Protein–RNA interactions for Protein: Q01454

CTF4, DNA polymerase alpha-binding protein, yeastyeast

Predictions only

Length 927 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTF4Q01454 YPS1YLR120C 1710 nt15.63■□□□□ 0.09
CTF4Q01454 IMP2'YIL154C 1041 nt15.63■□□□□ 0.09
CTF4Q01454 YPR011CYPR011C 981 nt15.63■□□□□ 0.09
CTF4Q01454 YLR236CYLR236C 324 nt15.59■□□□□ 0.09
CTF4Q01454 YDR095CYDR095C 411 nt15.58■□□□□ 0.08
CTF4Q01454 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt15.56■□□□□ 0.08
CTF4Q01454 YCH1YGR203W 447 nt15.5■□□□□ 0.07
CTF4Q01454 SIS1YNL007C 1059 nt15.47■□□□□ 0.07
CTF4Q01454 IDH1YNL037C 1083 nt15.43■□□□□ 0.06
CTF4Q01454 RPP2AYOL039W 321 nt15.35■□□□□ 0.05
CTF4Q01454 LPX1YOR084W 1164 nt15.35■□□□□ 0.05
CTF4Q01454 YDR433WYDR433W 441 nt15.34■□□□□ 0.05
CTF4Q01454 TIR4YOR009W 1464 nt15.33■□□□□ 0.05
CTF4Q01454 GBP2YCL011C 1284 nt15.27■□□□□ 0.04
CTF4Q01454 ERV46YAL042W 1248 nt15.26■□□□□ 0.03
CTF4Q01454 ART5YGR068C 1761 nt15.24■□□□□ 0.03
CTF4Q01454 MEP2YNL142W 1500 nt15.23■□□□□ 0.03
CTF4Q01454 YMR057CYMR057C 372 nt15.21■□□□□ 0.03
CTF4Q01454 SPP1YPL138C 1062 nt15.2■□□□□ 0.02
CTF4Q01454 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt15.18■□□□□ 0.02
CTF4Q01454 YKR040CYKR040C 504 nt15.17■□□□□ 0.02
CTF4Q01454 CAC2YML102W 1407 nt15.17■□□□□ 0.02
CTF4Q01454 PTP1YDL230W 1008 nt15.16■□□□□ 0.02
CTF4Q01454 MRPL8YJL063C 717 nt15.16■□□□□ 0.02
CTF4Q01454 PET9YBL030C 957 nt15.16■□□□□ 0.02
CTF4Q01454 MXR2YCL033C 507 nt15.13■□□□□ 0.01
CTF4Q01454 GFD2YCL036W 1701 nt15.09■□□□□ 0.01
CTF4Q01454 ADO1YJR105W 1023 nt15.05■□□□□ -0
CTF4Q01454 SPT5YML010W 3192 nt15.04■□□□□ -0
CTF4Q01454 DCW1YKL046C 1350 nt15.03■□□□□ -0
CTF4Q01454 TCD2YKL027W 1344 nt15.03■□□□□ -0
CTF4Q01454 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt15.01□□□□□ -0.01
CTF4Q01454 YEL076CYEL076C 651 nt15.01□□□□□ -0.01
CTF4Q01454 YLR464WYLR464W 651 nt15.01□□□□□ -0.01
CTF4Q01454 RTS2YOR077W 699 nt14.95□□□□□ -0.02
CTF4Q01454 RTG1YOL067C 534 nt14.94□□□□□ -0.02
CTF4Q01454 EMI2YDR516C 1503 nt14.87□□□□□ -0.03
CTF4Q01454 FPS1YLL043W 2010 nt14.83□□□□□ -0.03
CTF4Q01454 YMR090WYMR090W 684 nt14.8□□□□□ -0.04
CTF4Q01454 DED1YOR204W 1815 nt14.8□□□□□ -0.04
CTF4Q01454 HUA1YGR268C 597 nt14.78□□□□□ -0.04
CTF4Q01454 RRD1YIL153W 1182 nt14.78□□□□□ -0.04
CTF4Q01454 YCL042WYCL042W 360 nt14.78□□□□□ -0.04
CTF4Q01454 YDL221WYDL221W 552 nt14.77□□□□□ -0.05
CTF4Q01454 IRC15YPL017C 1500 nt14.76□□□□□ -0.05
CTF4Q01454 FRD1YEL047C 1413 nt14.75□□□□□ -0.05
CTF4Q01454 UBX6YJL048C 1191 nt14.75□□□□□ -0.05
CTF4Q01454 CUE1YMR264W 612 nt14.74□□□□□ -0.05
CTF4Q01454 PTH1YHR189W 573 nt14.72□□□□□ -0.05
CTF4Q01454 GIS3YLR094C 1509 nt14.68□□□□□ -0.06
CTF4Q01454 YIL100WYIL100W 354 nt14.66□□□□□ -0.06
CTF4Q01454 FMT1YBL013W 1206 nt14.65□□□□□ -0.06
CTF4Q01454 YLR235CYLR235C 399 nt14.6□□□□□ -0.07
CTF4Q01454 YKL030WYKL030W 606 nt14.59□□□□□ -0.07
CTF4Q01454 SOR2YDL246C 1074 nt14.58□□□□□ -0.08
CTF4Q01454 SOR1YJR159W 1074 nt14.58□□□□□ -0.08
CTF4Q01454 CWP1YKL096W 720 nt14.58□□□□□ -0.08
CTF4Q01454 FMP52YER004W 696 nt14.54□□□□□ -0.08
CTF4Q01454 SCC4YER147C 1875 nt14.51□□□□□ -0.09
CTF4Q01454 YDR094WYDR094W 336 nt14.5□□□□□ -0.09
CTF4Q01454 SDH1YKL148C 1923 nt14.5□□□□□ -0.09
CTF4Q01454 LCB1YMR296C 1677 nt14.49□□□□□ -0.09
CTF4Q01454 ADH2YMR303C 1047 nt14.48□□□□□ -0.09
CTF4Q01454 SSA4YER103W 1929 nt14.44□□□□□ -0.1
CTF4Q01454 YBR220CYBR220C 1683 nt14.39□□□□□ -0.11
CTF4Q01454 SNF6YHL025W 999 nt14.37□□□□□ -0.11
CTF4Q01454 YNL195CYNL195C 786 nt14.36□□□□□ -0.11
CTF4Q01454 TIM23YNR017W 669 nt14.35□□□□□ -0.11
CTF4Q01454 PCM1YEL058W 1674 nt14.35□□□□□ -0.11
CTF4Q01454 DIC1YLR348C 897 nt14.33□□□□□ -0.12
CTF4Q01454 YLR179CYLR179C 606 nt14.29□□□□□ -0.12
CTF4Q01454 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt14.22□□□□□ -0.13
CTF4Q01454 YPR064WYPR064W 420 nt14.2□□□□□ -0.14
CTF4Q01454 RNQ1YCL028W 1218 nt14.2□□□□□ -0.14
CTF4Q01454 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt14.19□□□□□ -0.14
CTF4Q01454 RRT12YCR045C 1476 nt14.18□□□□□ -0.14
CTF4Q01454 YIH1YCR059C 777 nt14.15□□□□□ -0.14
CTF4Q01454 YSC84YHR016C 1407 nt14.1□□□□□ -0.15
CTF4Q01454 RRT5YFR032C 870 nt14.1□□□□□ -0.15
CTF4Q01454 TAD3YLR316C 969 nt14.1□□□□□ -0.15
CTF4Q01454 PAU16YKL224C 372 nt14.08□□□□□ -0.16
CTF4Q01454 YFR018CYFR018C 1092 nt14.07□□□□□ -0.16
CTF4Q01454 YLL053CYLL053C 459 nt14.07□□□□□ -0.16
CTF4Q01454 SIM1YIL123W 1431 nt14.07□□□□□ -0.16
CTF4Q01454 WSC2YNL283C 1512 nt14.02□□□□□ -0.16
CTF4Q01454 AHT1YHR093W 549 nt14.02□□□□□ -0.17
CTF4Q01454 BIO4YNR057C 714 nt14.02□□□□□ -0.17
CTF4Q01454 PRE6YOL038W 765 nt14.01□□□□□ -0.17
CTF4Q01454 YHL050CYHL050C 2094 nt13.99□□□□□ -0.17
CTF4Q01454 FTR1YER145C 1215 nt13.97□□□□□ -0.17
CTF4Q01454 AQY1YPR192W 918 nt13.95□□□□□ -0.18
CTF4Q01454 GAL1YBR020W 1587 nt13.94□□□□□ -0.18
CTF4Q01454 TRM5YHR070W 1500 nt13.91□□□□□ -0.18
CTF4Q01454 YFL066CYFL066C 1179 nt13.91□□□□□ -0.18
CTF4Q01454 DDR2YOL052C-A 186 nt13.86□□□□□ -0.19
CTF4Q01454 SEC11YIR022W 504 nt13.85□□□□□ -0.19
CTF4Q01454 STB1YNL309W 1263 nt13.85□□□□□ -0.19
CTF4Q01454 PEX25YPL112C 1185 nt13.84□□□□□ -0.19
CTF4Q01454 YLR415CYLR415C 339 nt13.83□□□□□ -0.2
CTF4Q01454 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 33.8 ms