Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Siah2Q06986 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Siah2Q06986 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Siah2Q06986 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Siah2Q06986 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Siah2Q06986 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Siah2Q06986 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Siah2Q06986 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Siah2Q06986 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Siah2Q06986 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Siah2Q06986 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Siah2Q06986 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Siah2Q06986 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Siah2Q06986 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Siah2Q06986 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Siah2Q06986 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Siah2Q06986 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Siah2Q06986 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Siah2Q06986 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Siah2Q06986 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Siah2Q06986 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Siah2Q06986 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Siah2Q06986 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Siah2Q06986 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Siah2Q06986 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Siah2Q06986 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Siah2Q06986 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Siah2Q06986 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Siah2Q06986 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Siah2Q06986 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Siah2Q06986 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Siah2Q06986 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Siah2Q06986 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Siah2Q06986 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Siah2Q06986 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Siah2Q06986 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Siah2Q06986 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Siah2Q06986 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Siah2Q06986 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Siah2Q06986 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Siah2Q06986 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Siah2Q06986 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Siah2Q06986 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Siah2Q06986 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Siah2Q06986 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Siah2Q06986 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Siah2Q06986 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Siah2Q06986 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Siah2Q06986 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Siah2Q06986 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Siah2Q06986 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Siah2Q06986 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Siah2Q06986 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Siah2Q06986 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Siah2Q06986 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Siah2Q06986 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Siah2Q06986 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Siah2Q06986 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Siah2Q06986 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Siah2Q06986 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Siah2Q06986 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Siah2Q06986 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Siah2Q06986 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Siah2Q06986 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Siah2Q06986 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Siah2Q06986 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Siah2Q06986 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Siah2Q06986 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Siah2Q06986 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Siah2Q06986 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Siah2Q06986 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Siah2Q06986 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Siah2Q06986 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Siah2Q06986 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Siah2Q06986 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Siah2Q06986 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Siah2Q06986 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Siah2Q06986 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Siah2Q06986 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Siah2Q06986 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Siah2Q06986 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Siah2Q06986 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Siah2Q06986 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Siah2Q06986 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Siah2Q06986 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Siah2Q06986 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Siah2Q06986 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Siah2Q06986 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Siah2Q06986 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Siah2Q06986 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Siah2Q06986 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Siah2Q06986 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Siah2Q06986 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Siah2Q06986 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Siah2Q06986 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Siah2Q06986 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Siah2Q06986 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Siah2Q06986 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Siah2Q06986 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Siah2Q06986 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms