Protein–RNA interactions for Protein: Q06219

Nr4a2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a2Q06219 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nr4a2Q06219 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nr4a2Q06219 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nr4a2Q06219 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nr4a2Q06219 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nr4a2Q06219 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nr4a2Q06219 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nr4a2Q06219 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nr4a2Q06219 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nr4a2Q06219 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nr4a2Q06219 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nr4a2Q06219 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nr4a2Q06219 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nr4a2Q06219 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Nr4a2Q06219 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nr4a2Q06219 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nr4a2Q06219 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nr4a2Q06219 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nr4a2Q06219 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nr4a2Q06219 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nr4a2Q06219 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nr4a2Q06219 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nr4a2Q06219 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nr4a2Q06219 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nr4a2Q06219 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nr4a2Q06219 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nr4a2Q06219 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nr4a2Q06219 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nr4a2Q06219 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nr4a2Q06219 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nr4a2Q06219 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nr4a2Q06219 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Nr4a2Q06219 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nr4a2Q06219 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nr4a2Q06219 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nr4a2Q06219 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nr4a2Q06219 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Nr4a2Q06219 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nr4a2Q06219 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nr4a2Q06219 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nr4a2Q06219 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nr4a2Q06219 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nr4a2Q06219 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nr4a2Q06219 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nr4a2Q06219 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nr4a2Q06219 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nr4a2Q06219 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nr4a2Q06219 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nr4a2Q06219 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nr4a2Q06219 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Nr4a2Q06219 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nr4a2Q06219 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nr4a2Q06219 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nr4a2Q06219 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nr4a2Q06219 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nr4a2Q06219 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Nr4a2Q06219 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nr4a2Q06219 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nr4a2Q06219 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nr4a2Q06219 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nr4a2Q06219 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nr4a2Q06219 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nr4a2Q06219 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nr4a2Q06219 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nr4a2Q06219 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nr4a2Q06219 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nr4a2Q06219 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nr4a2Q06219 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nr4a2Q06219 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nr4a2Q06219 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nr4a2Q06219 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nr4a2Q06219 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nr4a2Q06219 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nr4a2Q06219 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nr4a2Q06219 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nr4a2Q06219 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nr4a2Q06219 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nr4a2Q06219 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nr4a2Q06219 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Nr4a2Q06219 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nr4a2Q06219 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nr4a2Q06219 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Nr4a2Q06219 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nr4a2Q06219 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nr4a2Q06219 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nr4a2Q06219 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nr4a2Q06219 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nr4a2Q06219 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nr4a2Q06219 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nr4a2Q06219 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nr4a2Q06219 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nr4a2Q06219 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nr4a2Q06219 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nr4a2Q06219 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nr4a2Q06219 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nr4a2Q06219 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nr4a2Q06219 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nr4a2Q06219 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nr4a2Q06219 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nr4a2Q06219 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms