Protein–RNA interactions for Protein: P53438

SOK2, Protein SOK2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SOK2P53438 ALF1YNL148C 765 nt11.04□□□□□ -0.64
SOK2P53438 CCT6YDR188W 1641 nt11.04□□□□□ -0.64
SOK2P53438 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.02□□□□□ -0.65
SOK2P53438 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.02□□□□□ -0.65
SOK2P53438 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.02□□□□□ -0.65
SOK2P53438 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.02□□□□□ -0.65
SOK2P53438 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.02□□□□□ -0.65
SOK2P53438 PCH2YBR186W 1695 nt11.01□□□□□ -0.65
SOK2P53438 YLR281CYLR281C 468 nt11□□□□□ -0.65
SOK2P53438 SDH1YKL148C 1923 nt10.99□□□□□ -0.65
SOK2P53438 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.98□□□□□ -0.65
SOK2P53438 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.98□□□□□ -0.65
SOK2P53438 CSM2YIL132C 642 nt10.98□□□□□ -0.65
SOK2P53438 PUS2YGL063W 1113 nt10.97□□□□□ -0.65
SOK2P53438 GUT2YIL155C 1950 nt10.97□□□□□ -0.65
SOK2P53438 YDL221WYDL221W 552 nt10.96□□□□□ -0.65
SOK2P53438 SEC11YIR022W 504 nt10.96□□□□□ -0.65
SOK2P53438 WHI5YOR083W 888 nt10.96□□□□□ -0.65
SOK2P53438 YDR095CYDR095C 411 nt10.92□□□□□ -0.66
SOK2P53438 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.87□□□□□ -0.67
SOK2P53438 YJL152WYJL152W 360 nt10.81□□□□□ -0.68
SOK2P53438 SCC4YER147C 1875 nt10.8□□□□□ -0.68
SOK2P53438 CAC2YML102W 1407 nt10.79□□□□□ -0.68
SOK2P53438 SIS1YNL007C 1059 nt10.79□□□□□ -0.68
SOK2P53438 DSK2YMR276W 1122 nt10.76□□□□□ -0.69
SOK2P53438 RPP2AYOL039W 321 nt10.74□□□□□ -0.69
SOK2P53438 IMP2'YIL154C 1041 nt10.73□□□□□ -0.69
SOK2P53438 PTP1YDL230W 1008 nt10.71□□□□□ -0.69
SOK2P53438 PIB2YGL023C 1908 nt10.71□□□□□ -0.69
SOK2P53438 FPS1YLL043W 2010 nt10.71□□□□□ -0.69
SOK2P53438 PAU21YOR394W 495 nt10.71□□□□□ -0.69
SOK2P53438 PAU22YPL282C 495 nt10.71□□□□□ -0.69
SOK2P53438 FMP45YDL222C 930 nt10.69□□□□□ -0.7
SOK2P53438 YLR236CYLR236C 324 nt10.68□□□□□ -0.7
SOK2P53438 TIR4YOR009W 1464 nt10.67□□□□□ -0.7
SOK2P53438 RTF1YGL244W 1677 nt10.66□□□□□ -0.7
SOK2P53438 YPR011CYPR011C 981 nt10.66□□□□□ -0.7
SOK2P53438 YSC84YHR016C 1407 nt10.66□□□□□ -0.7
SOK2P53438 IDH1YNL037C 1083 nt10.64□□□□□ -0.71
SOK2P53438 ART5YGR068C 1761 nt10.64□□□□□ -0.71
SOK2P53438 IRC15YPL017C 1500 nt10.63□□□□□ -0.71
SOK2P53438 YCH1YGR203W 447 nt10.62□□□□□ -0.71
SOK2P53438 GIS3YLR094C 1509 nt10.6□□□□□ -0.71
SOK2P53438 ARO7YPR060C 771 nt10.59□□□□□ -0.71
SOK2P53438 PET9YBL030C 957 nt10.58□□□□□ -0.72
SOK2P53438 BOR1YNL275W 1731 nt10.56□□□□□ -0.72
SOK2P53438 YMR057CYMR057C 372 nt10.56□□□□□ -0.72
SOK2P53438 GFD2YCL036W 1701 nt10.55□□□□□ -0.72
SOK2P53438 BOP3YNL042W 1191 nt10.55□□□□□ -0.72
SOK2P53438 YDR433WYDR433W 441 nt10.54□□□□□ -0.72
SOK2P53438 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.54□□□□□ -0.72
SOK2P53438 YHL050CYHL050C 2094 nt10.53□□□□□ -0.72
SOK2P53438 LPX1YOR084W 1164 nt10.52□□□□□ -0.73
SOK2P53438 GBP2YCL011C 1284 nt10.52□□□□□ -0.73
SOK2P53438 UME6YDR207C 2511 nt10.48□□□□□ -0.73
SOK2P53438 PTK1YKL198C 1989 nt10.47□□□□□ -0.73
SOK2P53438 ERV46YAL042W 1248 nt10.47□□□□□ -0.73
SOK2P53438 RTS2YOR077W 699 nt10.46□□□□□ -0.73
SOK2P53438 YJL225CYJL225C 5277 nt10.42□□□□□ -0.74
SOK2P53438 RRT12YCR045C 1476 nt10.42□□□□□ -0.74
SOK2P53438 YKR040CYKR040C 504 nt10.4□□□□□ -0.74
SOK2P53438 MXR2YCL033C 507 nt10.4□□□□□ -0.74
SOK2P53438 TCD2YKL027W 1344 nt10.38□□□□□ -0.75
SOK2P53438 YNL195CYNL195C 786 nt10.38□□□□□ -0.75
SOK2P53438 SPP1YPL138C 1062 nt10.35□□□□□ -0.75
SOK2P53438 CUE1YMR264W 612 nt10.32□□□□□ -0.76
SOK2P53438 YFL054CYFL054C 1941 nt10.29□□□□□ -0.76
SOK2P53438 REG2YBR050C 1017 nt10.27□□□□□ -0.77
SOK2P53438 RRD1YIL153W 1182 nt10.26□□□□□ -0.77
SOK2P53438 YIL100WYIL100W 354 nt10.25□□□□□ -0.77
SOK2P53438 DED1YOR204W 1815 nt10.25□□□□□ -0.77
SOK2P53438 MRPL8YJL063C 717 nt10.24□□□□□ -0.77
SOK2P53438 SPT8YLR055C 1809 nt10.21□□□□□ -0.77
SOK2P53438 PAM17YKR065C 594 nt10.2□□□□□ -0.78
SOK2P53438 MCH5YOR306C 1566 nt10.2□□□□□ -0.78
SOK2P53438 YCL042WYCL042W 360 nt10.2□□□□□ -0.78
SOK2P53438 MET8YBR213W 825 nt10.19□□□□□ -0.78
SOK2P53438 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.18□□□□□ -0.78
SOK2P53438 YEL076CYEL076C 651 nt10.18□□□□□ -0.78
SOK2P53438 YLR464WYLR464W 651 nt10.18□□□□□ -0.78
SOK2P53438 FRD1YEL047C 1413 nt10.17□□□□□ -0.78
SOK2P53438 ADO1YJR105W 1023 nt10.17□□□□□ -0.78
SOK2P53438 NCP1YHR042W 2076 nt10.17□□□□□ -0.78
SOK2P53438 RTG1YOL067C 534 nt10.15□□□□□ -0.78
SOK2P53438 FMT1YBL013W 1206 nt10.14□□□□□ -0.79
SOK2P53438 HSP60YLR259C 1719 nt10.13□□□□□ -0.79
SOK2P53438 ALG12YNR030W 1656 nt10.12□□□□□ -0.79
SOK2P53438 FMP52YER004W 696 nt10.11□□□□□ -0.79
SOK2P53438 SOR2YDL246C 1074 nt10.1□□□□□ -0.79
SOK2P53438 SOR1YJR159W 1074 nt10.1□□□□□ -0.79
SOK2P53438 CWP1YKL096W 720 nt10.1□□□□□ -0.79
SOK2P53438 PTH1YHR189W 573 nt10.09□□□□□ -0.79
SOK2P53438 CLB6YGR109C 1143 nt10.07□□□□□ -0.8
SOK2P53438 HUA1YGR268C 597 nt10.04□□□□□ -0.8
SOK2P53438 YLR235CYLR235C 399 nt10.04□□□□□ -0.8
SOK2P53438 ADH2YMR303C 1047 nt10.04□□□□□ -0.8
SOK2P53438 YKL030WYKL030W 606 nt10□□□□□ -0.81
SOK2P53438 PCM1YEL058W 1674 nt9.99□□□□□ -0.81
SOK2P53438 SNF6YHL025W 999 nt9.99□□□□□ -0.81
SOK2P53438 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt9.98□□□□□ -0.81
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