Protein–RNA interactions for Protein: Q03012

SPP1, COMPASS component SPP1, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPP1Q03012 PTC2YER089C 1395 nt13.68□□□□□ -0.22
SPP1Q03012 POA1YBR022W 534 nt13.66□□□□□ -0.22
SPP1Q03012 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.64□□□□□ -0.23
SPP1Q03012 AIR1YIL079C 1083 nt13.57□□□□□ -0.24
SPP1Q03012 BDH2YAL061W 1254 nt13.56□□□□□ -0.24
SPP1Q03012 ARP10YDR106W 855 nt13.52□□□□□ -0.25
SPP1Q03012 PUS2YGL063W 1113 nt13.47□□□□□ -0.25
SPP1Q03012 BUD23YCR047C 828 nt13.46□□□□□ -0.25
SPP1Q03012 YLR281CYLR281C 468 nt13.46□□□□□ -0.25
SPP1Q03012 LSM3YLR438C-A 270 nt13.42□□□□□ -0.26
SPP1Q03012 PET20YPL159C 762 nt13.42□□□□□ -0.26
SPP1Q03012 NAB2YGL122C 1578 nt13.41□□□□□ -0.26
SPP1Q03012 FIS1YIL065C 468 nt13.37□□□□□ -0.27
SPP1Q03012 WHI5YOR083W 888 nt13.37□□□□□ -0.27
SPP1Q03012 YBL100CYBL100C 315 nt13.36□□□□□ -0.27
SPP1Q03012 INM2YDR287W 879 nt13.35□□□□□ -0.27
SPP1Q03012 DAL1YIR027C 1383 nt13.33□□□□□ -0.27
SPP1Q03012 FPR4YLR449W 1179 nt13.32□□□□□ -0.28
SPP1Q03012 BSC6YOL137W 1494 nt13.3□□□□□ -0.28
SPP1Q03012 KTR3YBR205W 1215 nt13.28□□□□□ -0.28
SPP1Q03012 YNR068CYNR068C 819 nt13.26□□□□□ -0.29
SPP1Q03012 PHO4YFR034C 939 nt13.24□□□□□ -0.29
SPP1Q03012 ARA2YMR041C 1008 nt13.22□□□□□ -0.29
SPP1Q03012 FUN26YAL022C 1554 nt13.21□□□□□ -0.29
SPP1Q03012 YPR011CYPR011C 981 nt13.21□□□□□ -0.29
SPP1Q03012 TRM9YML014W 840 nt13.2□□□□□ -0.3
SPP1Q03012 PHO92YDR374C 921 nt13.19□□□□□ -0.3
SPP1Q03012 snR78snR78 87 nt13.18□□□□□ -0.3
SPP1Q03012 YLR236CYLR236C 324 nt13.17□□□□□ -0.3
SPP1Q03012 FMP45YDL222C 930 nt13.16□□□□□ -0.3
SPP1Q03012 NEM1YHR004C 1341 nt13.14□□□□□ -0.31
SPP1Q03012 DSK2YMR276W 1122 nt13.13□□□□□ -0.31
SPP1Q03012 YPL168WYPL168W 1293 nt13.13□□□□□ -0.31
SPP1Q03012 CCT6YDR188W 1641 nt13.09□□□□□ -0.31
SPP1Q03012 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.08□□□□□ -0.32
SPP1Q03012 RPM1RPM1 483 nt13.04□□□□□ -0.32
SPP1Q03012 YHL044WYHL044W 708 nt13.01□□□□□ -0.33
SPP1Q03012 YCH1YGR203W 447 nt13□□□□□ -0.33
SPP1Q03012 UTP6YDR449C 1323 nt12.99□□□□□ -0.33
SPP1Q03012 IMP2'YIL154C 1041 nt12.98□□□□□ -0.33
SPP1Q03012 SKG1YKR100C 1068 nt12.98□□□□□ -0.33
SPP1Q03012 ABZ2YMR289W 1125 nt12.97□□□□□ -0.33
SPP1Q03012 YLR122CYLR122C 378 nt12.94□□□□□ -0.34
SPP1Q03012 AST1YBL069W 1290 nt12.94□□□□□ -0.34
SPP1Q03012 FAR3YMR052W 615 nt12.93□□□□□ -0.34
SPP1Q03012 URE2YNL229C 1065 nt12.92□□□□□ -0.34
SPP1Q03012 ALF1YNL148C 765 nt12.9□□□□□ -0.34
SPP1Q03012 LPX1YOR084W 1164 nt12.9□□□□□ -0.34
SPP1Q03012 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.89□□□□□ -0.35
SPP1Q03012 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.89□□□□□ -0.35
SPP1Q03012 YDR008CYDR008C 351 nt12.87□□□□□ -0.35
SPP1Q03012 MRPL8YJL063C 717 nt12.87□□□□□ -0.35
SPP1Q03012 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt12.87□□□□□ -0.35
SPP1Q03012 YJL152WYJL152W 360 nt12.86□□□□□ -0.35
SPP1Q03012 SPP1YPL138C 1062 nt12.85□□□□□ -0.35
SPP1Q03012 YPS1YLR120C 1710 nt12.83□□□□□ -0.36
SPP1Q03012 STD1YOR047C 1335 nt12.83□□□□□ -0.36
SPP1Q03012 YDR095CYDR095C 411 nt12.82□□□□□ -0.36
SPP1Q03012 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt12.81□□□□□ -0.36
SPP1Q03012 ERV46YAL042W 1248 nt12.81□□□□□ -0.36
SPP1Q03012 IDH1YNL037C 1083 nt12.76□□□□□ -0.37
SPP1Q03012 TIR4YOR009W 1464 nt12.73□□□□□ -0.37
SPP1Q03012 SIS1YNL007C 1059 nt12.72□□□□□ -0.37
SPP1Q03012 PEX27YOR193W 1131 nt12.72□□□□□ -0.37
SPP1Q03012 YDR433WYDR433W 441 nt12.71□□□□□ -0.37
SPP1Q03012 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.71□□□□□ -0.37
SPP1Q03012 YEL076CYEL076C 651 nt12.71□□□□□ -0.37
SPP1Q03012 YLR464WYLR464W 651 nt12.71□□□□□ -0.37
SPP1Q03012 RTG1YOL067C 534 nt12.7□□□□□ -0.38
SPP1Q03012 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt12.69□□□□□ -0.38
SPP1Q03012 ADO1YJR105W 1023 nt12.68□□□□□ -0.38
SPP1Q03012 GTT3YEL017W 1014 nt12.66□□□□□ -0.38
SPP1Q03012 UBX6YJL048C 1191 nt12.65□□□□□ -0.38
SPP1Q03012 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.64□□□□□ -0.39
SPP1Q03012 MXR2YCL033C 507 nt12.64□□□□□ -0.39
SPP1Q03012 PUS9YDL036C 1389 nt12.64□□□□□ -0.39
SPP1Q03012 YKR040CYKR040C 504 nt12.63□□□□□ -0.39
SPP1Q03012 GBP2YCL011C 1284 nt12.62□□□□□ -0.39
SPP1Q03012 HAS1YMR290C 1518 nt12.58□□□□□ -0.4
SPP1Q03012 IRC14YOR135C 342 nt12.56□□□□□ -0.4
SPP1Q03012 RPP2AYOL039W 321 nt12.55□□□□□ -0.4
SPP1Q03012 ART5YGR068C 1761 nt12.54□□□□□ -0.4
SPP1Q03012 PTP1YDL230W 1008 nt12.52□□□□□ -0.41
SPP1Q03012 FTR1YER145C 1215 nt12.52□□□□□ -0.41
SPP1Q03012 YMR057CYMR057C 372 nt12.51□□□□□ -0.41
SPP1Q03012 YPL071CYPL071C 471 nt12.51□□□□□ -0.41
SPP1Q03012 CAC2YML102W 1407 nt12.5□□□□□ -0.41
SPP1Q03012 TOM20YGR082W 552 nt12.47□□□□□ -0.41
SPP1Q03012 GFD2YCL036W 1701 nt12.45□□□□□ -0.42
SPP1Q03012 PET9YBL030C 957 nt12.44□□□□□ -0.42
SPP1Q03012 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.44□□□□□ -0.42
SPP1Q03012 CUS2YNL286W 858 nt12.43□□□□□ -0.42
SPP1Q03012 MEP2YNL142W 1500 nt12.42□□□□□ -0.42
SPP1Q03012 NEJ1YLR265C 1029 nt12.41□□□□□ -0.42
SPP1Q03012 HMT1YBR034C 1047 nt12.4□□□□□ -0.42
SPP1Q03012 TCD2YKL027W 1344 nt12.39□□□□□ -0.43
SPP1Q03012 SPT5YML010W 3192 nt12.38□□□□□ -0.43
SPP1Q03012 HUA1YGR268C 597 nt12.38□□□□□ -0.43
SPP1Q03012 DED1YOR204W 1815 nt12.37□□□□□ -0.43
SPP1Q03012 LSM12YHR121W 564 nt12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.7 ms