Protein–RNA interactions for Protein: Q06506

RRP9, Ribosomal RNA-processing protein 9, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 573 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP9Q06506 ALF1YNL148C 765 nt11.29□□□□□ -0.6
RRP9Q06506 CCT6YDR188W 1641 nt11.27□□□□□ -0.6
RRP9Q06506 SDH1YKL148C 1923 nt11.27□□□□□ -0.6
RRP9Q06506 MNP1YGL068W 585 nt11.25□□□□□ -0.61
RRP9Q06506 PTP1YDL230W 1008 nt11.22□□□□□ -0.61
RRP9Q06506 PCH2YBR186W 1695 nt11.21□□□□□ -0.61
RRP9Q06506 RPP2AYOL039W 321 nt11.21□□□□□ -0.61
RRP9Q06506 SEC11YIR022W 504 nt11.2□□□□□ -0.62
RRP9Q06506 YJL225CYJL225C 5277 nt11.2□□□□□ -0.62
RRP9Q06506 BOR1YNL275W 1731 nt11.16□□□□□ -0.62
RRP9Q06506 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.16□□□□□ -0.62
RRP9Q06506 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.16□□□□□ -0.62
RRP9Q06506 RKM5YLR137W 1104 nt11.16□□□□□ -0.62
RRP9Q06506 SIS1YNL007C 1059 nt11.15□□□□□ -0.62
RRP9Q06506 CAC2YML102W 1407 nt11.15□□□□□ -0.62
RRP9Q06506 SCC4YER147C 1875 nt11.1□□□□□ -0.63
RRP9Q06506 FRE6YLL051C 2139 nt11.06□□□□□ -0.64
RRP9Q06506 GFD2YCL036W 1701 nt11.01□□□□□ -0.65
RRP9Q06506 IRC15YPL017C 1500 nt11□□□□□ -0.65
RRP9Q06506 ART5YGR068C 1761 nt11□□□□□ -0.65
RRP9Q06506 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.98□□□□□ -0.65
RRP9Q06506 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.98□□□□□ -0.65
RRP9Q06506 YOL037CYOL037C 354 nt10.96□□□□□ -0.65
RRP9Q06506 TIR4YOR009W 1464 nt10.94□□□□□ -0.66
RRP9Q06506 PIB2YGL023C 1908 nt10.94□□□□□ -0.66
RRP9Q06506 GIS3YLR094C 1509 nt10.94□□□□□ -0.66
RRP9Q06506 YOR139CYOR139C 393 nt10.93□□□□□ -0.66
RRP9Q06506 YSC84YHR016C 1407 nt10.92□□□□□ -0.66
RRP9Q06506 PET9YBL030C 957 nt10.91□□□□□ -0.66
RRP9Q06506 RTS2YOR077W 699 nt10.9□□□□□ -0.66
RRP9Q06506 NPL3YDR432W 1245 nt10.89□□□□□ -0.67
RRP9Q06506 RTF1YGL244W 1677 nt10.88□□□□□ -0.67
RRP9Q06506 YCH1YGR203W 447 nt10.86□□□□□ -0.67
RRP9Q06506 ALG12YNR030W 1656 nt10.83□□□□□ -0.68
RRP9Q06506 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.82□□□□□ -0.68
RRP9Q06506 YHL050CYHL050C 2094 nt10.81□□□□□ -0.68
RRP9Q06506 YMR057CYMR057C 372 nt10.79□□□□□ -0.68
RRP9Q06506 CUE1YMR264W 612 nt10.78□□□□□ -0.68
RRP9Q06506 BOP3YNL042W 1191 nt10.78□□□□□ -0.68
RRP9Q06506 YJL152WYJL152W 360 nt10.74□□□□□ -0.69
RRP9Q06506 YLR281CYLR281C 468 nt10.7□□□□□ -0.7
RRP9Q06506 WHI5YOR083W 888 nt10.7□□□□□ -0.7
RRP9Q06506 RRT12YCR045C 1476 nt10.68□□□□□ -0.7
RRP9Q06506 YNL195CYNL195C 786 nt10.68□□□□□ -0.7
RRP9Q06506 PTK1YKL198C 1989 nt10.68□□□□□ -0.7
RRP9Q06506 HSL7YBR133C 2484 nt10.67□□□□□ -0.7
RRP9Q06506 SSN3YPL042C 1668 nt10.64□□□□□ -0.71
RRP9Q06506 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.63□□□□□ -0.71
RRP9Q06506 YIL100WYIL100W 354 nt10.62□□□□□ -0.71
RRP9Q06506 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.6□□□□□ -0.71
RRP9Q06506 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.6□□□□□ -0.71
RRP9Q06506 YLR236CYLR236C 324 nt10.59□□□□□ -0.71
RRP9Q06506 DED1YOR204W 1815 nt10.58□□□□□ -0.72
RRP9Q06506 BSP1YPR171W 1731 nt10.52□□□□□ -0.73
RRP9Q06506 IDH1YNL037C 1083 nt10.51□□□□□ -0.73
RRP9Q06506 PUS2YGL063W 1113 nt10.5□□□□□ -0.73
RRP9Q06506 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.49□□□□□ -0.73
RRP9Q06506 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.49□□□□□ -0.73
RRP9Q06506 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.49□□□□□ -0.73
RRP9Q06506 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.49□□□□□ -0.73
RRP9Q06506 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.49□□□□□ -0.73
RRP9Q06506 YFL054CYFL054C 1941 nt10.47□□□□□ -0.73
RRP9Q06506 DSK2YMR276W 1122 nt10.47□□□□□ -0.73
RRP9Q06506 RRD1YIL153W 1182 nt10.46□□□□□ -0.73
RRP9Q06506 NCP1YHR042W 2076 nt10.46□□□□□ -0.74
RRP9Q06506 IMP2'YIL154C 1041 nt10.45□□□□□ -0.74
RRP9Q06506 GBP2YCL011C 1284 nt10.45□□□□□ -0.74
RRP9Q06506 HSP60YLR259C 1719 nt10.44□□□□□ -0.74
RRP9Q06506 NAR1YNL240C 1476 nt10.42□□□□□ -0.74
RRP9Q06506 SPT8YLR055C 1809 nt10.42□□□□□ -0.74
RRP9Q06506 YPR011CYPR011C 981 nt10.42□□□□□ -0.74
RRP9Q06506 HEL2YDR266C 1920 nt10.42□□□□□ -0.74
RRP9Q06506 TCD2YKL027W 1344 nt10.37□□□□□ -0.75
RRP9Q06506 SFP1YLR403W 2052 nt10.35□□□□□ -0.75
RRP9Q06506 YAT1YAR035W 2064 nt10.34□□□□□ -0.75
RRP9Q06506 FMP52YER004W 696 nt10.34□□□□□ -0.75
RRP9Q06506 NPP1YCR026C 2229 nt10.33□□□□□ -0.76
RRP9Q06506 FMP45YDL222C 930 nt10.32□□□□□ -0.76
RRP9Q06506 YDR433WYDR433W 441 nt10.32□□□□□ -0.76
RRP9Q06506 GID7YCL039W 2238 nt10.31□□□□□ -0.76
RRP9Q06506 FMT1YBL013W 1206 nt10.31□□□□□ -0.76
RRP9Q06506 MXR2YCL033C 507 nt10.31□□□□□ -0.76
RRP9Q06506 CMP2YML057W 1815 nt10.3□□□□□ -0.76
RRP9Q06506 ERV46YAL042W 1248 nt10.29□□□□□ -0.76
RRP9Q06506 LPX1YOR084W 1164 nt10.29□□□□□ -0.76
RRP9Q06506 LCB1YMR296C 1677 nt10.28□□□□□ -0.76
RRP9Q06506 MET2YNL277W 1461 nt10.26□□□□□ -0.77
RRP9Q06506 PCM1YEL058W 1674 nt10.25□□□□□ -0.77
RRP9Q06506 SOR2YDL246C 1074 nt10.23□□□□□ -0.77
RRP9Q06506 SOR1YJR159W 1074 nt10.23□□□□□ -0.77
RRP9Q06506 ADH2YMR303C 1047 nt10.22□□□□□ -0.77
RRP9Q06506 SWE1YJL187C 2460 nt10.2□□□□□ -0.78
RRP9Q06506 CWP1YKL096W 720 nt10.2□□□□□ -0.78
RRP9Q06506 UBX6YJL048C 1191 nt10.19□□□□□ -0.78
RRP9Q06506 YKR040CYKR040C 504 nt10.19□□□□□ -0.78
RRP9Q06506 ESBP6YNL125C 2022 nt10.17□□□□□ -0.78
RRP9Q06506 FRD1YEL047C 1413 nt10.16□□□□□ -0.78
RRP9Q06506 SNF6YHL025W 999 nt10.16□□□□□ -0.78
RRP9Q06506 SIM1YIL123W 1431 nt10.16□□□□□ -0.78
RRP9Q06506 YCL042WYCL042W 360 nt10.14□□□□□ -0.79
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