Protein–RNA interactions for Protein: P70289

Ptprv, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase V, mousemouse

Predictions only

Length 1,705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprvP70289 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
PtprvP70289 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
PtprvP70289 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
PtprvP70289 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC38.75■■■■□ 3.79
PtprvP70289 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
PtprvP70289 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
PtprvP70289 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC38.66■■■■□ 3.78
PtprvP70289 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
PtprvP70289 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
PtprvP70289 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
PtprvP70289 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
PtprvP70289 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
PtprvP70289 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
PtprvP70289 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
PtprvP70289 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
PtprvP70289 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
PtprvP70289 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
PtprvP70289 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
PtprvP70289 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
PtprvP70289 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
PtprvP70289 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
PtprvP70289 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
PtprvP70289 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
PtprvP70289 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
PtprvP70289 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
PtprvP70289 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
PtprvP70289 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
PtprvP70289 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
PtprvP70289 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
PtprvP70289 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
PtprvP70289 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
PtprvP70289 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC37.97■■■■□ 3.67
PtprvP70289 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
PtprvP70289 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC37.93■■■■□ 3.66
PtprvP70289 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
PtprvP70289 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
PtprvP70289 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
PtprvP70289 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
PtprvP70289 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PtprvP70289 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PtprvP70289 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
PtprvP70289 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
PtprvP70289 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PtprvP70289 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
PtprvP70289 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
PtprvP70289 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
PtprvP70289 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
PtprvP70289 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
PtprvP70289 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
PtprvP70289 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
PtprvP70289 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
PtprvP70289 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
PtprvP70289 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
PtprvP70289 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
PtprvP70289 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
PtprvP70289 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
PtprvP70289 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
PtprvP70289 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
PtprvP70289 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
PtprvP70289 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC37.48■■■■□ 3.59
PtprvP70289 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
PtprvP70289 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
PtprvP70289 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
PtprvP70289 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
PtprvP70289 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PtprvP70289 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
PtprvP70289 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PtprvP70289 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
PtprvP70289 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC37.31■■■■□ 3.56
PtprvP70289 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
PtprvP70289 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
PtprvP70289 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
PtprvP70289 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
PtprvP70289 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
PtprvP70289 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
PtprvP70289 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
PtprvP70289 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.54
PtprvP70289 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
PtprvP70289 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
PtprvP70289 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
PtprvP70289 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
PtprvP70289 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
PtprvP70289 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
PtprvP70289 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
PtprvP70289 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PtprvP70289 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
PtprvP70289 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
PtprvP70289 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PtprvP70289 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
PtprvP70289 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
PtprvP70289 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
PtprvP70289 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PtprvP70289 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC36.93■■■■□ 3.5
PtprvP70289 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PtprvP70289 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PtprvP70289 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PtprvP70289 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PtprvP70289 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PtprvP70289 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PtprvP70289 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms