Protein–RNA interactions for Protein: Q03147

Cdk7, Cyclin-dependent kinase 7, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk7Q03147 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cdk7Q03147 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cdk7Q03147 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Cdk7Q03147 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cdk7Q03147 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cdk7Q03147 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cdk7Q03147 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cdk7Q03147 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cdk7Q03147 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cdk7Q03147 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cdk7Q03147 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Cdk7Q03147 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cdk7Q03147 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cdk7Q03147 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cdk7Q03147 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cdk7Q03147 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cdk7Q03147 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cdk7Q03147 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cdk7Q03147 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cdk7Q03147 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cdk7Q03147 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cdk7Q03147 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Cdk7Q03147 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Cdk7Q03147 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cdk7Q03147 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cdk7Q03147 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cdk7Q03147 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Cdk7Q03147 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cdk7Q03147 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Cdk7Q03147 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdk7Q03147 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cdk7Q03147 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cdk7Q03147 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdk7Q03147 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cdk7Q03147 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdk7Q03147 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdk7Q03147 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdk7Q03147 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdk7Q03147 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdk7Q03147 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdk7Q03147 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdk7Q03147 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdk7Q03147 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cdk7Q03147 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdk7Q03147 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdk7Q03147 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdk7Q03147 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdk7Q03147 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cdk7Q03147 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cdk7Q03147 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdk7Q03147 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdk7Q03147 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdk7Q03147 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cdk7Q03147 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdk7Q03147 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cdk7Q03147 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cdk7Q03147 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cdk7Q03147 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cdk7Q03147 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdk7Q03147 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdk7Q03147 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdk7Q03147 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdk7Q03147 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdk7Q03147 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cdk7Q03147 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cdk7Q03147 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cdk7Q03147 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdk7Q03147 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdk7Q03147 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdk7Q03147 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cdk7Q03147 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdk7Q03147 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdk7Q03147 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cdk7Q03147 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cdk7Q03147 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdk7Q03147 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdk7Q03147 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdk7Q03147 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdk7Q03147 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdk7Q03147 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdk7Q03147 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdk7Q03147 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdk7Q03147 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdk7Q03147 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdk7Q03147 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdk7Q03147 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdk7Q03147 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdk7Q03147 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cdk7Q03147 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cdk7Q03147 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdk7Q03147 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdk7Q03147 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdk7Q03147 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdk7Q03147 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdk7Q03147 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdk7Q03147 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdk7Q03147 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdk7Q03147 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdk7Q03147 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cdk7Q03147 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.3 ms