RNAct
Search
Pairwise
Browse
Proteins
RNAs
Download
About
Search
Protein–RNA interactions for Protein: Q06549
CDD1, Cytidine deaminase, yeast
Predictions only
Length
142 aa
.
Download Table
Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
CDD1
Q06549
YHR165W-A
YHR165W-A
312 nt
13.04
□□□□□ -0.32
CDD1
Q06549
SIS1
YNL007C
1059 nt
13.04
□□□□□ -0.32
CDD1
Q06549
YLR236C
YLR236C
324 nt
13.01
□□□□□ -0.33
CDD1
Q06549
DSK2
YMR276W
1122 nt
13
□□□□□ -0.33
CDD1
Q06549
MOT3
YMR070W
1473 nt
12.97
□□□□□ -0.33
CDD1
Q06549
MEP2
YNL142W
1500 nt
12.96
□□□□□ -0.33
CDD1
Q06549
YJL152W
YJL152W
360 nt
12.94
□□□□□ -0.34
CDD1
Q06549
FMP45
YDL222C
930 nt
12.93
□□□□□ -0.34
CDD1
Q06549
PTP1
YDL230W
1008 nt
12.92
□□□□□ -0.34
CDD1
Q06549
YCH1
YGR203W
447 nt
12.92
□□□□□ -0.34
CDD1
Q06549
IMP2'
YIL154C
1041 nt
12.92
□□□□□ -0.34
CDD1
Q06549
RPP2A
YOL039W
321 nt
12.92
□□□□□ -0.34
CDD1
Q06549
TIR4
YOR009W
1464 nt
12.91
□□□□□ -0.34
CDD1
Q06549
ART5
YGR068C
1761 nt
12.84
□□□□□ -0.35
CDD1
Q06549
DCW1
YKL046C
1350 nt
12.81
□□□□□ -0.36
CDD1
Q06549
LPX1
YOR084W
1164 nt
12.78
□□□□□ -0.36
CDD1
Q06549
CAC2
YML102W
1407 nt
12.78
□□□□□ -0.36
CDD1
Q06549
IDH1
YNL037C
1083 nt
12.76
□□□□□ -0.37
CDD1
Q06549
GFD2
YCL036W
1701 nt
12.76
□□□□□ -0.37
CDD1
Q06549
PET9
YBL030C
957 nt
12.75
□□□□□ -0.37
CDD1
Q06549
YMR057C
YMR057C
372 nt
12.74
□□□□□ -0.37
CDD1
Q06549
ERV46
YAL042W
1248 nt
12.72
□□□□□ -0.37
CDD1
Q06549
GBP2
YCL011C
1284 nt
12.67
□□□□□ -0.38
CDD1
Q06549
YDR433W
YDR433W
441 nt
12.66
□□□□□ -0.38
CDD1
Q06549
SPP1
YPL138C
1062 nt
12.65
□□□□□ -0.38
CDD1
Q06549
EMI2
YDR516C
1503 nt
12.62
□□□□□ -0.39
CDD1
Q06549
MXR2
YCL033C
507 nt
12.61
□□□□□ -0.39
CDD1
Q06549
YKR040C
YKR040C
504 nt
12.6
□□□□□ -0.39
CDD1
Q06549
YCL048W-A
YCL048W-A
240 nt
12.59
□□□□□ -0.39
CDD1
Q06549
IRC15
YPL017C
1500 nt
12.57
□□□□□ -0.4
CDD1
Q06549
RTS2
YOR077W
699 nt
12.57
□□□□□ -0.4
CDD1
Q06549
FPS1
YLL043W
2010 nt
12.56
□□□□□ -0.4
CDD1
Q06549
YDL221W
YDL221W
552 nt
12.54
□□□□□ -0.4
CDD1
Q06549
DED1
YOR204W
1815 nt
12.49
□□□□□ -0.41
CDD1
Q06549
SSA4
YER103W
1929 nt
12.47
□□□□□ -0.41
CDD1
Q06549
TCD2
YKL027W
1344 nt
12.47
□□□□□ -0.41
CDD1
Q06549
MRPL8
YJL063C
717 nt
12.47
□□□□□ -0.41
CDD1
Q06549
GIS3
YLR094C
1509 nt
12.47
□□□□□ -0.41
CDD1
Q06549
RRD1
YIL153W
1182 nt
12.46
□□□□□ -0.41
CDD1
Q06549
RTG1
YOL067C
534 nt
12.44
□□□□□ -0.42
CDD1
Q06549
YMR090W
YMR090W
684 nt
12.43
□□□□□ -0.42
CDD1
Q06549
CUE1
YMR264W
612 nt
12.43
□□□□□ -0.42
CDD1
Q06549
YEL076C-A
YEL076C-A
651 nt
12.38
□□□□□ -0.43
CDD1
Q06549
YEL076C
YEL076C
651 nt
12.38
□□□□□ -0.43
CDD1
Q06549
YLR464W
YLR464W
651 nt
12.38
□□□□□ -0.43
CDD1
Q06549
FRD1
YEL047C
1413 nt
12.37
□□□□□ -0.43
CDD1
Q06549
FMT1
YBL013W
1206 nt
12.36
□□□□□ -0.43
CDD1
Q06549
SDH1
YKL148C
1923 nt
12.35
□□□□□ -0.43
CDD1
Q06549
YBR220C
YBR220C
1683 nt
12.33
□□□□□ -0.44
CDD1
Q06549
SCC4
YER147C
1875 nt
12.31
□□□□□ -0.44
CDD1
Q06549
ADO1
YJR105W
1023 nt
12.3
□□□□□ -0.44
CDD1
Q06549
SOR2
YDL246C
1074 nt
12.25
□□□□□ -0.45
CDD1
Q06549
SOR1
YJR159W
1074 nt
12.25
□□□□□ -0.45
CDD1
Q06549
YIL100W
YIL100W
354 nt
12.23
□□□□□ -0.45
CDD1
Q06549
YCL042W
YCL042W
360 nt
12.22
□□□□□ -0.45
CDD1
Q06549
PTH1
YHR189W
573 nt
12.2
□□□□□ -0.46
CDD1
Q06549
FMP52
YER004W
696 nt
12.18
□□□□□ -0.46
CDD1
Q06549
CWP1
YKL096W
720 nt
12.16
□□□□□ -0.46
CDD1
Q06549
ADH2
YMR303C
1047 nt
12.15
□□□□□ -0.46
CDD1
Q06549
UBX6
YJL048C
1191 nt
12.13
□□□□□ -0.47
CDD1
Q06549
HUA1
YGR268C
597 nt
12.12
□□□□□ -0.47
CDD1
Q06549
YLR235C
YLR235C
399 nt
12.08
□□□□□ -0.48
CDD1
Q06549
YKL030W
YKL030W
606 nt
12.07
□□□□□ -0.48
CDD1
Q06549
PCM1
YEL058W
1674 nt
12.06
□□□□□ -0.48
CDD1
Q06549
LCB1
YMR296C
1677 nt
12.06
□□□□□ -0.48
CDD1
Q06549
RRT12
YCR045C
1476 nt
12.05
□□□□□ -0.48
CDD1
Q06549
SNF6
YHL025W
999 nt
11.99
□□□□□ -0.49
CDD1
Q06549
BDF1
YLR399C
2061 nt
11.99
□□□□□ -0.49
CDD1
Q06549
YSC84
YHR016C
1407 nt
11.98
□□□□□ -0.49
CDD1
Q06549
YNL195C
YNL195C
786 nt
11.98
□□□□□ -0.49
CDD1
Q06549
YHL050C
YHL050C
2094 nt
11.98
□□□□□ -0.49
CDD1
Q06549
DIC1
YLR348C
897 nt
11.96
□□□□□ -0.49
CDD1
Q06549
YDR094W
YDR094W
336 nt
11.94
□□□□□ -0.5
CDD1
Q06549
TIM23
YNR017W
669 nt
11.93
□□□□□ -0.5
CDD1
Q06549
YIH1
YCR059C
777 nt
11.91
□□□□□ -0.5
CDD1
Q06549
RNQ1
YCL028W
1218 nt
11.91
□□□□□ -0.5
CDD1
Q06549
YLR179C
YLR179C
606 nt
11.85
□□□□□ -0.51
CDD1
Q06549
BIO4
YNR057C
714 nt
11.82
□□□□□ -0.52
CDD1
Q06549
TAT1
YBR069C
1860 nt
11.82
□□□□□ -0.52
CDD1
Q06549
YLL053C
YLL053C
459 nt
11.81
□□□□□ -0.52
CDD1
Q06549
WSC2
YNL283C
1512 nt
11.8
□□□□□ -0.52
CDD1
Q06549
SIM1
YIL123W
1431 nt
11.79
□□□□□ -0.52
CDD1
Q06549
tL(GAG)G
tL(GAG)G
82 nt
11.77
□□□□□ -0.53
CDD1
Q06549
SEC11
YIR022W
504 nt
11.77
□□□□□ -0.53
CDD1
Q06549
AHT1
YHR093W
549 nt
11.76
□□□□□ -0.53
CDD1
Q06549
YFL015W-A
YFL015W-A
318 nt
11.75
□□□□□ -0.53
CDD1
Q06549
YPR064W
YPR064W
420 nt
11.75
□□□□□ -0.53
CDD1
Q06549
TAD3
YLR316C
969 nt
11.73
□□□□□ -0.53
CDD1
Q06549
FTR1
YER145C
1215 nt
11.72
□□□□□ -0.53
CDD1
Q06549
PCH2
YBR186W
1695 nt
11.71
□□□□□ -0.54
CDD1
Q06549
GAL1
YBR020W
1587 nt
11.71
□□□□□ -0.54
CDD1
Q06549
YFR018C
YFR018C
1092 nt
11.69
□□□□□ -0.54
CDD1
Q06549
NCP1
YHR042W
2076 nt
11.67
□□□□□ -0.54
CDD1
Q06549
PRE6
YOL038W
765 nt
11.67
□□□□□ -0.54
CDD1
Q06549
TRM5
YHR070W
1500 nt
11.66
□□□□□ -0.54
CDD1
Q06549
GUT2
YIL155C
1950 nt
11.65
□□□□□ -0.54
CDD1
Q06549
AQY1
YPR192W
918 nt
11.64
□□□□□ -0.55
CDD1
Q06549
ATF2
YGR177C
1608 nt
11.63
□□□□□ -0.55
CDD1
Q06549
PAU16
YKL224C
372 nt
11.62
□□□□□ -0.55
CDD1
Q06549
SPC25
YER018C
666 nt
11.58
□□□□□ -0.56
First
Previous
2
Next
Last
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8.4 ms