nt11.76□□□□□ -0.53
SHS1Q07657 SPC25YER018C 666 nt11.74□□□□□ -0.53
SHS1Q07657 CRR1YLR213C 1269 nt11.74□□□□□ -0.53
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