Protein–RNA interactions for Protein: P68500

Cntn5, Contactin-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn5P68500 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cntn5P68500 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cntn5P68500 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cntn5P68500 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Cntn5P68500 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cntn5P68500 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Cntn5P68500 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Cntn5P68500 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cntn5P68500 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cntn5P68500 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cntn5P68500 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cntn5P68500 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cntn5P68500 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Cntn5P68500 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cntn5P68500 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cntn5P68500 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cntn5P68500 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cntn5P68500 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cntn5P68500 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cntn5P68500 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cntn5P68500 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cntn5P68500 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Cntn5P68500 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Cntn5P68500 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cntn5P68500 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cntn5P68500 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cntn5P68500 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cntn5P68500 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cntn5P68500 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cntn5P68500 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cntn5P68500 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cntn5P68500 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cntn5P68500 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cntn5P68500 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cntn5P68500 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cntn5P68500 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cntn5P68500 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cntn5P68500 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cntn5P68500 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cntn5P68500 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cntn5P68500 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cntn5P68500 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cntn5P68500 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cntn5P68500 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cntn5P68500 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cntn5P68500 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Cntn5P68500 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Cntn5P68500 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cntn5P68500 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cntn5P68500 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cntn5P68500 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cntn5P68500 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cntn5P68500 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cntn5P68500 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cntn5P68500 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cntn5P68500 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cntn5P68500 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cntn5P68500 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cntn5P68500 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cntn5P68500 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cntn5P68500 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cntn5P68500 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cntn5P68500 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cntn5P68500 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cntn5P68500 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cntn5P68500 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cntn5P68500 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cntn5P68500 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Cntn5P68500 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cntn5P68500 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Cntn5P68500 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cntn5P68500 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cntn5P68500 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cntn5P68500 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cntn5P68500 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cntn5P68500 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cntn5P68500 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cntn5P68500 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cntn5P68500 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cntn5P68500 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cntn5P68500 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cntn5P68500 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cntn5P68500 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cntn5P68500 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Cntn5P68500 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cntn5P68500 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cntn5P68500 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Cntn5P68500 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Cntn5P68500 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cntn5P68500 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cntn5P68500 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cntn5P68500 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cntn5P68500 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Cntn5P68500 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cntn5P68500 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cntn5P68500 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cntn5P68500 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Cntn5P68500 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cntn5P68500 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cntn5P68500 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms