Protein–RNA interactions for Protein: Q03330

GCN5, Histone acetyltransferase GCN5, yeastyeast

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN5Q03330 DSK2YMR276W 1122 nt12.74□□□□□ -0.37
GCN5Q03330 IMP2'YIL154C 1041 nt12.71□□□□□ -0.37
GCN5Q03330 YLR236CYLR236C 324 nt12.69□□□□□ -0.38
GCN5Q03330 FMP45YDL222C 930 nt12.67□□□□□ -0.38
GCN5Q03330 SIS1YNL007C 1059 nt12.65□□□□□ -0.38
GCN5Q03330 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.59□□□□□ -0.39
GCN5Q03330 YJL152WYJL152W 360 nt12.58□□□□□ -0.4
GCN5Q03330 YCH1YGR203W 447 nt12.57□□□□□ -0.4
GCN5Q03330 SPT5YML010W 3192 nt12.55□□□□□ -0.4
GCN5Q03330 RPP2AYOL039W 321 nt12.51□□□□□ -0.41
GCN5Q03330 TIR4YOR009W 1464 nt12.5□□□□□ -0.41
GCN5Q03330 MEP2YNL142W 1500 nt12.47□□□□□ -0.41
GCN5Q03330 IDH1YNL037C 1083 nt12.47□□□□□ -0.41
GCN5Q03330 PTP1YDL230W 1008 nt12.46□□□□□ -0.41
GCN5Q03330 ERV46YAL042W 1248 nt12.46□□□□□ -0.41
GCN5Q03330 LPX1YOR084W 1164 nt12.45□□□□□ -0.42
GCN5Q03330 ART5YGR068C 1761 nt12.41□□□□□ -0.42
GCN5Q03330 SSA4YER103W 1929 nt12.39□□□□□ -0.43
GCN5Q03330 PET9YBL030C 957 nt12.38□□□□□ -0.43
GCN5Q03330 MRPL8YJL063C 717 nt12.37□□□□□ -0.43
GCN5Q03330 YDR433WYDR433W 441 nt12.35□□□□□ -0.43
GCN5Q03330 CAC2YML102W 1407 nt12.35□□□□□ -0.43
GCN5Q03330 GBP2YCL011C 1284 nt12.34□□□□□ -0.43
GCN5Q03330 YKR040CYKR040C 504 nt12.33□□□□□ -0.44
GCN5Q03330 YMR057CYMR057C 372 nt12.33□□□□□ -0.44
GCN5Q03330 SPP1YPL138C 1062 nt12.33□□□□□ -0.44
GCN5Q03330 GFD2YCL036W 1701 nt12.33□□□□□ -0.44
GCN5Q03330 DCW1YKL046C 1350 nt12.29□□□□□ -0.44
GCN5Q03330 MXR2YCL033C 507 nt12.26□□□□□ -0.45
GCN5Q03330 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.24□□□□□ -0.45
GCN5Q03330 RTG1YOL067C 534 nt12.21□□□□□ -0.45
GCN5Q03330 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.19□□□□□ -0.46
GCN5Q03330 YEL076CYEL076C 651 nt12.19□□□□□ -0.46
GCN5Q03330 ADO1YJR105W 1023 nt12.19□□□□□ -0.46
GCN5Q03330 YLR464WYLR464W 651 nt12.19□□□□□ -0.46
GCN5Q03330 PAC11YDR488C 1602 nt12.17□□□□□ -0.46
GCN5Q03330 TCD2YKL027W 1344 nt12.16□□□□□ -0.46
GCN5Q03330 FPS1YLL043W 2010 nt12.15□□□□□ -0.46
GCN5Q03330 EMI2YDR516C 1503 nt12.15□□□□□ -0.46
GCN5Q03330 DED1YOR204W 1815 nt12.12□□□□□ -0.47
GCN5Q03330 RTS2YOR077W 699 nt12.11□□□□□ -0.47
GCN5Q03330 IRC15YPL017C 1500 nt12.11□□□□□ -0.47
GCN5Q03330 RRD1YIL153W 1182 nt12.1□□□□□ -0.47
GCN5Q03330 YDL221WYDL221W 552 nt12.08□□□□□ -0.48
GCN5Q03330 FRD1YEL047C 1413 nt12.05□□□□□ -0.48
GCN5Q03330 BDF1YLR399C 2061 nt12.05□□□□□ -0.48
GCN5Q03330 CUE1YMR264W 612 nt12.04□□□□□ -0.48
GCN5Q03330 YMR090WYMR090W 684 nt12.01□□□□□ -0.49
GCN5Q03330 GIS3YLR094C 1509 nt12□□□□□ -0.49
GCN5Q03330 FMT1YBL013W 1206 nt11.99□□□□□ -0.49
GCN5Q03330 NVJ2YPR091C 2313 nt11.97□□□□□ -0.49
GCN5Q03330 UBX6YJL048C 1191 nt11.96□□□□□ -0.49
GCN5Q03330 SOR2YDL246C 1074 nt11.94□□□□□ -0.5
GCN5Q03330 HUA1YGR268C 597 nt11.94□□□□□ -0.5
GCN5Q03330 SOR1YJR159W 1074 nt11.94□□□□□ -0.5
GCN5Q03330 YCL042WYCL042W 360 nt11.92□□□□□ -0.5
GCN5Q03330 SDH1YKL148C 1923 nt11.88□□□□□ -0.51
GCN5Q03330 FMP52YER004W 696 nt11.87□□□□□ -0.51
GCN5Q03330 PTH1YHR189W 573 nt11.87□□□□□ -0.51
GCN5Q03330 SCC4YER147C 1875 nt11.86□□□□□ -0.51
GCN5Q03330 YIL100WYIL100W 354 nt11.85□□□□□ -0.51
GCN5Q03330 YLR235CYLR235C 399 nt11.84□□□□□ -0.51
GCN5Q03330 TAT1YBR069C 1860 nt11.84□□□□□ -0.51
GCN5Q03330 YBR220CYBR220C 1683 nt11.84□□□□□ -0.51
GCN5Q03330 YKL030WYKL030W 606 nt11.83□□□□□ -0.52
GCN5Q03330 YDR094WYDR094W 336 nt11.8□□□□□ -0.52
GCN5Q03330 CWP1YKL096W 720 nt11.79□□□□□ -0.52
GCN5Q03330 ADH2YMR303C 1047 nt11.78□□□□□ -0.52
GCN5Q03330 LCB1YMR296C 1677 nt11.76□□□□□ -0.53
GCN5Q03330 PCM1YEL058W 1674 nt11.7□□□□□ -0.54
GCN5Q03330 SNF6YHL025W 999 nt11.64□□□□□ -0.55
GCN5Q03330 DIC1YLR348C 897 nt11.64□□□□□ -0.55
GCN5Q03330 TIM23YNR017W 669 nt11.64□□□□□ -0.55
GCN5Q03330 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.61□□□□□ -0.55
GCN5Q03330 YNL195CYNL195C 786 nt11.59□□□□□ -0.55
GCN5Q03330 RNQ1YCL028W 1218 nt11.59□□□□□ -0.55
GCN5Q03330 YIH1YCR059C 777 nt11.58□□□□□ -0.56
GCN5Q03330 RRT12YCR045C 1476 nt11.57□□□□□ -0.56
GCN5Q03330 Q0182Q0182 405 nt11.56□□□□□ -0.56
GCN5Q03330 YLR179CYLR179C 606 nt11.55□□□□□ -0.56
GCN5Q03330 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.54□□□□□ -0.56
GCN5Q03330 YSC84YHR016C 1407 nt11.51□□□□□ -0.57
GCN5Q03330 YFR018CYFR018C 1092 nt11.5□□□□□ -0.57
GCN5Q03330 YPR064WYPR064W 420 nt11.5□□□□□ -0.57
GCN5Q03330 YHL050CYHL050C 2094 nt11.5□□□□□ -0.57
GCN5Q03330 WSC2YNL283C 1512 nt11.49□□□□□ -0.57
GCN5Q03330 AHT1YHR093W 549 nt11.48□□□□□ -0.57
GCN5Q03330 TAD3YLR316C 969 nt11.46□□□□□ -0.57
GCN5Q03330 YLL053CYLL053C 459 nt11.45□□□□□ -0.58
GCN5Q03330 BIO4YNR057C 714 nt11.44□□□□□ -0.58
GCN5Q03330 PAU16YKL224C 372 nt11.42□□□□□ -0.58
GCN5Q03330 PRE6YOL038W 765 nt11.4□□□□□ -0.58
GCN5Q03330 SIM1YIL123W 1431 nt11.4□□□□□ -0.58
GCN5Q03330 FTR1YER145C 1215 nt11.39□□□□□ -0.59
GCN5Q03330 AQY1YPR192W 918 nt11.38□□□□□ -0.59
GCN5Q03330 RRT5YFR032C 870 nt11.37□□□□□ -0.59
GCN5Q03330 GAL1YBR020W 1587 nt11.36□□□□□ -0.59
GCN5Q03330 SEC11YIR022W 504 nt11.35□□□□□ -0.59
GCN5Q03330 TRM5YHR070W 1500 nt11.31□□□□□ -0.6
GCN5Q03330 BDH1YAL060W 1149 nt11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.8 ms