Protein–RNA interactions for Protein: Q04007

SND1, SRP-independent targeting protein 1, yeastyeast

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Length 877 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SND1Q04007 BDF1YLR399C 2061 nt12.72□□□□□ -0.37
SND1Q04007 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.7□□□□□ -0.38
SND1Q04007 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.7□□□□□ -0.38
SND1Q04007 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.7□□□□□ -0.38
SND1Q04007 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.7□□□□□ -0.38
SND1Q04007 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.7□□□□□ -0.38
SND1Q04007 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.7□□□□□ -0.38
SND1Q04007 PUS2YGL063W 1113 nt12.66□□□□□ -0.38
SND1Q04007 PTP1YDL230W 1008 nt12.65□□□□□ -0.38
SND1Q04007 YJL152WYJL152W 360 nt12.61□□□□□ -0.39
SND1Q04007 EMI2YDR516C 1503 nt12.59□□□□□ -0.39
SND1Q04007 CAC2YML102W 1407 nt12.58□□□□□ -0.4
SND1Q04007 ART5YGR068C 1761 nt12.55□□□□□ -0.4
SND1Q04007 TIR4YOR009W 1464 nt12.54□□□□□ -0.4
SND1Q04007 YCH1YGR203W 447 nt12.54□□□□□ -0.4
SND1Q04007 TAT1YBR069C 1860 nt12.53□□□□□ -0.4
SND1Q04007 PET9YBL030C 957 nt12.52□□□□□ -0.41
SND1Q04007 YBR220CYBR220C 1683 nt12.51□□□□□ -0.41
SND1Q04007 YMR090WYMR090W 684 nt12.51□□□□□ -0.41
SND1Q04007 YDL221WYDL221W 552 nt12.49□□□□□ -0.41
SND1Q04007 IMP2'YIL154C 1041 nt12.49□□□□□ -0.41
SND1Q04007 GFD2YCL036W 1701 nt12.48□□□□□ -0.41
SND1Q04007 DSK2YMR276W 1122 nt12.47□□□□□ -0.41
SND1Q04007 YMR057CYMR057C 372 nt12.43□□□□□ -0.42
SND1Q04007 SDH1YKL148C 1923 nt12.41□□□□□ -0.42
SND1Q04007 IDH1YNL037C 1083 nt12.4□□□□□ -0.42
SND1Q04007 IRC15YPL017C 1500 nt12.4□□□□□ -0.42
SND1Q04007 YLR236CYLR236C 324 nt12.36□□□□□ -0.43
SND1Q04007 RTS2YOR077W 699 nt12.35□□□□□ -0.43
SND1Q04007 YPR011CYPR011C 981 nt12.35□□□□□ -0.43
SND1Q04007 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.35□□□□□ -0.43
SND1Q04007 FMP45YDL222C 930 nt12.33□□□□□ -0.44
SND1Q04007 GIS3YLR094C 1509 nt12.29□□□□□ -0.44
SND1Q04007 GBP2YCL011C 1284 nt12.27□□□□□ -0.45
SND1Q04007 SCC4YER147C 1875 nt12.27□□□□□ -0.45
SND1Q04007 CUE1YMR264W 612 nt12.25□□□□□ -0.45
SND1Q04007 FPS1YLL043W 2010 nt12.23□□□□□ -0.45
SND1Q04007 YDR433WYDR433W 441 nt12.22□□□□□ -0.45
SND1Q04007 ERV46YAL042W 1248 nt12.18□□□□□ -0.46
SND1Q04007 LPX1YOR084W 1164 nt12.17□□□□□ -0.46
SND1Q04007 TCD2YKL027W 1344 nt12.14□□□□□ -0.47
SND1Q04007 YIL100WYIL100W 354 nt12.14□□□□□ -0.47
SND1Q04007 YKR040CYKR040C 504 nt12.12□□□□□ -0.47
SND1Q04007 MXR2YCL033C 507 nt12.09□□□□□ -0.47
SND1Q04007 PCH2YBR186W 1695 nt12.06□□□□□ -0.48
SND1Q04007 RRD1YIL153W 1182 nt12.05□□□□□ -0.48
SND1Q04007 GUT2YIL155C 1950 nt12.03□□□□□ -0.48
SND1Q04007 YHL050CYHL050C 2094 nt12.02□□□□□ -0.48
SND1Q04007 DED1YOR204W 1815 nt12.02□□□□□ -0.49
SND1Q04007 YSC84YHR016C 1407 nt12.02□□□□□ -0.49
SND1Q04007 SEC11YIR022W 504 nt12□□□□□ -0.49
SND1Q04007 YNL195CYNL195C 786 nt11.99□□□□□ -0.49
SND1Q04007 PIB2YGL023C 1908 nt11.98□□□□□ -0.49
SND1Q04007 RRT12YCR045C 1476 nt11.95□□□□□ -0.5
SND1Q04007 FMP52YER004W 696 nt11.93□□□□□ -0.5
SND1Q04007 SPP1YPL138C 1062 nt11.93□□□□□ -0.5
SND1Q04007 YCL042WYCL042W 360 nt11.92□□□□□ -0.5
SND1Q04007 FMT1YBL013W 1206 nt11.91□□□□□ -0.5
SND1Q04007 FRD1YEL047C 1413 nt11.88□□□□□ -0.51
SND1Q04007 SOR2YDL246C 1074 nt11.85□□□□□ -0.51
SND1Q04007 SOR1YJR159W 1074 nt11.85□□□□□ -0.51
SND1Q04007 CWP1YKL096W 720 nt11.83□□□□□ -0.52
SND1Q04007 ADH2YMR303C 1047 nt11.79□□□□□ -0.52
SND1Q04007 PCM1YEL058W 1674 nt11.78□□□□□ -0.52
SND1Q04007 SNF6YHL025W 999 nt11.75□□□□□ -0.53
SND1Q04007 RTF1YGL244W 1677 nt11.75□□□□□ -0.53
SND1Q04007 MRPL8YJL063C 717 nt11.74□□□□□ -0.53
SND1Q04007 NCP1YHR042W 2076 nt11.74□□□□□ -0.53
SND1Q04007 RTG1YOL067C 534 nt11.7□□□□□ -0.54
SND1Q04007 PTH1YHR189W 573 nt11.69□□□□□ -0.54
SND1Q04007 YLR235CYLR235C 399 nt11.69□□□□□ -0.54
SND1Q04007 PTK1YKL198C 1989 nt11.67□□□□□ -0.54
SND1Q04007 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.66□□□□□ -0.54
SND1Q04007 YEL076CYEL076C 651 nt11.66□□□□□ -0.54
SND1Q04007 ADO1YJR105W 1023 nt11.66□□□□□ -0.54
SND1Q04007 YLR464WYLR464W 651 nt11.66□□□□□ -0.54
SND1Q04007 BOP3YNL042W 1191 nt11.64□□□□□ -0.55
SND1Q04007 PAC11YDR488C 1602 nt11.63□□□□□ -0.55
SND1Q04007 YKL030WYKL030W 606 nt11.61□□□□□ -0.55
SND1Q04007 RNQ1YCL028W 1218 nt11.61□□□□□ -0.55
SND1Q04007 SIM1YIL123W 1431 nt11.6□□□□□ -0.55
SND1Q04007 YIH1YCR059C 777 nt11.6□□□□□ -0.55
SND1Q04007 DIC1YLR348C 897 nt11.6□□□□□ -0.55
SND1Q04007 LCB1YMR296C 1677 nt11.59□□□□□ -0.55
SND1Q04007 HUA1YGR268C 597 nt11.56□□□□□ -0.56
SND1Q04007 BIO4YNR057C 714 nt11.56□□□□□ -0.56
SND1Q04007 TIM23YNR017W 669 nt11.53□□□□□ -0.56
SND1Q04007 YLL053CYLL053C 459 nt11.51□□□□□ -0.57
SND1Q04007 YLR179CYLR179C 606 nt11.48□□□□□ -0.57
SND1Q04007 FTR1YER145C 1215 nt11.42□□□□□ -0.58
SND1Q04007 ERF2YLR246W 1080 nt11.41□□□□□ -0.58
SND1Q04007 LYS4YDR234W 2082 nt11.39□□□□□ -0.59
SND1Q04007 YPR064WYPR064W 420 nt11.39□□□□□ -0.59
SND1Q04007 AQY1YPR192W 918 nt11.39□□□□□ -0.59
SND1Q04007 GAL1YBR020W 1587 nt11.38□□□□□ -0.59
SND1Q04007 TRM5YHR070W 1500 nt11.36□□□□□ -0.59
SND1Q04007 YFL067WYFL067W 528 nt11.34□□□□□ -0.59
SND1Q04007 AHT1YHR093W 549 nt11.34□□□□□ -0.59
SND1Q04007 DDR2YOL052C-A 186 nt11.33□□□□□ -0.6
SND1Q04007 ATF2YGR177C 1608 nt11.32□□□□□ -0.6
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