Protein–RNA interactions for Protein: Q06625

GDB1, Glycogen debranching enzyme, yeastyeast

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Length 1,536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GDB1Q06625 IMP2'YIL154C 1041 nt18.55■□□□□ 0.56
GDB1Q06625 SPP1YPL138C 1062 nt18.55■□□□□ 0.56
GDB1Q06625 UBX6YJL048C 1191 nt18.5■□□□□ 0.55
GDB1Q06625 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt18.44■□□□□ 0.54
GDB1Q06625 YEL076CYEL076C 651 nt18.44■□□□□ 0.54
GDB1Q06625 YLR464WYLR464W 651 nt18.44■□□□□ 0.54
GDB1Q06625 CCT6YDR188W 1641 nt18.43■□□□□ 0.54
GDB1Q06625 YJL152WYJL152W 360 nt18.41■□□□□ 0.54
GDB1Q06625 RTG1YOL067C 534 nt18.41■□□□□ 0.54
GDB1Q06625 ADO1YJR105W 1023 nt18.37■□□□□ 0.53
GDB1Q06625 ERV46YAL042W 1248 nt18.36■□□□□ 0.53
GDB1Q06625 IDH1YNL037C 1083 nt18.24■□□□□ 0.51
GDB1Q06625 ALF1YNL148C 765 nt18.22■□□□□ 0.51
GDB1Q06625 YDR433WYDR433W 441 nt18.2■□□□□ 0.5
GDB1Q06625 SUF2tP(AGG)C 72 nt18.19■□□□□ 0.5
GDB1Q06625 SUF10tP(AGG)N 72 nt18.19■□□□□ 0.5
GDB1Q06625 MXR2YCL033C 507 nt18.18■□□□□ 0.5
GDB1Q06625 SIS1YNL007C 1059 nt18.13■□□□□ 0.49
GDB1Q06625 TIR4YOR009W 1464 nt18.09■□□□□ 0.49
GDB1Q06625 GBP2YCL011C 1284 nt18.02■□□□□ 0.47
GDB1Q06625 YDR095CYDR095C 411 nt18.01■□□□□ 0.47
GDB1Q06625 YPS1YLR120C 1710 nt17.98■□□□□ 0.47
GDB1Q06625 YKR040CYKR040C 504 nt17.96■□□□□ 0.47
GDB1Q06625 YDR094WYDR094W 336 nt17.93■□□□□ 0.46
GDB1Q06625 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt17.86■□□□□ 0.45
GDB1Q06625 HUA1YGR268C 597 nt17.84■□□□□ 0.45
GDB1Q06625 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt17.77■□□□□ 0.44
GDB1Q06625 PTH1YHR189W 573 nt17.77■□□□□ 0.43
GDB1Q06625 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt17.76■□□□□ 0.43
GDB1Q06625 TCD2YKL027W 1344 nt17.66■□□□□ 0.42
GDB1Q06625 ART5YGR068C 1761 nt17.64■□□□□ 0.41
GDB1Q06625 YMR057CYMR057C 372 nt17.62■□□□□ 0.41
GDB1Q06625 CAC2YML102W 1407 nt17.62■□□□□ 0.41
GDB1Q06625 FRD1YEL047C 1413 nt17.61■□□□□ 0.41
GDB1Q06625 GFD2YCL036W 1701 nt17.57■□□□□ 0.4
GDB1Q06625 PTP1YDL230W 1008 nt17.57■□□□□ 0.4
GDB1Q06625 RPP2AYOL039W 321 nt17.56■□□□□ 0.4
GDB1Q06625 DED1YOR204W 1815 nt17.5■□□□□ 0.39
GDB1Q06625 SBA1YKL117W 651 nt17.5■□□□□ 0.39
GDB1Q06625 RTS2YOR077W 699 nt17.48■□□□□ 0.39
GDB1Q06625 PAU16YKL224C 372 nt17.47■□□□□ 0.39
GDB1Q06625 RRD1YIL153W 1182 nt17.42■□□□□ 0.38
GDB1Q06625 PET9YBL030C 957 nt17.4■□□□□ 0.38
GDB1Q06625 SOR2YDL246C 1074 nt17.37■□□□□ 0.37
GDB1Q06625 SOR1YJR159W 1074 nt17.37■□□□□ 0.37
GDB1Q06625 MEP2YNL142W 1500 nt17.37■□□□□ 0.37
GDB1Q06625 YKL030WYKL030W 606 nt17.37■□□□□ 0.37
GDB1Q06625 LCB1YMR296C 1677 nt17.36■□□□□ 0.37
GDB1Q06625 YLR235CYLR235C 399 nt17.36■□□□□ 0.37
GDB1Q06625 YCL042WYCL042W 360 nt17.36■□□□□ 0.37
GDB1Q06625 DCW1YKL046C 1350 nt17.33■□□□□ 0.37
GDB1Q06625 PRE6YOL038W 765 nt17.31■□□□□ 0.36
GDB1Q06625 FMT1YBL013W 1206 nt17.27■□□□□ 0.36
GDB1Q06625 FPS1YLL043W 2010 nt17.26■□□□□ 0.35
GDB1Q06625 SPT5YML010W 3192 nt17.25■□□□□ 0.35
GDB1Q06625 YFR018CYFR018C 1092 nt17.12■□□□□ 0.33
GDB1Q06625 IRC15YPL017C 1500 nt17.08■□□□□ 0.33
GDB1Q06625 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt17.08■□□□□ 0.32
GDB1Q06625 CWP1YKL096W 720 nt17.06■□□□□ 0.32
GDB1Q06625 TIM23YNR017W 669 nt17.06■□□□□ 0.32
GDB1Q06625 RRT5YFR032C 870 nt17.01■□□□□ 0.31
GDB1Q06625 DIC1YLR348C 897 nt17.01■□□□□ 0.31
GDB1Q06625 CUE1YMR264W 612 nt17.01■□□□□ 0.31
GDB1Q06625 EMI2YDR516C 1503 nt16.99■□□□□ 0.31
GDB1Q06625 ADH2YMR303C 1047 nt16.96■□□□□ 0.3
GDB1Q06625 YLR179CYLR179C 606 nt16.93■□□□□ 0.3
GDB1Q06625 SNF6YHL025W 999 nt16.92■□□□□ 0.3
GDB1Q06625 FMP52YER004W 696 nt16.91■□□□□ 0.3
GDB1Q06625 YDL221WYDL221W 552 nt16.89■□□□□ 0.29
GDB1Q06625 GIS3YLR094C 1509 nt16.85■□□□□ 0.29
GDB1Q06625 YIL100WYIL100W 354 nt16.77■□□□□ 0.28
GDB1Q06625 YPR064WYPR064W 420 nt16.77■□□□□ 0.28
GDB1Q06625 WSC2YNL283C 1512 nt16.74■□□□□ 0.27
GDB1Q06625 PEX25YPL112C 1185 nt16.73■□□□□ 0.27
GDB1Q06625 YFL066CYFL066C 1179 nt16.72■□□□□ 0.27
GDB1Q06625 TAD3YLR316C 969 nt16.66■□□□□ 0.26
GDB1Q06625 NAT4YMR069W 858 nt16.63■□□□□ 0.25
GDB1Q06625 PCM1YEL058W 1674 nt16.6■□□□□ 0.25
GDB1Q06625 SDH1YKL148C 1923 nt16.56■□□□□ 0.24
GDB1Q06625 YIH1YCR059C 777 nt16.56■□□□□ 0.24
GDB1Q06625 SCC4YER147C 1875 nt16.56■□□□□ 0.24
GDB1Q06625 GLK1YCL040W 1503 nt16.52■□□□□ 0.24
GDB1Q06625 AHT1YHR093W 549 nt16.52■□□□□ 0.24
GDB1Q06625 YMR090WYMR090W 684 nt16.51■□□□□ 0.23
GDB1Q06625 YNL115CYNL115C 1935 nt16.51■□□□□ 0.23
GDB1Q06625 RNQ1YCL028W 1218 nt16.5■□□□□ 0.23
GDB1Q06625 MSF1YPR047W 1410 nt16.45■□□□□ 0.22
GDB1Q06625 YSP3YOR003W 1437 nt16.44■□□□□ 0.22
GDB1Q06625 YSC84YHR016C 1407 nt16.43■□□□□ 0.22
GDB1Q06625 YBR220CYBR220C 1683 nt16.43■□□□□ 0.22
GDB1Q06625 MIR1YJR077C 936 nt16.41■□□□□ 0.22
GDB1Q06625 BDH1YAL060W 1149 nt16.41■□□□□ 0.22
GDB1Q06625 YLL053CYLL053C 459 nt16.4■□□□□ 0.22
GDB1Q06625 SSA4YER103W 1929 nt16.39■□□□□ 0.21
GDB1Q06625 BIO4YNR057C 714 nt16.37■□□□□ 0.21
GDB1Q06625 YLR415CYLR415C 339 nt16.35■□□□□ 0.21
GDB1Q06625 FTR1YER145C 1215 nt16.34■□□□□ 0.21
GDB1Q06625 THI74YDR438W 1113 nt16.31■□□□□ 0.2
GDB1Q06625 YMR244WYMR244W 1068 nt16.31■□□□□ 0.2
GDB1Q06625 RRT12YCR045C 1476 nt16.29■□□□□ 0.2
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