Protein–RNA interactions for Protein: Q03654

CEF1, Pre-mRNA-splicing factor CEF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 590 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CEF1Q03654 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.28□□□□□ -0.28
CEF1Q03654 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.28□□□□□ -0.28
CEF1Q03654 WHI5YOR083W 888 nt13.22□□□□□ -0.29
CEF1Q03654 PTP1YDL230W 1008 nt13.21□□□□□ -0.29
CEF1Q03654 RPP2AYOL039W 321 nt13.19□□□□□ -0.3
CEF1Q03654 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.17□□□□□ -0.3
CEF1Q03654 DCW1YKL046C 1350 nt13.12□□□□□ -0.31
CEF1Q03654 PUS2YGL063W 1113 nt13.1□□□□□ -0.31
CEF1Q03654 NVJ2YPR091C 2313 nt13.05□□□□□ -0.32
CEF1Q03654 TIR4YOR009W 1464 nt13.04□□□□□ -0.32
CEF1Q03654 CAC2YML102W 1407 nt13.04□□□□□ -0.32
CEF1Q03654 SSA4YER103W 1929 nt13.02□□□□□ -0.32
CEF1Q03654 YCH1YGR203W 447 nt13.01□□□□□ -0.33
CEF1Q03654 ART5YGR068C 1761 nt13.01□□□□□ -0.33
CEF1Q03654 PET9YBL030C 957 nt12.98□□□□□ -0.33
CEF1Q03654 GFD2YCL036W 1701 nt12.98□□□□□ -0.33
CEF1Q03654 IMP2'YIL154C 1041 nt12.97□□□□□ -0.33
CEF1Q03654 EMI2YDR516C 1503 nt12.97□□□□□ -0.33
CEF1Q03654 YPR011CYPR011C 981 nt12.96□□□□□ -0.33
CEF1Q03654 DSK2YMR276W 1122 nt12.95□□□□□ -0.34
CEF1Q03654 YLR236CYLR236C 324 nt12.92□□□□□ -0.34
CEF1Q03654 YJL152WYJL152W 360 nt12.91□□□□□ -0.34
CEF1Q03654 YDL221WYDL221W 552 nt12.9□□□□□ -0.34
CEF1Q03654 IRC15YPL017C 1500 nt12.87□□□□□ -0.35
CEF1Q03654 YMR057CYMR057C 372 nt12.84□□□□□ -0.35
CEF1Q03654 YMR090WYMR090W 684 nt12.81□□□□□ -0.36
CEF1Q03654 IDH1YNL037C 1083 nt12.79□□□□□ -0.36
CEF1Q03654 FMP45YDL222C 930 nt12.76□□□□□ -0.37
CEF1Q03654 PAC11YDR488C 1602 nt12.75□□□□□ -0.37
CEF1Q03654 YBR220CYBR220C 1683 nt12.74□□□□□ -0.37
CEF1Q03654 ERV46YAL042W 1248 nt12.74□□□□□ -0.37
CEF1Q03654 GIS3YLR094C 1509 nt12.73□□□□□ -0.37
CEF1Q03654 SDH1YKL148C 1923 nt12.73□□□□□ -0.37
CEF1Q03654 RTS2YOR077W 699 nt12.72□□□□□ -0.37
CEF1Q03654 CUE1YMR264W 612 nt12.7□□□□□ -0.38
CEF1Q03654 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.68□□□□□ -0.38
CEF1Q03654 LPX1YOR084W 1164 nt12.67□□□□□ -0.38
CEF1Q03654 GBP2YCL011C 1284 nt12.67□□□□□ -0.38
CEF1Q03654 SCC4YER147C 1875 nt12.65□□□□□ -0.38
CEF1Q03654 YDR433WYDR433W 441 nt12.59□□□□□ -0.39
CEF1Q03654 RRD1YIL153W 1182 nt12.59□□□□□ -0.39
CEF1Q03654 YKR040CYKR040C 504 nt12.59□□□□□ -0.39
CEF1Q03654 DED1YOR204W 1815 nt12.58□□□□□ -0.4
CEF1Q03654 BDF1YLR399C 2061 nt12.57□□□□□ -0.4
CEF1Q03654 MXR2YCL033C 507 nt12.54□□□□□ -0.4
CEF1Q03654 TCD2YKL027W 1344 nt12.54□□□□□ -0.4
CEF1Q03654 YIL100WYIL100W 354 nt12.45□□□□□ -0.42
CEF1Q03654 FMT1YBL013W 1206 nt12.44□□□□□ -0.42
CEF1Q03654 SPP1YPL138C 1062 nt12.44□□□□□ -0.42
CEF1Q03654 FMP52YER004W 696 nt12.42□□□□□ -0.42
CEF1Q03654 TAT1YBR069C 1860 nt12.41□□□□□ -0.42
CEF1Q03654 FRD1YEL047C 1413 nt12.4□□□□□ -0.42
CEF1Q03654 SOR2YDL246C 1074 nt12.4□□□□□ -0.42
CEF1Q03654 SOR1YJR159W 1074 nt12.4□□□□□ -0.42
CEF1Q03654 MRPL8YJL063C 717 nt12.32□□□□□ -0.44
CEF1Q03654 YHL050CYHL050C 2094 nt12.31□□□□□ -0.44
CEF1Q03654 RTG1YOL067C 534 nt12.31□□□□□ -0.44
CEF1Q03654 YSC84YHR016C 1407 nt12.29□□□□□ -0.44
CEF1Q03654 RRT12YCR045C 1476 nt12.28□□□□□ -0.44
CEF1Q03654 SEC11YIR022W 504 nt12.26□□□□□ -0.45
CEF1Q03654 YCL042WYCL042W 360 nt12.26□□□□□ -0.45
CEF1Q03654 YNL195CYNL195C 786 nt12.25□□□□□ -0.45
CEF1Q03654 ADH2YMR303C 1047 nt12.23□□□□□ -0.45
CEF1Q03654 PCM1YEL058W 1674 nt12.22□□□□□ -0.45
CEF1Q03654 CWP1YKL096W 720 nt12.21□□□□□ -0.45
CEF1Q03654 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.2□□□□□ -0.46
CEF1Q03654 YEL076CYEL076C 651 nt12.2□□□□□ -0.46
CEF1Q03654 YLR464WYLR464W 651 nt12.2□□□□□ -0.46
CEF1Q03654 PCH2YBR186W 1695 nt12.17□□□□□ -0.46
CEF1Q03654 YJL225CYJL225C 5277 nt12.16□□□□□ -0.46
CEF1Q03654 ADO1YJR105W 1023 nt12.13□□□□□ -0.47
CEF1Q03654 GUT2YIL155C 1950 nt12.12□□□□□ -0.47
CEF1Q03654 SNF6YHL025W 999 nt12.11□□□□□ -0.47
CEF1Q03654 YLR235CYLR235C 399 nt12.11□□□□□ -0.47
CEF1Q03654 RDN37-1RDN37-1 5354 nt12.1□□□□□ -0.47
CEF1Q03654 RDN37-2RDN37-2 5354 nt12.1□□□□□ -0.47
CEF1Q03654 YIH1YCR059C 777 nt12.09□□□□□ -0.47
CEF1Q03654 PTH1YHR189W 573 nt12.08□□□□□ -0.48
CEF1Q03654 RNQ1YCL028W 1218 nt12.06□□□□□ -0.48
CEF1Q03654 YKL030WYKL030W 606 nt12.05□□□□□ -0.48
CEF1Q03654 NCP1YHR042W 2076 nt12.05□□□□□ -0.48
CEF1Q03654 PIB2YGL023C 1908 nt12.03□□□□□ -0.48
CEF1Q03654 DIC1YLR348C 897 nt12.03□□□□□ -0.48
CEF1Q03654 LCB1YMR296C 1677 nt12.03□□□□□ -0.48
CEF1Q03654 BIO4YNR057C 714 nt12.01□□□□□ -0.49
CEF1Q03654 HUA1YGR268C 597 nt11.98□□□□□ -0.49
CEF1Q03654 UME6YDR207C 2511 nt11.98□□□□□ -0.49
CEF1Q03654 SIM1YIL123W 1431 nt11.96□□□□□ -0.49
CEF1Q03654 TIM23YNR017W 669 nt11.95□□□□□ -0.5
CEF1Q03654 RPM1RPM1 483 nt11.94□□□□□ -0.5
CEF1Q03654 YLL053CYLL053C 459 nt11.93□□□□□ -0.5
CEF1Q03654 RTF1YGL244W 1677 nt11.91□□□□□ -0.5
CEF1Q03654 BOP3YNL042W 1191 nt11.9□□□□□ -0.5
CEF1Q03654 FTR1YER145C 1215 nt11.88□□□□□ -0.51
CEF1Q03654 WSC2YNL283C 1512 nt11.86□□□□□ -0.51
CEF1Q03654 AHT1YHR093W 549 nt11.86□□□□□ -0.51
CEF1Q03654 YLR179CYLR179C 606 nt11.85□□□□□ -0.51
CEF1Q03654 LYS4YDR234W 2082 nt11.83□□□□□ -0.51
CEF1Q03654 AQY1YPR192W 918 nt11.83□□□□□ -0.52
CEF1Q03654 GAL1YBR020W 1587 nt11.83□□□□□ -0.52
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