Protein–RNA interactions for Protein: Q07084

SSK1, Osmolarity two-component system protein SSK1, yeastyeast

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Length 712 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK1Q07084 SCC4YER147C 1875 nt11.02□□□□□ -0.65
SSK1Q07084 HOM6YJR139C 1080 nt11□□□□□ -0.65
SSK1Q07084 YGR021WYGR021W 873 nt10.99□□□□□ -0.65
SSK1Q07084 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.99□□□□□ -0.65
SSK1Q07084 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.99□□□□□ -0.65
SSK1Q07084 PCH2YBR186W 1695 nt10.95□□□□□ -0.66
SSK1Q07084 GFD2YCL036W 1701 nt10.95□□□□□ -0.66
SSK1Q07084 GIS3YLR094C 1509 nt10.94□□□□□ -0.66
SSK1Q07084 SEC11YIR022W 504 nt10.94□□□□□ -0.66
SSK1Q07084 ART5YGR068C 1761 nt10.93□□□□□ -0.66
SSK1Q07084 YOR139CYOR139C 393 nt10.93□□□□□ -0.66
SSK1Q07084 GUT2YIL155C 1950 nt10.89□□□□□ -0.67
SSK1Q07084 MNP1YGL068W 585 nt10.89□□□□□ -0.67
SSK1Q07084 PET9YBL030C 957 nt10.85□□□□□ -0.67
SSK1Q07084 RTS2YOR077W 699 nt10.85□□□□□ -0.67
SSK1Q07084 YSC84YHR016C 1407 nt10.83□□□□□ -0.68
SSK1Q07084 RKM5YLR137W 1104 nt10.82□□□□□ -0.68
SSK1Q07084 TIR4YOR009W 1464 nt10.79□□□□□ -0.68
SSK1Q07084 FPS1YLL043W 2010 nt10.78□□□□□ -0.68
SSK1Q07084 PIB2YGL023C 1908 nt10.78□□□□□ -0.68
SSK1Q07084 YCH1YGR203W 447 nt10.76□□□□□ -0.69
SSK1Q07084 CUE1YMR264W 612 nt10.75□□□□□ -0.69
SSK1Q07084 YHL050CYHL050C 2094 nt10.75□□□□□ -0.69
SSK1Q07084 NPL3YDR432W 1245 nt10.73□□□□□ -0.69
SSK1Q07084 YOL037CYOL037C 354 nt10.69□□□□□ -0.7
SSK1Q07084 YMR057CYMR057C 372 nt10.67□□□□□ -0.7
SSK1Q07084 YNL195CYNL195C 786 nt10.67□□□□□ -0.7
SSK1Q07084 RTF1YGL244W 1677 nt10.66□□□□□ -0.7
SSK1Q07084 RRT12YCR045C 1476 nt10.66□□□□□ -0.7
SSK1Q07084 YIL100WYIL100W 354 nt10.63□□□□□ -0.71
SSK1Q07084 BOP3YNL042W 1191 nt10.58□□□□□ -0.72
SSK1Q07084 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.55□□□□□ -0.72
SSK1Q07084 MOT3YMR070W 1473 nt10.52□□□□□ -0.73
SSK1Q07084 YLR236CYLR236C 324 nt10.51□□□□□ -0.73
SSK1Q07084 NCP1YHR042W 2076 nt10.5□□□□□ -0.73
SSK1Q07084 PTK1YKL198C 1989 nt10.49□□□□□ -0.73
SSK1Q07084 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.49□□□□□ -0.73
SSK1Q07084 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.49□□□□□ -0.73
SSK1Q07084 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.49□□□□□ -0.73
SSK1Q07084 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.49□□□□□ -0.73
SSK1Q07084 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.49□□□□□ -0.73
SSK1Q07084 YLR281CYLR281C 468 nt10.47□□□□□ -0.73
SSK1Q07084 YJL152WYJL152W 360 nt10.45□□□□□ -0.74
SSK1Q07084 WHI5YOR083W 888 nt10.41□□□□□ -0.74
SSK1Q07084 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.41□□□□□ -0.74
SSK1Q07084 YJL225CYJL225C 5277 nt10.4□□□□□ -0.74
SSK1Q07084 PUS2YGL063W 1113 nt10.34□□□□□ -0.75
SSK1Q07084 YFL054CYFL054C 1941 nt10.33□□□□□ -0.76
SSK1Q07084 RRD1YIL153W 1182 nt10.32□□□□□ -0.76
SSK1Q07084 LCB1YMR296C 1677 nt10.31□□□□□ -0.76
SSK1Q07084 UME6YDR207C 2511 nt10.26□□□□□ -0.77
SSK1Q07084 DED1YOR204W 1815 nt10.26□□□□□ -0.77
SSK1Q07084 YPR011CYPR011C 981 nt10.25□□□□□ -0.77
SSK1Q07084 SPT8YLR055C 1809 nt10.22□□□□□ -0.77
SSK1Q07084 FMP52YER004W 696 nt10.21□□□□□ -0.77
SSK1Q07084 FMT1YBL013W 1206 nt10.2□□□□□ -0.78
SSK1Q07084 BOR1YNL275W 1731 nt10.19□□□□□ -0.78
SSK1Q07084 DSK2YMR276W 1122 nt10.19□□□□□ -0.78
SSK1Q07084 IDH1YNL037C 1083 nt10.19□□□□□ -0.78
SSK1Q07084 GBP2YCL011C 1284 nt10.19□□□□□ -0.78
SSK1Q07084 PCM1YEL058W 1674 nt10.15□□□□□ -0.78
SSK1Q07084 LYS4YDR234W 2082 nt10.15□□□□□ -0.78
SSK1Q07084 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.14□□□□□ -0.79
SSK1Q07084 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.14□□□□□ -0.79
SSK1Q07084 IMP2'YIL154C 1041 nt10.13□□□□□ -0.79
SSK1Q07084 TCD2YKL027W 1344 nt10.12□□□□□ -0.79
SSK1Q07084 FMP45YDL222C 930 nt10.1□□□□□ -0.79
SSK1Q07084 SIM1YIL123W 1431 nt10.09□□□□□ -0.79
SSK1Q07084 ADH2YMR303C 1047 nt10.07□□□□□ -0.8
SSK1Q07084 BIO4YNR057C 714 nt10.05□□□□□ -0.8
SSK1Q07084 SOR2YDL246C 1074 nt10.03□□□□□ -0.8
SSK1Q07084 SWE1YJL187C 2460 nt10.03□□□□□ -0.8
SSK1Q07084 SOR1YJR159W 1074 nt10.03□□□□□ -0.8
SSK1Q07084 LPX1YOR084W 1164 nt10.02□□□□□ -0.81
SSK1Q07084 CWP1YKL096W 720 nt10.01□□□□□ -0.81
SSK1Q07084 ERV46YAL042W 1248 nt10□□□□□ -0.81
SSK1Q07084 MXR2YCL033C 507 nt10□□□□□ -0.81
SSK1Q07084 SNF6YHL025W 999 nt9.99□□□□□ -0.81
SSK1Q07084 YDR433WYDR433W 441 nt9.97□□□□□ -0.81
SSK1Q07084 YIH1YCR059C 777 nt9.95□□□□□ -0.82
SSK1Q07084 HSP60YLR259C 1719 nt9.94□□□□□ -0.82
SSK1Q07084 FRD1YEL047C 1413 nt9.93□□□□□ -0.82
SSK1Q07084 YKR040CYKR040C 504 nt9.92□□□□□ -0.82
SSK1Q07084 CRR1YLR213C 1269 nt9.91□□□□□ -0.82
SSK1Q07084 ERF2YLR246W 1080 nt9.9□□□□□ -0.82
SSK1Q07084 RNQ1YCL028W 1218 nt9.89□□□□□ -0.83
SSK1Q07084 SPP1YPL138C 1062 nt9.88□□□□□ -0.83
SSK1Q07084 YLL053CYLL053C 459 nt9.87□□□□□ -0.83
SSK1Q07084 YCL042WYCL042W 360 nt9.87□□□□□ -0.83
SSK1Q07084 MCH5YOR306C 1566 nt9.86□□□□□ -0.83
SSK1Q07084 GLK1YCL040W 1503 nt9.84□□□□□ -0.83
SSK1Q07084 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt9.84□□□□□ -0.83
SSK1Q07084 ATF2YGR177C 1608 nt9.83□□□□□ -0.84
SSK1Q07084 MIC10YCL057C-A 294 nt9.81□□□□□ -0.84
SSK1Q07084 FTR1YER145C 1215 nt9.78□□□□□ -0.84
SSK1Q07084 FUR4YBR021W 1902 nt9.78□□□□□ -0.84
SSK1Q07084 HEM12YDR047W 1089 nt9.77□□□□□ -0.85
SSK1Q07084 SNG1YGR197C 1644 nt9.77□□□□□ -0.85
SSK1Q07084 YFL067WYFL067W 528 nt9.74□□□□□ -0.85
SSK1Q07084 GAL1YBR020W 1587 nt9.74□□□□□ -0.85
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