Protein–RNA interactions for Protein: Q05515

SVF1, Survival factor 1, yeastyeast

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SVF1Q05515 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.66□□□□□ -0.22
SVF1Q05515 DSK2YMR276W 1122 nt13.59□□□□□ -0.23
SVF1Q05515 SIS1YNL007C 1059 nt13.56□□□□□ -0.24
SVF1Q05515 YPR011CYPR011C 981 nt13.49□□□□□ -0.25
SVF1Q05515 SPT5YML010W 3192 nt13.48□□□□□ -0.25
SVF1Q05515 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.47□□□□□ -0.25
SVF1Q05515 YLR236CYLR236C 324 nt13.46□□□□□ -0.25
SVF1Q05515 FMP45YDL222C 930 nt13.45□□□□□ -0.26
SVF1Q05515 RPP2AYOL039W 321 nt13.41□□□□□ -0.26
SVF1Q05515 YCH1YGR203W 447 nt13.4□□□□□ -0.26
SVF1Q05515 MEP2YNL142W 1500 nt13.38□□□□□ -0.27
SVF1Q05515 YJL152WYJL152W 360 nt13.37□□□□□ -0.27
SVF1Q05515 ERV46YAL042W 1248 nt13.33□□□□□ -0.28
SVF1Q05515 IDH1YNL037C 1083 nt13.33□□□□□ -0.28
SVF1Q05515 PTP1YDL230W 1008 nt13.32□□□□□ -0.28
SVF1Q05515 TIR4YOR009W 1464 nt13.31□□□□□ -0.28
SVF1Q05515 PET9YBL030C 957 nt13.28□□□□□ -0.28
SVF1Q05515 MRPL8YJL063C 717 nt13.26□□□□□ -0.29
SVF1Q05515 ART5YGR068C 1761 nt13.22□□□□□ -0.29
SVF1Q05515 LPX1YOR084W 1164 nt13.21□□□□□ -0.29
SVF1Q05515 CAC2YML102W 1407 nt13.2□□□□□ -0.3
SVF1Q05515 YKR040CYKR040C 504 nt13.17□□□□□ -0.3
SVF1Q05515 GFD2YCL036W 1701 nt13.16□□□□□ -0.3
SVF1Q05515 GBP2YCL011C 1284 nt13.15□□□□□ -0.3
SVF1Q05515 YDR433WYDR433W 441 nt13.13□□□□□ -0.31
SVF1Q05515 YMR057CYMR057C 372 nt13.11□□□□□ -0.31
SVF1Q05515 DCW1YKL046C 1350 nt13.09□□□□□ -0.31
SVF1Q05515 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt13.08□□□□□ -0.32
SVF1Q05515 ADO1YJR105W 1023 nt13.04□□□□□ -0.32
SVF1Q05515 SPP1YPL138C 1062 nt13.01□□□□□ -0.33
SVF1Q05515 EMI2YDR516C 1503 nt13□□□□□ -0.33
SVF1Q05515 TCD2YKL027W 1344 nt12.99□□□□□ -0.33
SVF1Q05515 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.99□□□□□ -0.33
SVF1Q05515 YEL076CYEL076C 651 nt12.99□□□□□ -0.33
SVF1Q05515 YLR464WYLR464W 651 nt12.99□□□□□ -0.33
SVF1Q05515 RTG1YOL067C 534 nt12.98□□□□□ -0.33
SVF1Q05515 FPS1YLL043W 2010 nt12.97□□□□□ -0.33
SVF1Q05515 MXR2YCL033C 507 nt12.97□□□□□ -0.33
SVF1Q05515 RDN37-1RDN37-1 5354 nt12.96□□□□□ -0.33
SVF1Q05515 RDN37-2RDN37-2 5354 nt12.96□□□□□ -0.33
SVF1Q05515 YDL221WYDL221W 552 nt12.96□□□□□ -0.33
SVF1Q05515 YMR090WYMR090W 684 nt12.94□□□□□ -0.34
SVF1Q05515 IRC15YPL017C 1500 nt12.93□□□□□ -0.34
SVF1Q05515 CUE1YMR264W 612 nt12.9□□□□□ -0.34
SVF1Q05515 DED1YOR204W 1815 nt12.9□□□□□ -0.34
SVF1Q05515 SSA4YER103W 1929 nt12.9□□□□□ -0.35
SVF1Q05515 RRD1YIL153W 1182 nt12.89□□□□□ -0.35
SVF1Q05515 RTS2YOR077W 699 nt12.86□□□□□ -0.35
SVF1Q05515 YJL225CYJL225C 5277 nt12.84□□□□□ -0.35
SVF1Q05515 FRD1YEL047C 1413 nt12.84□□□□□ -0.35
SVF1Q05515 GIS3YLR094C 1509 nt12.81□□□□□ -0.36
SVF1Q05515 SOR2YDL246C 1074 nt12.8□□□□□ -0.36
SVF1Q05515 SOR1YJR159W 1074 nt12.8□□□□□ -0.36
SVF1Q05515 FMP52YER004W 696 nt12.78□□□□□ -0.36
SVF1Q05515 SDH1YKL148C 1923 nt12.74□□□□□ -0.37
SVF1Q05515 HUA1YGR268C 597 nt12.74□□□□□ -0.37
SVF1Q05515 FMT1YBL013W 1206 nt12.74□□□□□ -0.37
SVF1Q05515 YCL042WYCL042W 360 nt12.73□□□□□ -0.37
SVF1Q05515 SCC4YER147C 1875 nt12.7□□□□□ -0.38
SVF1Q05515 YIL100WYIL100W 354 nt12.69□□□□□ -0.38
SVF1Q05515 YBR220CYBR220C 1683 nt12.68□□□□□ -0.38
SVF1Q05515 YLR235CYLR235C 399 nt12.68□□□□□ -0.38
SVF1Q05515 YKL030WYKL030W 606 nt12.63□□□□□ -0.39
SVF1Q05515 UBX6YJL048C 1191 nt12.62□□□□□ -0.39
SVF1Q05515 YDR094WYDR094W 336 nt12.58□□□□□ -0.4
SVF1Q05515 PTH1YHR189W 573 nt12.56□□□□□ -0.4
SVF1Q05515 CWP1YKL096W 720 nt12.54□□□□□ -0.4
SVF1Q05515 ADH2YMR303C 1047 nt12.52□□□□□ -0.41
SVF1Q05515 LCB1YMR296C 1677 nt12.5□□□□□ -0.41
SVF1Q05515 BDF1YLR399C 2061 nt12.5□□□□□ -0.41
SVF1Q05515 PCM1YEL058W 1674 nt12.48□□□□□ -0.41
SVF1Q05515 SNF6YHL025W 999 nt12.45□□□□□ -0.42
SVF1Q05515 YNL195CYNL195C 786 nt12.44□□□□□ -0.42
SVF1Q05515 NME1NME1 340 nt12.43□□□□□ -0.42
SVF1Q05515 DIC1YLR348C 897 nt12.42□□□□□ -0.42
SVF1Q05515 TIM23YNR017W 669 nt12.42□□□□□ -0.42
SVF1Q05515 RNQ1YCL028W 1218 nt12.42□□□□□ -0.42
SVF1Q05515 YIH1YCR059C 777 nt12.41□□□□□ -0.42
SVF1Q05515 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt12.35□□□□□ -0.43
SVF1Q05515 TAT1YBR069C 1860 nt12.35□□□□□ -0.43
SVF1Q05515 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt12.31□□□□□ -0.44
SVF1Q05515 RRT12YCR045C 1476 nt12.3□□□□□ -0.44
SVF1Q05515 YLR179CYLR179C 606 nt12.3□□□□□ -0.44
SVF1Q05515 YPR064WYPR064W 420 nt12.3□□□□□ -0.44
SVF1Q05515 YFR018CYFR018C 1092 nt12.29□□□□□ -0.44
SVF1Q05515 AHT1YHR093W 549 nt12.29□□□□□ -0.44
SVF1Q05515 PAC11YDR488C 1602 nt12.29□□□□□ -0.44
SVF1Q05515 YSC84YHR016C 1407 nt12.28□□□□□ -0.44
SVF1Q05515 YHL050CYHL050C 2094 nt12.28□□□□□ -0.44
SVF1Q05515 SEC11YIR022W 504 nt12.26□□□□□ -0.45
SVF1Q05515 AQY1YPR192W 918 nt12.26□□□□□ -0.45
SVF1Q05515 NVJ2YPR091C 2313 nt12.25□□□□□ -0.45
SVF1Q05515 TAD3YLR316C 969 nt12.25□□□□□ -0.45
SVF1Q05515 WSC2YNL283C 1512 nt12.25□□□□□ -0.45
SVF1Q05515 BIO4YNR057C 714 nt12.22□□□□□ -0.45
SVF1Q05515 YLL053CYLL053C 459 nt12.21□□□□□ -0.45
SVF1Q05515 FTR1YER145C 1215 nt12.18□□□□□ -0.46
SVF1Q05515 SIM1YIL123W 1431 nt12.17□□□□□ -0.46
SVF1Q05515 RRT5YFR032C 870 nt12.14□□□□□ -0.47
SVF1Q05515 GAL1YBR020W 1587 nt12.13□□□□□ -0.47
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