Protein–RNA interactions for Protein: Q02983

RRN5, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN5, yeastyeast

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN5Q02983 NVJ2YPR091C 2313 nt11.7□□□□□ -0.54
RRN5Q02983 HOM6YJR139C 1080 nt11.69□□□□□ -0.54
RRN5Q02983 IRC15YPL017C 1500 nt11.61□□□□□ -0.55
RRN5Q02983 SCC4YER147C 1875 nt11.61□□□□□ -0.55
RRN5Q02983 ART5YGR068C 1761 nt11.6□□□□□ -0.55
RRN5Q02983 PAC11YDR488C 1602 nt11.58□□□□□ -0.56
RRN5Q02983 MNP1YGL068W 585 nt11.58□□□□□ -0.56
RRN5Q02983 GFD2YCL036W 1701 nt11.57□□□□□ -0.56
RRN5Q02983 GIS3YLR094C 1509 nt11.55□□□□□ -0.56
RRN5Q02983 RKM5YLR137W 1104 nt11.54□□□□□ -0.56
RRN5Q02983 YKL097CYKL097C 411 nt11.53□□□□□ -0.56
RRN5Q02983 PET9YBL030C 957 nt11.53□□□□□ -0.56
RRN5Q02983 RTS2YOR077W 699 nt11.49□□□□□ -0.57
RRN5Q02983 YCH1YGR203W 447 nt11.48□□□□□ -0.57
RRN5Q02983 SEC11YIR022W 504 nt11.47□□□□□ -0.57
RRN5Q02983 TIR4YOR009W 1464 nt11.43□□□□□ -0.58
RRN5Q02983 PCH2YBR186W 1695 nt11.43□□□□□ -0.58
RRN5Q02983 CUE1YMR264W 612 nt11.39□□□□□ -0.59
RRN5Q02983 YMR057CYMR057C 372 nt11.37□□□□□ -0.59
RRN5Q02983 GUT2YIL155C 1950 nt11.36□□□□□ -0.59
RRN5Q02983 YSC84YHR016C 1407 nt11.35□□□□□ -0.59
RRN5Q02983 NPL3YDR432W 1245 nt11.3□□□□□ -0.6
RRN5Q02983 YIL100WYIL100W 354 nt11.3□□□□□ -0.6
RRN5Q02983 YJL152WYJL152W 360 nt11.3□□□□□ -0.6
RRN5Q02983 YNL195CYNL195C 786 nt11.29□□□□□ -0.6
RRN5Q02983 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.27□□□□□ -0.61
RRN5Q02983 YOL037CYOL037C 354 nt11.27□□□□□ -0.61
RRN5Q02983 YHL050CYHL050C 2094 nt11.27□□□□□ -0.61
RRN5Q02983 RRT12YCR045C 1476 nt11.25□□□□□ -0.61
RRN5Q02983 MOT3YMR070W 1473 nt11.25□□□□□ -0.61
RRN5Q02983 YLR236CYLR236C 324 nt11.24□□□□□ -0.61
RRN5Q02983 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.2□□□□□ -0.62
RRN5Q02983 RTF1YGL244W 1677 nt11.14□□□□□ -0.63
RRN5Q02983 PIB2YGL023C 1908 nt11.13□□□□□ -0.63
RRN5Q02983 YOR139CYOR139C 393 nt11.11□□□□□ -0.63
RRN5Q02983 BOP3YNL042W 1191 nt11.1□□□□□ -0.63
RRN5Q02983 WHI5YOR083W 888 nt11.06□□□□□ -0.64
RRN5Q02983 YLR281CYLR281C 468 nt11.02□□□□□ -0.65
RRN5Q02983 IDH1YNL037C 1083 nt10.98□□□□□ -0.65
RRN5Q02983 PTK1YKL198C 1989 nt10.94□□□□□ -0.66
RRN5Q02983 GBP2YCL011C 1284 nt10.93□□□□□ -0.66
RRN5Q02983 NCP1YHR042W 2076 nt10.91□□□□□ -0.66
RRN5Q02983 RRD1YIL153W 1182 nt10.89□□□□□ -0.67
RRN5Q02983 RPM1RPM1 483 nt10.87□□□□□ -0.67
RRN5Q02983 TCD2YKL027W 1344 nt10.86□□□□□ -0.67
RRN5Q02983 FMP52YER004W 696 nt10.85□□□□□ -0.67
RRN5Q02983 IMP2'YIL154C 1041 nt10.84□□□□□ -0.67
RRN5Q02983 LCB1YMR296C 1677 nt10.84□□□□□ -0.67
RRN5Q02983 PUS2YGL063W 1113 nt10.82□□□□□ -0.68
RRN5Q02983 DED1YOR204W 1815 nt10.79□□□□□ -0.68
RRN5Q02983 DSK2YMR276W 1122 nt10.79□□□□□ -0.68
RRN5Q02983 PCM1YEL058W 1674 nt10.79□□□□□ -0.68
RRN5Q02983 YFL054CYFL054C 1941 nt10.78□□□□□ -0.68
RRN5Q02983 YJL225CYJL225C 5277 nt10.77□□□□□ -0.68
RRN5Q02983 SIM1YIL123W 1431 nt10.76□□□□□ -0.69
RRN5Q02983 YDR433WYDR433W 441 nt10.75□□□□□ -0.69
RRN5Q02983 FMT1YBL013W 1206 nt10.73□□□□□ -0.69
RRN5Q02983 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.72□□□□□ -0.69
RRN5Q02983 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.72□□□□□ -0.69
RRN5Q02983 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.72□□□□□ -0.69
RRN5Q02983 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.72□□□□□ -0.69
RRN5Q02983 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.72□□□□□ -0.69
RRN5Q02983 CWP1YKL096W 720 nt10.71□□□□□ -0.69
RRN5Q02983 SNF6YHL025W 999 nt10.7□□□□□ -0.7
RRN5Q02983 ADH2YMR303C 1047 nt10.69□□□□□ -0.7
RRN5Q02983 SPT8YLR055C 1809 nt10.68□□□□□ -0.7
RRN5Q02983 FMP45YDL222C 930 nt10.67□□□□□ -0.7
RRN5Q02983 MXR2YCL033C 507 nt10.67□□□□□ -0.7
RRN5Q02983 YPR011CYPR011C 981 nt10.65□□□□□ -0.7
RRN5Q02983 UME6YDR207C 2511 nt10.65□□□□□ -0.7
RRN5Q02983 BIO4YNR057C 714 nt10.64□□□□□ -0.71
RRN5Q02983 YCL042WYCL042W 360 nt10.64□□□□□ -0.71
RRN5Q02983 SOR2YDL246C 1074 nt10.61□□□□□ -0.71
RRN5Q02983 SOR1YJR159W 1074 nt10.61□□□□□ -0.71
RRN5Q02983 LYS4YDR234W 2082 nt10.61□□□□□ -0.71
RRN5Q02983 ERV46YAL042W 1248 nt10.59□□□□□ -0.71
RRN5Q02983 YKR040CYKR040C 504 nt10.58□□□□□ -0.72
RRN5Q02983 LPX1YOR084W 1164 nt10.57□□□□□ -0.72
RRN5Q02983 ERF2YLR246W 1080 nt10.54□□□□□ -0.72
RRN5Q02983 YIH1YCR059C 777 nt10.52□□□□□ -0.73
RRN5Q02983 FRD1YEL047C 1413 nt10.51□□□□□ -0.73
RRN5Q02983 RNQ1YCL028W 1218 nt10.5□□□□□ -0.73
RRN5Q02983 SWE1YJL187C 2460 nt10.49□□□□□ -0.73
RRN5Q02983 YLL053CYLL053C 459 nt10.49□□□□□ -0.73
RRN5Q02983 CRR1YLR213C 1269 nt10.47□□□□□ -0.73
RRN5Q02983 BOR1YNL275W 1731 nt10.45□□□□□ -0.74
RRN5Q02983 HEM12YDR047W 1089 nt10.42□□□□□ -0.74
RRN5Q02983 YFL067WYFL067W 528 nt10.4□□□□□ -0.74
RRN5Q02983 ATF2YGR177C 1608 nt10.4□□□□□ -0.75
RRN5Q02983 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.39□□□□□ -0.75
RRN5Q02983 FTR1YER145C 1215 nt10.38□□□□□ -0.75
RRN5Q02983 DIC1YLR348C 897 nt10.38□□□□□ -0.75
RRN5Q02983 MIC10YCL057C-A 294 nt10.36□□□□□ -0.75
RRN5Q02983 DDR2YOL052C-A 186 nt10.35□□□□□ -0.75
RRN5Q02983 GAL1YBR020W 1587 nt10.35□□□□□ -0.75
RRN5Q02983 TRM5YHR070W 1500 nt10.34□□□□□ -0.75
RRN5Q02983 SNG1YGR197C 1644 nt10.34□□□□□ -0.75
RRN5Q02983 RAX1YOR301W 1308 nt10.33□□□□□ -0.76
RRN5Q02983 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.28□□□□□ -0.76
RRN5Q02983 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8 ms