Protein–RNA interactions for Protein: Q02209

YKR011C, Uncharacterized protein YKR011C, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR011CQ02209 YDL221WYDL221W 552 nt11.34□□□□□ -0.59
YKR011CQ02209 YBR220CYBR220C 1683 nt11.28□□□□□ -0.6
YKR011CQ02209 YOL037CYOL037C 354 nt11.28□□□□□ -0.6
YKR011CQ02209 ART5YGR068C 1761 nt11.26□□□□□ -0.61
YKR011CQ02209 SDH1YKL148C 1923 nt11.24□□□□□ -0.61
YKR011CQ02209 GFD2YCL036W 1701 nt11.23□□□□□ -0.61
YKR011CQ02209 TAT1YBR069C 1860 nt11.22□□□□□ -0.61
YKR011CQ02209 IRC15YPL017C 1500 nt11.21□□□□□ -0.61
YKR011CQ02209 PET9YBL030C 957 nt11.21□□□□□ -0.61
YKR011CQ02209 YOR139CYOR139C 393 nt11.21□□□□□ -0.61
YKR011CQ02209 NPL3YDR432W 1245 nt11.19□□□□□ -0.62
YKR011CQ02209 YCH1YGR203W 447 nt11.19□□□□□ -0.62
YKR011CQ02209 TIR4YOR009W 1464 nt11.16□□□□□ -0.62
YKR011CQ02209 SCC4YER147C 1875 nt11.15□□□□□ -0.63
YKR011CQ02209 GIS3YLR094C 1509 nt11.14□□□□□ -0.63
YKR011CQ02209 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.12□□□□□ -0.63
YKR011CQ02209 RTS2YOR077W 699 nt11.1□□□□□ -0.63
YKR011CQ02209 YMR057CYMR057C 372 nt11.06□□□□□ -0.64
YKR011CQ02209 YJL152WYJL152W 360 nt11.05□□□□□ -0.64
YKR011CQ02209 CUE1YMR264W 612 nt11.03□□□□□ -0.64
YKR011CQ02209 YLR281CYLR281C 468 nt11.01□□□□□ -0.65
YKR011CQ02209 WHI5YOR083W 888 nt11□□□□□ -0.65
YKR011CQ02209 FPS1YLL043W 2010 nt10.96□□□□□ -0.65
YKR011CQ02209 PAC11YDR488C 1602 nt10.94□□□□□ -0.66
YKR011CQ02209 SEC11YIR022W 504 nt10.93□□□□□ -0.66
YKR011CQ02209 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.92□□□□□ -0.66
YKR011CQ02209 YIL100WYIL100W 354 nt10.9□□□□□ -0.66
YKR011CQ02209 YLR236CYLR236C 324 nt10.89□□□□□ -0.67
YKR011CQ02209 YSC84YHR016C 1407 nt10.88□□□□□ -0.67
YKR011CQ02209 PCH2YBR186W 1695 nt10.87□□□□□ -0.67
YKR011CQ02209 YHL050CYHL050C 2094 nt10.83□□□□□ -0.68
YKR011CQ02209 YNL195CYNL195C 786 nt10.83□□□□□ -0.68
YKR011CQ02209 PUS2YGL063W 1113 nt10.82□□□□□ -0.68
YKR011CQ02209 IDH1YNL037C 1083 nt10.82□□□□□ -0.68
YKR011CQ02209 GUT2YIL155C 1950 nt10.82□□□□□ -0.68
YKR011CQ02209 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.81□□□□□ -0.68
YKR011CQ02209 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.81□□□□□ -0.68
YKR011CQ02209 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.81□□□□□ -0.68
YKR011CQ02209 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.81□□□□□ -0.68
YKR011CQ02209 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.81□□□□□ -0.68
YKR011CQ02209 IMP2'YIL154C 1041 nt10.8□□□□□ -0.68
YKR011CQ02209 RRT12YCR045C 1476 nt10.8□□□□□ -0.68
YKR011CQ02209 DSK2YMR276W 1122 nt10.76□□□□□ -0.69
YKR011CQ02209 GBP2YCL011C 1284 nt10.74□□□□□ -0.69
YKR011CQ02209 RRD1YIL153W 1182 nt10.68□□□□□ -0.7
YKR011CQ02209 NVJ2YPR091C 2313 nt10.67□□□□□ -0.7
YKR011CQ02209 TCD2YKL027W 1344 nt10.66□□□□□ -0.7
YKR011CQ02209 PIB2YGL023C 1908 nt10.65□□□□□ -0.7
YKR011CQ02209 YPR011CYPR011C 981 nt10.65□□□□□ -0.7
YKR011CQ02209 DED1YOR204W 1815 nt10.63□□□□□ -0.71
YKR011CQ02209 FMP52YER004W 696 nt10.62□□□□□ -0.71
YKR011CQ02209 RTF1YGL244W 1677 nt10.62□□□□□ -0.71
YKR011CQ02209 YDR433WYDR433W 441 nt10.61□□□□□ -0.71
YKR011CQ02209 FMP45YDL222C 930 nt10.59□□□□□ -0.71
YKR011CQ02209 BOP3YNL042W 1191 nt10.59□□□□□ -0.71
YKR011CQ02209 NME1NME1 340 nt10.59□□□□□ -0.71
YKR011CQ02209 ERV46YAL042W 1248 nt10.57□□□□□ -0.72
YKR011CQ02209 FMT1YBL013W 1206 nt10.54□□□□□ -0.72
YKR011CQ02209 MXR2YCL033C 507 nt10.54□□□□□ -0.72
YKR011CQ02209 NCP1YHR042W 2076 nt10.53□□□□□ -0.72
YKR011CQ02209 LPX1YOR084W 1164 nt10.52□□□□□ -0.73
YKR011CQ02209 YJL225CYJL225C 5277 nt10.51□□□□□ -0.73
YKR011CQ02209 YKR040CYKR040C 504 nt10.51□□□□□ -0.73
YKR011CQ02209 PCM1YEL058W 1674 nt10.5□□□□□ -0.73
YKR011CQ02209 LCB1YMR296C 1677 nt10.48□□□□□ -0.73
YKR011CQ02209 SOR2YDL246C 1074 nt10.47□□□□□ -0.73
YKR011CQ02209 SOR1YJR159W 1074 nt10.47□□□□□ -0.73
YKR011CQ02209 CWP1YKL096W 720 nt10.46□□□□□ -0.73
YKR011CQ02209 PTK1YKL198C 1989 nt10.46□□□□□ -0.74
YKR011CQ02209 ADH2YMR303C 1047 nt10.45□□□□□ -0.74
YKR011CQ02209 YCL042WYCL042W 360 nt10.45□□□□□ -0.74
YKR011CQ02209 SNF6YHL025W 999 nt10.43□□□□□ -0.74
YKR011CQ02209 SIM1YIL123W 1431 nt10.41□□□□□ -0.74
YKR011CQ02209 FRD1YEL047C 1413 nt10.4□□□□□ -0.75
YKR011CQ02209 BIO4YNR057C 714 nt10.35□□□□□ -0.75
YKR011CQ02209 YIH1YCR059C 777 nt10.31□□□□□ -0.76
YKR011CQ02209 RNQ1YCL028W 1218 nt10.28□□□□□ -0.76
YKR011CQ02209 LYS4YDR234W 2082 nt10.28□□□□□ -0.76
YKR011CQ02209 YFL054CYFL054C 1941 nt10.27□□□□□ -0.77
YKR011CQ02209 ERF2YLR246W 1080 nt10.23□□□□□ -0.77
YKR011CQ02209 YLL053CYLL053C 459 nt10.22□□□□□ -0.77
YKR011CQ02209 SPP1YPL138C 1062 nt10.22□□□□□ -0.77
YKR011CQ02209 DIC1YLR348C 897 nt10.21□□□□□ -0.77
YKR011CQ02209 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.21□□□□□ -0.78
YKR011CQ02209 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.21□□□□□ -0.78
YKR011CQ02209 CRR1YLR213C 1269 nt10.19□□□□□ -0.78
YKR011CQ02209 SPT8YLR055C 1809 nt10.19□□□□□ -0.78
YKR011CQ02209 FTR1YER145C 1215 nt10.15□□□□□ -0.78
YKR011CQ02209 PTH1YHR189W 573 nt10.15□□□□□ -0.78
YKR011CQ02209 YLR235CYLR235C 399 nt10.15□□□□□ -0.78
YKR011CQ02209 ATF2YGR177C 1608 nt10.12□□□□□ -0.79
YKR011CQ02209 YFL067WYFL067W 528 nt10.12□□□□□ -0.79
YKR011CQ02209 GAL1YBR020W 1587 nt10.11□□□□□ -0.79
YKR011CQ02209 TRM5YHR070W 1500 nt10.09□□□□□ -0.79
YKR011CQ02209 HEM12YDR047W 1089 nt10.09□□□□□ -0.79
YKR011CQ02209 TIM23YNR017W 669 nt10.08□□□□□ -0.8
YKR011CQ02209 AQY1YPR192W 918 nt10.07□□□□□ -0.8
YKR011CQ02209 DDR2YOL052C-A 186 nt10.06□□□□□ -0.8
YKR011CQ02209 SNG1YGR197C 1644 nt10.05□□□□□ -0.8
YKR011CQ02209 YGR139WYGR139W 339 nt10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 56.7 ms