Protein–RNA interactions for Protein: P68500

Cntn5, Contactin-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn5P68500 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.38■■■■□ 3.89
Cntn5P68500 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Cntn5P68500 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Cntn5P68500 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Cntn5P68500 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Cntn5P68500 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Cntn5P68500 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Cntn5P68500 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Cntn5P68500 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Cntn5P68500 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Cntn5P68500 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Cntn5P68500 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Cntn5P68500 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Cntn5P68500 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Cntn5P68500 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Cntn5P68500 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Cntn5P68500 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Cntn5P68500 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Cntn5P68500 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Cntn5P68500 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Cntn5P68500 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Cntn5P68500 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Cntn5P68500 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Cntn5P68500 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Cntn5P68500 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Cntn5P68500 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Cntn5P68500 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Cntn5P68500 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Cntn5P68500 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Cntn5P68500 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Cntn5P68500 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Cntn5P68500 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Cntn5P68500 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Cntn5P68500 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Cntn5P68500 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Cntn5P68500 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Cntn5P68500 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Cntn5P68500 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Cntn5P68500 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cntn5P68500 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Cntn5P68500 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cntn5P68500 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cntn5P68500 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cntn5P68500 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cntn5P68500 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cntn5P68500 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cntn5P68500 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Cntn5P68500 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cntn5P68500 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cntn5P68500 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cntn5P68500 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cntn5P68500 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Cntn5P68500 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cntn5P68500 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cntn5P68500 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cntn5P68500 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Cntn5P68500 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cntn5P68500 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cntn5P68500 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cntn5P68500 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cntn5P68500 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cntn5P68500 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cntn5P68500 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cntn5P68500 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Cntn5P68500 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cntn5P68500 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cntn5P68500 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cntn5P68500 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cntn5P68500 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cntn5P68500 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cntn5P68500 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cntn5P68500 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cntn5P68500 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cntn5P68500 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Cntn5P68500 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cntn5P68500 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cntn5P68500 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cntn5P68500 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cntn5P68500 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cntn5P68500 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cntn5P68500 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cntn5P68500 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cntn5P68500 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Cntn5P68500 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cntn5P68500 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cntn5P68500 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cntn5P68500 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cntn5P68500 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Cntn5P68500 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cntn5P68500 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cntn5P68500 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cntn5P68500 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cntn5P68500 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cntn5P68500 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cntn5P68500 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cntn5P68500 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cntn5P68500 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cntn5P68500 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cntn5P68500 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cntn5P68500 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.7 ms