Protein–RNA interactions for Protein: Q01329

PTA1, Pre-tRNA-processing protein PTA1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PTA1Q01329 YPS1YLR120C 1710 nt13.73□□□□□ -0.21
PTA1Q01329 YLR236CYLR236C 324 nt13.72□□□□□ -0.21
PTA1Q01329 YDR095CYDR095C 411 nt13.69□□□□□ -0.22
PTA1Q01329 SPT5YML010W 3192 nt13.68□□□□□ -0.22
PTA1Q01329 YJL152WYJL152W 360 nt13.66□□□□□ -0.22
PTA1Q01329 IMP2'YIL154C 1041 nt13.65□□□□□ -0.22
PTA1Q01329 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.6□□□□□ -0.23
PTA1Q01329 SIS1YNL007C 1059 nt13.57□□□□□ -0.24
PTA1Q01329 YCH1YGR203W 447 nt13.56□□□□□ -0.24
PTA1Q01329 TIR4YOR009W 1464 nt13.48□□□□□ -0.25
PTA1Q01329 IDH1YNL037C 1083 nt13.47□□□□□ -0.25
PTA1Q01329 LPX1YOR084W 1164 nt13.47□□□□□ -0.25
PTA1Q01329 Q0182Q0182 405 nt13.45□□□□□ -0.26
PTA1Q01329 RPP2AYOL039W 321 nt13.45□□□□□ -0.26
PTA1Q01329 YDR433WYDR433W 441 nt13.4□□□□□ -0.26
PTA1Q01329 ERV46YAL042W 1248 nt13.39□□□□□ -0.27
PTA1Q01329 MEP2YNL142W 1500 nt13.39□□□□□ -0.27
PTA1Q01329 ART5YGR068C 1761 nt13.37□□□□□ -0.27
PTA1Q01329 PTP1YDL230W 1008 nt13.36□□□□□ -0.27
PTA1Q01329 SPP1YPL138C 1062 nt13.36□□□□□ -0.27
PTA1Q01329 GBP2YCL011C 1284 nt13.35□□□□□ -0.27
PTA1Q01329 SSA4YER103W 1929 nt13.34□□□□□ -0.27
PTA1Q01329 YMR057CYMR057C 372 nt13.32□□□□□ -0.28
PTA1Q01329 MRPL8YJL063C 717 nt13.28□□□□□ -0.28
PTA1Q01329 YKR040CYKR040C 504 nt13.28□□□□□ -0.28
PTA1Q01329 PET9YBL030C 957 nt13.28□□□□□ -0.28
PTA1Q01329 MXR2YCL033C 507 nt13.28□□□□□ -0.28
PTA1Q01329 CAC2YML102W 1407 nt13.28□□□□□ -0.28
PTA1Q01329 GFD2YCL036W 1701 nt13.27□□□□□ -0.29
PTA1Q01329 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt13.25□□□□□ -0.29
PTA1Q01329 DCW1YKL046C 1350 nt13.22□□□□□ -0.29
PTA1Q01329 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt13.15□□□□□ -0.3
PTA1Q01329 YEL076CYEL076C 651 nt13.15□□□□□ -0.3
PTA1Q01329 YLR464WYLR464W 651 nt13.15□□□□□ -0.3
PTA1Q01329 ADO1YJR105W 1023 nt13.14□□□□□ -0.31
PTA1Q01329 RTG1YOL067C 534 nt13.14□□□□□ -0.31
PTA1Q01329 TCD2YKL027W 1344 nt13.13□□□□□ -0.31
PTA1Q01329 RTS2YOR077W 699 nt13.12□□□□□ -0.31
PTA1Q01329 EMI2YDR516C 1503 nt13.06□□□□□ -0.32
PTA1Q01329 FPS1YLL043W 2010 nt13.06□□□□□ -0.32
PTA1Q01329 DED1YOR204W 1815 nt13.03□□□□□ -0.32
PTA1Q01329 RRD1YIL153W 1182 nt13.01□□□□□ -0.33
PTA1Q01329 IRC15YPL017C 1500 nt13□□□□□ -0.33
PTA1Q01329 FRD1YEL047C 1413 nt12.97□□□□□ -0.33
PTA1Q01329 YDL221WYDL221W 552 nt12.97□□□□□ -0.33
PTA1Q01329 UBX6YJL048C 1191 nt12.95□□□□□ -0.34
PTA1Q01329 CUE1YMR264W 612 nt12.94□□□□□ -0.34
PTA1Q01329 BDF1YLR399C 2061 nt12.93□□□□□ -0.34
PTA1Q01329 YMR090WYMR090W 684 nt12.92□□□□□ -0.34
PTA1Q01329 HUA1YGR268C 597 nt12.91□□□□□ -0.34
PTA1Q01329 GIS3YLR094C 1509 nt12.9□□□□□ -0.34
PTA1Q01329 FMT1YBL013W 1206 nt12.9□□□□□ -0.34
PTA1Q01329 YCL042WYCL042W 360 nt12.9□□□□□ -0.34
PTA1Q01329 PTH1YHR189W 573 nt12.89□□□□□ -0.35
PTA1Q01329 SOR2YDL246C 1074 nt12.81□□□□□ -0.36
PTA1Q01329 SOR1YJR159W 1074 nt12.81□□□□□ -0.36
PTA1Q01329 YIL100WYIL100W 354 nt12.79□□□□□ -0.36
PTA1Q01329 YKL030WYKL030W 606 nt12.77□□□□□ -0.37
PTA1Q01329 YLR235CYLR235C 399 nt12.77□□□□□ -0.37
PTA1Q01329 CWP1YKL096W 720 nt12.76□□□□□ -0.37
PTA1Q01329 SDH1YKL148C 1923 nt12.74□□□□□ -0.37
PTA1Q01329 SCC4YER147C 1875 nt12.74□□□□□ -0.37
PTA1Q01329 TAT1YBR069C 1860 nt12.74□□□□□ -0.37
PTA1Q01329 FMP52YER004W 696 nt12.74□□□□□ -0.37
PTA1Q01329 ADH2YMR303C 1047 nt12.71□□□□□ -0.37
PTA1Q01329 LCB1YMR296C 1677 nt12.7□□□□□ -0.38
PTA1Q01329 YDR094WYDR094W 336 nt12.7□□□□□ -0.38
PTA1Q01329 YBR220CYBR220C 1683 nt12.67□□□□□ -0.38
PTA1Q01329 PCM1YEL058W 1674 nt12.59□□□□□ -0.39
PTA1Q01329 SNF6YHL025W 999 nt12.57□□□□□ -0.4
PTA1Q01329 DIC1YLR348C 897 nt12.57□□□□□ -0.4
PTA1Q01329 TIM23YNR017W 669 nt12.56□□□□□ -0.4
PTA1Q01329 YNL195CYNL195C 786 nt12.51□□□□□ -0.41
PTA1Q01329 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt12.5□□□□□ -0.41
PTA1Q01329 YLR179CYLR179C 606 nt12.49□□□□□ -0.41
PTA1Q01329 RRT12YCR045C 1476 nt12.46□□□□□ -0.41
PTA1Q01329 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt12.45□□□□□ -0.42
PTA1Q01329 RNQ1YCL028W 1218 nt12.45□□□□□ -0.42
PTA1Q01329 PAC11YDR488C 1602 nt12.44□□□□□ -0.42
PTA1Q01329 YIH1YCR059C 777 nt12.43□□□□□ -0.42
PTA1Q01329 YPR064WYPR064W 420 nt12.41□□□□□ -0.42
PTA1Q01329 YSC84YHR016C 1407 nt12.39□□□□□ -0.43
PTA1Q01329 PAU16YKL224C 372 nt12.36□□□□□ -0.43
PTA1Q01329 YFR018CYFR018C 1092 nt12.35□□□□□ -0.43
PTA1Q01329 WSC2YNL283C 1512 nt12.34□□□□□ -0.43
PTA1Q01329 TAD3YLR316C 969 nt12.34□□□□□ -0.43
PTA1Q01329 YLL053CYLL053C 459 nt12.33□□□□□ -0.44
PTA1Q01329 PRE6YOL038W 765 nt12.33□□□□□ -0.44
PTA1Q01329 YHL050CYHL050C 2094 nt12.33□□□□□ -0.44
PTA1Q01329 BIO4YNR057C 714 nt12.32□□□□□ -0.44
PTA1Q01329 SIM1YIL123W 1431 nt12.31□□□□□ -0.44
PTA1Q01329 AHT1YHR093W 549 nt12.31□□□□□ -0.44
PTA1Q01329 RRT5YFR032C 870 nt12.3□□□□□ -0.44
PTA1Q01329 SEC11YIR022W 504 nt12.26□□□□□ -0.45
PTA1Q01329 PCH2YBR186W 1695 nt12.26□□□□□ -0.45
PTA1Q01329 FTR1YER145C 1215 nt12.25□□□□□ -0.45
PTA1Q01329 GAL1YBR020W 1587 nt12.23□□□□□ -0.45
PTA1Q01329 GUT2YIL155C 1950 nt12.21□□□□□ -0.45
PTA1Q01329 AQY1YPR192W 918 nt12.21□□□□□ -0.45
PTA1Q01329 YFL066CYFL066C 1179 nt12.2□□□□□ -0.46
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