Protein–RNA interactions for Protein: Q05934

VID22, Vacuolar import and degradation protein 22, yeastyeast

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VID22Q05934 BDF1YLR399C 2061 nt11.65□□□□□ -0.54
VID22Q05934 IMP2'YIL154C 1041 nt11.59□□□□□ -0.55
VID22Q05934 EMI2YDR516C 1503 nt11.58□□□□□ -0.56
VID22Q05934 ALF1YNL148C 765 nt11.56□□□□□ -0.56
VID22Q05934 DSK2YMR276W 1122 nt11.55□□□□□ -0.56
VID22Q05934 FMP45YDL222C 930 nt11.54□□□□□ -0.56
VID22Q05934 YMR090WYMR090W 684 nt11.54□□□□□ -0.56
VID22Q05934 RPP2AYOL039W 321 nt11.52□□□□□ -0.57
VID22Q05934 PTP1YDL230W 1008 nt11.51□□□□□ -0.57
VID22Q05934 TAT1YBR069C 1860 nt11.5□□□□□ -0.57
VID22Q05934 CCT6YDR188W 1641 nt11.49□□□□□ -0.57
VID22Q05934 YBR220CYBR220C 1683 nt11.49□□□□□ -0.57
VID22Q05934 YDL221WYDL221W 552 nt11.48□□□□□ -0.57
VID22Q05934 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.47□□□□□ -0.57
VID22Q05934 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.47□□□□□ -0.57
VID22Q05934 CAC2YML102W 1407 nt11.46□□□□□ -0.57
VID22Q05934 YCH1YGR203W 447 nt11.46□□□□□ -0.57
VID22Q05934 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.46□□□□□ -0.57
VID22Q05934 PAC11YDR488C 1602 nt11.45□□□□□ -0.58
VID22Q05934 MRPL8YJL063C 717 nt11.42□□□□□ -0.58
VID22Q05934 NVJ2YPR091C 2313 nt11.42□□□□□ -0.58
VID22Q05934 SIS1YNL007C 1059 nt11.41□□□□□ -0.58
VID22Q05934 SDH1YKL148C 1923 nt11.4□□□□□ -0.58
VID22Q05934 YLR236CYLR236C 324 nt11.35□□□□□ -0.59
VID22Q05934 YJL152WYJL152W 360 nt11.34□□□□□ -0.59
VID22Q05934 ADO1YJR105W 1023 nt11.32□□□□□ -0.6
VID22Q05934 IRC15YPL017C 1500 nt11.3□□□□□ -0.6
VID22Q05934 YPR011CYPR011C 981 nt11.3□□□□□ -0.6
VID22Q05934 IDH1YNL037C 1083 nt11.29□□□□□ -0.6
VID22Q05934 SCC4YER147C 1875 nt11.27□□□□□ -0.6
VID22Q05934 GFD2YCL036W 1701 nt11.24□□□□□ -0.61
VID22Q05934 ART5YGR068C 1761 nt11.23□□□□□ -0.61
VID22Q05934 GIS3YLR094C 1509 nt11.23□□□□□ -0.61
VID22Q05934 ERV46YAL042W 1248 nt11.19□□□□□ -0.62
VID22Q05934 PET9YBL030C 957 nt11.19□□□□□ -0.62
VID22Q05934 LPX1YOR084W 1164 nt11.18□□□□□ -0.62
VID22Q05934 YDR433WYDR433W 441 nt11.17□□□□□ -0.62
VID22Q05934 FPS1YLL043W 2010 nt11.17□□□□□ -0.62
VID22Q05934 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.16□□□□□ -0.62
VID22Q05934 YEL076CYEL076C 651 nt11.16□□□□□ -0.62
VID22Q05934 YLR464WYLR464W 651 nt11.16□□□□□ -0.62
VID22Q05934 SEC11YIR022W 504 nt11.14□□□□□ -0.63
VID22Q05934 PCH2YBR186W 1695 nt11.12□□□□□ -0.63
VID22Q05934 RTS2YOR077W 699 nt11.12□□□□□ -0.63
VID22Q05934 YKR040CYKR040C 504 nt11.1□□□□□ -0.63
VID22Q05934 TIR4YOR009W 1464 nt11.09□□□□□ -0.63
VID22Q05934 GBP2YCL011C 1284 nt11.08□□□□□ -0.64
VID22Q05934 GUT2YIL155C 1950 nt11.07□□□□□ -0.64
VID22Q05934 CUE1YMR264W 612 nt11.07□□□□□ -0.64
VID22Q05934 SPP1YPL138C 1062 nt11.03□□□□□ -0.64
VID22Q05934 YSC84YHR016C 1407 nt11.02□□□□□ -0.64
VID22Q05934 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.01□□□□□ -0.65
VID22Q05934 RTG1YOL067C 534 nt11□□□□□ -0.65
VID22Q05934 HUA1YGR268C 597 nt10.99□□□□□ -0.65
VID22Q05934 YMR057CYMR057C 372 nt10.99□□□□□ -0.65
VID22Q05934 YHL050CYHL050C 2094 nt10.97□□□□□ -0.65
VID22Q05934 UBX6YJL048C 1191 nt10.97□□□□□ -0.65
VID22Q05934 TCD2YKL027W 1344 nt10.93□□□□□ -0.66
VID22Q05934 YIL100WYIL100W 354 nt10.91□□□□□ -0.66
VID22Q05934 MXR2YCL033C 507 nt10.91□□□□□ -0.66
VID22Q05934 RRT12YCR045C 1476 nt10.91□□□□□ -0.66
VID22Q05934 YJL225CYJL225C 5277 nt10.91□□□□□ -0.66
VID22Q05934 PIB2YGL023C 1908 nt10.9□□□□□ -0.67
VID22Q05934 YNL195CYNL195C 786 nt10.89□□□□□ -0.67
VID22Q05934 RTF1YGL244W 1677 nt10.83□□□□□ -0.68
VID22Q05934 YDR094WYDR094W 336 nt10.83□□□□□ -0.68
VID22Q05934 BOP3YNL042W 1191 nt10.77□□□□□ -0.69
VID22Q05934 YCL042WYCL042W 360 nt10.77□□□□□ -0.69
VID22Q05934 YLR235CYLR235C 399 nt10.73□□□□□ -0.69
VID22Q05934 YKL030WYKL030W 606 nt10.71□□□□□ -0.69
VID22Q05934 FRD1YEL047C 1413 nt10.69□□□□□ -0.7
VID22Q05934 PTK1YKL198C 1989 nt10.68□□□□□ -0.7
VID22Q05934 NCP1YHR042W 2076 nt10.66□□□□□ -0.7
VID22Q05934 PTH1YHR189W 573 nt10.66□□□□□ -0.7
VID22Q05934 RRD1YIL153W 1182 nt10.62□□□□□ -0.71
VID22Q05934 DED1YOR204W 1815 nt10.62□□□□□ -0.71
VID22Q05934 SOR2YDL246C 1074 nt10.6□□□□□ -0.71
VID22Q05934 SOR1YJR159W 1074 nt10.6□□□□□ -0.71
VID22Q05934 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.59□□□□□ -0.71
VID22Q05934 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.59□□□□□ -0.71
VID22Q05934 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.59□□□□□ -0.71
VID22Q05934 FMP52YER004W 696 nt10.56□□□□□ -0.72
VID22Q05934 LCB1YMR296C 1677 nt10.54□□□□□ -0.72
VID22Q05934 UME6YDR207C 2511 nt10.53□□□□□ -0.72
VID22Q05934 RRT5YFR032C 870 nt10.49□□□□□ -0.73
VID22Q05934 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.49□□□□□ -0.73
VID22Q05934 CWP1YKL096W 720 nt10.47□□□□□ -0.73
VID22Q05934 FMT1YBL013W 1206 nt10.47□□□□□ -0.73
VID22Q05934 PCM1YEL058W 1674 nt10.45□□□□□ -0.74
VID22Q05934 TIM23YNR017W 669 nt10.45□□□□□ -0.74
VID22Q05934 YFL054CYFL054C 1941 nt10.44□□□□□ -0.74
VID22Q05934 PAU16YKL224C 372 nt10.41□□□□□ -0.74
VID22Q05934 SIM1YIL123W 1431 nt10.41□□□□□ -0.74
VID22Q05934 YFR018CYFR018C 1092 nt10.4□□□□□ -0.74
VID22Q05934 YPR064WYPR064W 420 nt10.4□□□□□ -0.74
VID22Q05934 YLR179CYLR179C 606 nt10.39□□□□□ -0.75
VID22Q05934 DIC1YLR348C 897 nt10.39□□□□□ -0.75
VID22Q05934 SPT8YLR055C 1809 nt10.39□□□□□ -0.75
VID22Q05934 ADH2YMR303C 1047 nt10.38□□□□□ -0.75
VID22Q05934 SNF6YHL025W 999 nt10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.6 ms