Protein–RNA interactions for Protein: Q04623

ECM18, Protein ECM18, yeastyeast

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ECM18Q04623 PTP1YDL230W 1008 nt10.37□□□□□ -0.75
ECM18Q04623 YOR139CYOR139C 393 nt10.37□□□□□ -0.75
ECM18Q04623 EMI2YDR516C 1503 nt10.36□□□□□ -0.75
ECM18Q04623 RPM1RPM1 483 nt10.33□□□□□ -0.76
ECM18Q04623 SIS1YNL007C 1059 nt10.33□□□□□ -0.76
ECM18Q04623 YMR090WYMR090W 684 nt10.3□□□□□ -0.76
ECM18Q04623 CAC2YML102W 1407 nt10.3□□□□□ -0.76
ECM18Q04623 YBR220CYBR220C 1683 nt10.28□□□□□ -0.76
ECM18Q04623 YDL221WYDL221W 552 nt10.27□□□□□ -0.77
ECM18Q04623 TAT1YBR069C 1860 nt10.26□□□□□ -0.77
ECM18Q04623 YCH1YGR203W 447 nt10.2□□□□□ -0.78
ECM18Q04623 SDH1YKL148C 1923 nt10.19□□□□□ -0.78
ECM18Q04623 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.19□□□□□ -0.78
ECM18Q04623 YJL225CYJL225C 5277 nt10.17□□□□□ -0.78
ECM18Q04623 YJL152WYJL152W 360 nt10.17□□□□□ -0.78
ECM18Q04623 IRC15YPL017C 1500 nt10.16□□□□□ -0.78
ECM18Q04623 PET9YBL030C 957 nt10.15□□□□□ -0.78
ECM18Q04623 ART5YGR068C 1761 nt10.14□□□□□ -0.79
ECM18Q04623 YLR281CYLR281C 468 nt10.13□□□□□ -0.79
ECM18Q04623 WHI5YOR083W 888 nt10.13□□□□□ -0.79
ECM18Q04623 GFD2YCL036W 1701 nt10.12□□□□□ -0.79
ECM18Q04623 TIR4YOR009W 1464 nt10.09□□□□□ -0.79
ECM18Q04623 SCC4YER147C 1875 nt10.08□□□□□ -0.8
ECM18Q04623 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.07□□□□□ -0.8
ECM18Q04623 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.07□□□□□ -0.8
ECM18Q04623 GIS3YLR094C 1509 nt10.07□□□□□ -0.8
ECM18Q04623 PUS2YGL063W 1113 nt10.05□□□□□ -0.8
ECM18Q04623 IMP2'YIL154C 1041 nt10.03□□□□□ -0.8
ECM18Q04623 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.02□□□□□ -0.81
ECM18Q04623 YMR057CYMR057C 372 nt10.01□□□□□ -0.81
ECM18Q04623 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10□□□□□ -0.81
ECM18Q04623 IMT4tM(CAU)E 72 nt10□□□□□ -0.81
ECM18Q04623 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10□□□□□ -0.81
ECM18Q04623 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10□□□□□ -0.81
ECM18Q04623 IMT2tM(CAU)P 72 nt10□□□□□ -0.81
ECM18Q04623 RTS2YOR077W 699 nt10□□□□□ -0.81
ECM18Q04623 IDH1YNL037C 1083 nt9.99□□□□□ -0.81
ECM18Q04623 FRE6YLL051C 2139 nt9.96□□□□□ -0.82
ECM18Q04623 CUE1YMR264W 612 nt9.95□□□□□ -0.82
ECM18Q04623 DSK2YMR276W 1122 nt9.95□□□□□ -0.82
ECM18Q04623 SEC11YIR022W 504 nt9.94□□□□□ -0.82
ECM18Q04623 YIL100WYIL100W 354 nt9.92□□□□□ -0.82
ECM18Q04623 YLR236CYLR236C 324 nt9.92□□□□□ -0.82
ECM18Q04623 PCH2YBR186W 1695 nt9.92□□□□□ -0.82
ECM18Q04623 GUT2YIL155C 1950 nt9.88□□□□□ -0.83
ECM18Q04623 GBP2YCL011C 1284 nt9.87□□□□□ -0.83
ECM18Q04623 YSC84YHR016C 1407 nt9.86□□□□□ -0.83
ECM18Q04623 YNL195CYNL195C 786 nt9.84□□□□□ -0.83
ECM18Q04623 YHL050CYHL050C 2094 nt9.84□□□□□ -0.83
ECM18Q04623 UME6YDR207C 2511 nt9.82□□□□□ -0.84
ECM18Q04623 YDR433WYDR433W 441 nt9.8□□□□□ -0.84
ECM18Q04623 TCD2YKL027W 1344 nt9.8□□□□□ -0.84
ECM18Q04623 FMP45YDL222C 930 nt9.79□□□□□ -0.84
ECM18Q04623 RRT12YCR045C 1476 nt9.78□□□□□ -0.84
ECM18Q04623 PIB2YGL023C 1908 nt9.78□□□□□ -0.84
ECM18Q04623 ERV46YAL042W 1248 nt9.71□□□□□ -0.86
ECM18Q04623 YPR011CYPR011C 981 nt9.7□□□□□ -0.86
ECM18Q04623 FMP52YER004W 696 nt9.67□□□□□ -0.86
ECM18Q04623 YKR040CYKR040C 504 nt9.67□□□□□ -0.86
ECM18Q04623 RRD1YIL153W 1182 nt9.66□□□□□ -0.86
ECM18Q04623 LPX1YOR084W 1164 nt9.66□□□□□ -0.86
ECM18Q04623 RTF1YGL244W 1677 nt9.66□□□□□ -0.86
ECM18Q04623 MXR2YCL033C 507 nt9.62□□□□□ -0.87
ECM18Q04623 YCL042WYCL042W 360 nt9.62□□□□□ -0.87
ECM18Q04623 BOP3YNL042W 1191 nt9.61□□□□□ -0.87
ECM18Q04623 NCP1YHR042W 2076 nt9.59□□□□□ -0.87
ECM18Q04623 DED1YOR204W 1815 nt9.59□□□□□ -0.88
ECM18Q04623 PTK1YKL198C 1989 nt9.55□□□□□ -0.88
ECM18Q04623 SSN3YPL042C 1668 nt9.53□□□□□ -0.88
ECM18Q04623 SOR2YDL246C 1074 nt9.53□□□□□ -0.88
ECM18Q04623 SOR1YJR159W 1074 nt9.53□□□□□ -0.88
ECM18Q04623 CWP1YKL096W 720 nt9.53□□□□□ -0.88
ECM18Q04623 SNF6YHL025W 999 nt9.51□□□□□ -0.89
ECM18Q04623 FMT1YBL013W 1206 nt9.5□□□□□ -0.89
ECM18Q04623 PCM1YEL058W 1674 nt9.5□□□□□ -0.89
ECM18Q04623 LCB1YMR296C 1677 nt9.48□□□□□ -0.89
ECM18Q04623 ADH2YMR303C 1047 nt9.47□□□□□ -0.89
ECM18Q04623 FRD1YEL047C 1413 nt9.47□□□□□ -0.89
ECM18Q04623 BSP1YPR171W 1731 nt9.45□□□□□ -0.9
ECM18Q04623 SIM1YIL123W 1431 nt9.41□□□□□ -0.9
ECM18Q04623 YLR235CYLR235C 399 nt9.39□□□□□ -0.91
ECM18Q04623 SPP1YPL138C 1062 nt9.38□□□□□ -0.91
ECM18Q04623 RNQ1YCL028W 1218 nt9.36□□□□□ -0.91
ECM18Q04623 YIH1YCR059C 777 nt9.35□□□□□ -0.91
ECM18Q04623 BIO4YNR057C 714 nt9.34□□□□□ -0.91
ECM18Q04623 DIC1YLR348C 897 nt9.33□□□□□ -0.92
ECM18Q04623 PTH1YHR189W 573 nt9.32□□□□□ -0.92
ECM18Q04623 LYS4YDR234W 2082 nt9.32□□□□□ -0.92
ECM18Q04623 YFL054CYFL054C 1941 nt9.31□□□□□ -0.92
ECM18Q04623 ERF2YLR246W 1080 nt9.29□□□□□ -0.92
ECM18Q04623 YKL030WYKL030W 606 nt9.28□□□□□ -0.92
ECM18Q04623 SPT8YLR055C 1809 nt9.28□□□□□ -0.92
ECM18Q04623 YLL053CYLL053C 459 nt9.27□□□□□ -0.93
ECM18Q04623 MRPL8YJL063C 717 nt9.25□□□□□ -0.93
ECM18Q04623 TIM23YNR017W 669 nt9.25□□□□□ -0.93
ECM18Q04623 AQY1YPR192W 918 nt9.24□□□□□ -0.93
ECM18Q04623 ADO1YJR105W 1023 nt9.23□□□□□ -0.93
ECM18Q04623 YLR179CYLR179C 606 nt9.22□□□□□ -0.93
ECM18Q04623 FTR1YER145C 1215 nt9.21□□□□□ -0.94
ECM18Q04623 YFL067WYFL067W 528 nt9.21□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 34 ms