Protein–RNA interactions for Protein: Q06628

ATG13, Autophagy-related protein 13, yeastyeast

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG13Q06628 MRPL8YJL063C 717 nt15.69■□□□□ 0.1
ATG13Q06628 SUF2tP(AGG)C 72 nt15.57■□□□□ 0.08
ATG13Q06628 SUF10tP(AGG)N 72 nt15.57■□□□□ 0.08
ATG13Q06628 ALF1YNL148C 765 nt15.53■□□□□ 0.08
ATG13Q06628 YJL152WYJL152W 360 nt15.48■□□□□ 0.07
ATG13Q06628 LPX1YOR084W 1164 nt15.46■□□□□ 0.07
ATG13Q06628 ADO1YJR105W 1023 nt15.45■□□□□ 0.06
ATG13Q06628 ERV46YAL042W 1248 nt15.44■□□□□ 0.06
ATG13Q06628 IDH1YNL037C 1083 nt15.39■□□□□ 0.05
ATG13Q06628 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt15.38■□□□□ 0.05
ATG13Q06628 YEL076CYEL076C 651 nt15.38■□□□□ 0.05
ATG13Q06628 YLR464WYLR464W 651 nt15.38■□□□□ 0.05
ATG13Q06628 SPP1YPL138C 1062 nt15.38■□□□□ 0.05
ATG13Q06628 YDR095CYDR095C 411 nt15.33■□□□□ 0.04
ATG13Q06628 YPS1YLR120C 1710 nt15.33■□□□□ 0.04
ATG13Q06628 YDR433WYDR433W 441 nt15.3■□□□□ 0.04
ATG13Q06628 RTG1YOL067C 534 nt15.3■□□□□ 0.04
ATG13Q06628 UBX6YJL048C 1191 nt15.28■□□□□ 0.04
ATG13Q06628 SIS1YNL007C 1059 nt15.28■□□□□ 0.04
ATG13Q06628 YKR040CYKR040C 504 nt15.27■□□□□ 0.04
ATG13Q06628 TIR4YOR009W 1464 nt15.19■□□□□ 0.02
ATG13Q06628 GBP2YCL011C 1284 nt15.18■□□□□ 0.02
ATG13Q06628 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt15.14■□□□□ 0.01
ATG13Q06628 MXR2YCL033C 507 nt15.11■□□□□ 0.01
ATG13Q06628 RPP2AYOL039W 321 nt15.06■□□□□ 0
ATG13Q06628 CAC2YML102W 1407 nt15.03■□□□□ -0
ATG13Q06628 HUA1YGR268C 597 nt15.02■□□□□ -0
ATG13Q06628 ART5YGR068C 1761 nt14.98□□□□□ -0.01
ATG13Q06628 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt14.97□□□□□ -0.01
ATG13Q06628 PET9YBL030C 957 nt14.96□□□□□ -0.01
ATG13Q06628 YMR057CYMR057C 372 nt14.96□□□□□ -0.01
ATG13Q06628 YDR094WYDR094W 336 nt14.94□□□□□ -0.02
ATG13Q06628 TCD2YKL027W 1344 nt14.93□□□□□ -0.02
ATG13Q06628 PTP1YDL230W 1008 nt14.92□□□□□ -0.02
ATG13Q06628 GFD2YCL036W 1701 nt14.85□□□□□ -0.03
ATG13Q06628 FRD1YEL047C 1413 nt14.82□□□□□ -0.04
ATG13Q06628 MEP2YNL142W 1500 nt14.81□□□□□ -0.04
ATG13Q06628 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt14.79□□□□□ -0.04
ATG13Q06628 DED1YOR204W 1815 nt14.78□□□□□ -0.04
ATG13Q06628 RRD1YIL153W 1182 nt14.72□□□□□ -0.05
ATG13Q06628 PTH1YHR189W 573 nt14.7□□□□□ -0.06
ATG13Q06628 YKL030WYKL030W 606 nt14.69□□□□□ -0.06
ATG13Q06628 FPS1YLL043W 2010 nt14.67□□□□□ -0.06
ATG13Q06628 YLR235CYLR235C 399 nt14.66□□□□□ -0.06
ATG13Q06628 YCL042WYCL042W 360 nt14.66□□□□□ -0.06
ATG13Q06628 SPT5YML010W 3192 nt14.64□□□□□ -0.07
ATG13Q06628 SOR2YDL246C 1074 nt14.61□□□□□ -0.07
ATG13Q06628 SOR1YJR159W 1074 nt14.61□□□□□ -0.07
ATG13Q06628 FMT1YBL013W 1206 nt14.59□□□□□ -0.07
ATG13Q06628 RTS2YOR077W 699 nt14.59□□□□□ -0.07
ATG13Q06628 DCW1YKL046C 1350 nt14.58□□□□□ -0.08
ATG13Q06628 LCB1YMR296C 1677 nt14.55□□□□□ -0.08
ATG13Q06628 CUE1YMR264W 612 nt14.48□□□□□ -0.09
ATG13Q06628 IRC15YPL017C 1500 nt14.46□□□□□ -0.09
ATG13Q06628 FMP52YER004W 696 nt14.45□□□□□ -0.1
ATG13Q06628 EMI2YDR516C 1503 nt14.44□□□□□ -0.1
ATG13Q06628 Q0182Q0182 405 nt14.43□□□□□ -0.1
ATG13Q06628 CWP1YKL096W 720 nt14.4□□□□□ -0.1
ATG13Q06628 PAU16YKL224C 372 nt14.39□□□□□ -0.11
ATG13Q06628 YDL221WYDL221W 552 nt14.38□□□□□ -0.11
ATG13Q06628 YFR018CYFR018C 1092 nt14.37□□□□□ -0.11
ATG13Q06628 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt14.36□□□□□ -0.11
ATG13Q06628 SBA1YKL117W 651 nt14.35□□□□□ -0.11
ATG13Q06628 ADH2YMR303C 1047 nt14.34□□□□□ -0.11
ATG13Q06628 TIM23YNR017W 669 nt14.34□□□□□ -0.11
ATG13Q06628 GIS3YLR094C 1509 nt14.33□□□□□ -0.12
ATG13Q06628 RRT5YFR032C 870 nt14.32□□□□□ -0.12
ATG13Q06628 YIL100WYIL100W 354 nt14.3□□□□□ -0.12
ATG13Q06628 YMR090WYMR090W 684 nt14.3□□□□□ -0.12
ATG13Q06628 DIC1YLR348C 897 nt14.28□□□□□ -0.12
ATG13Q06628 PRE6YOL038W 765 nt14.25□□□□□ -0.13
ATG13Q06628 YLR179CYLR179C 606 nt14.23□□□□□ -0.13
ATG13Q06628 YPR064WYPR064W 420 nt14.21□□□□□ -0.13
ATG13Q06628 SNF6YHL025W 999 nt14.18□□□□□ -0.14
ATG13Q06628 PCM1YEL058W 1674 nt14.17□□□□□ -0.14
ATG13Q06628 TAD3YLR316C 969 nt14.15□□□□□ -0.14
ATG13Q06628 RNQ1YCL028W 1218 nt14.13□□□□□ -0.15
ATG13Q06628 SCC4YER147C 1875 nt14.11□□□□□ -0.15
ATG13Q06628 SDH1YKL148C 1923 nt14.09□□□□□ -0.15
ATG13Q06628 WSC2YNL283C 1512 nt14.09□□□□□ -0.15
ATG13Q06628 YIH1YCR059C 777 nt14.08□□□□□ -0.16
ATG13Q06628 AHT1YHR093W 549 nt14.08□□□□□ -0.16
ATG13Q06628 YFL066CYFL066C 1179 nt14.01□□□□□ -0.17
ATG13Q06628 PEX25YPL112C 1185 nt13.98□□□□□ -0.17
ATG13Q06628 NAT4YMR069W 858 nt13.95□□□□□ -0.18
ATG13Q06628 YBR220CYBR220C 1683 nt13.95□□□□□ -0.18
ATG13Q06628 YLL053CYLL053C 459 nt13.91□□□□□ -0.18
ATG13Q06628 YNL195CYNL195C 786 nt13.91□□□□□ -0.18
ATG13Q06628 AQY1YPR192W 918 nt13.91□□□□□ -0.18
ATG13Q06628 YSP3YOR003W 1437 nt13.89□□□□□ -0.19
ATG13Q06628 BDH1YAL060W 1149 nt13.88□□□□□ -0.19
ATG13Q06628 YSC84YHR016C 1407 nt13.88□□□□□ -0.19
ATG13Q06628 FTR1YER145C 1215 nt13.85□□□□□ -0.19
ATG13Q06628 YNL115CYNL115C 1935 nt13.85□□□□□ -0.19
ATG13Q06628 GLK1YCL040W 1503 nt13.85□□□□□ -0.19
ATG13Q06628 BIO4YNR057C 714 nt13.83□□□□□ -0.2
ATG13Q06628 YLR415CYLR415C 339 nt13.82□□□□□ -0.2
ATG13Q06628 GAL1YBR020W 1587 nt13.82□□□□□ -0.2
ATG13Q06628 SSA4YER103W 1929 nt13.82□□□□□ -0.2
ATG13Q06628 MSF1YPR047W 1410 nt13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13 ms