Protein–RNA interactions for Protein: P53330

RTT102, Regulator of Ty1 transposition protein 102, yeastyeast

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTT102P53330 SIS1YNL007C 1059 nt13.36□□□□□ -0.27
RTT102P53330 DSK2YMR276W 1122 nt13.31□□□□□ -0.28
RTT102P53330 MEP2YNL142W 1500 nt13.3□□□□□ -0.28
RTT102P53330 YPR011CYPR011C 981 nt13.3□□□□□ -0.28
RTT102P53330 YJL152WYJL152W 360 nt13.29□□□□□ -0.28
RTT102P53330 RPP2AYOL039W 321 nt13.28□□□□□ -0.28
RTT102P53330 IMP2'YIL154C 1041 nt13.26□□□□□ -0.29
RTT102P53330 YLR236CYLR236C 324 nt13.26□□□□□ -0.29
RTT102P53330 FMP45YDL222C 930 nt13.22□□□□□ -0.29
RTT102P53330 MOT3YMR070W 1473 nt13.22□□□□□ -0.29
RTT102P53330 PTP1YDL230W 1008 nt13.21□□□□□ -0.29
RTT102P53330 TIR4YOR009W 1464 nt13.21□□□□□ -0.3
RTT102P53330 YCH1YGR203W 447 nt13.2□□□□□ -0.3
RTT102P53330 ART5YGR068C 1761 nt13.15□□□□□ -0.31
RTT102P53330 DCW1YKL046C 1350 nt13.12□□□□□ -0.31
RTT102P53330 IDH1YNL037C 1083 nt13.11□□□□□ -0.31
RTT102P53330 PET9YBL030C 957 nt13.08□□□□□ -0.32
RTT102P53330 CAC2YML102W 1407 nt13.07□□□□□ -0.32
RTT102P53330 GFD2YCL036W 1701 nt13.07□□□□□ -0.32
RTT102P53330 YMR057CYMR057C 372 nt13.05□□□□□ -0.32
RTT102P53330 LPX1YOR084W 1164 nt13.03□□□□□ -0.32
RTT102P53330 ERV46YAL042W 1248 nt13□□□□□ -0.33
RTT102P53330 YDR433WYDR433W 441 nt12.98□□□□□ -0.33
RTT102P53330 GBP2YCL011C 1284 nt12.98□□□□□ -0.33
RTT102P53330 EMI2YDR516C 1503 nt12.96□□□□□ -0.33
RTT102P53330 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.95□□□□□ -0.34
RTT102P53330 RTS2YOR077W 699 nt12.9□□□□□ -0.34
RTT102P53330 YKR040CYKR040C 504 nt12.89□□□□□ -0.35
RTT102P53330 YDL221WYDL221W 552 nt12.87□□□□□ -0.35
RTT102P53330 MXR2YCL033C 507 nt12.87□□□□□ -0.35
RTT102P53330 IRC15YPL017C 1500 nt12.87□□□□□ -0.35
RTT102P53330 SPP1YPL138C 1062 nt12.86□□□□□ -0.35
RTT102P53330 YMR090WYMR090W 684 nt12.84□□□□□ -0.35
RTT102P53330 FPS1YLL043W 2010 nt12.84□□□□□ -0.35
RTT102P53330 SSA4YER103W 1929 nt12.8□□□□□ -0.36
RTT102P53330 TCD2YKL027W 1344 nt12.8□□□□□ -0.36
RTT102P53330 CUE1YMR264W 612 nt12.77□□□□□ -0.37
RTT102P53330 GIS3YLR094C 1509 nt12.76□□□□□ -0.37
RTT102P53330 DED1YOR204W 1815 nt12.74□□□□□ -0.37
RTT102P53330 RRD1YIL153W 1182 nt12.73□□□□□ -0.37
RTT102P53330 MRPL8YJL063C 717 nt12.73□□□□□ -0.37
RTT102P53330 SDH1YKL148C 1923 nt12.68□□□□□ -0.38
RTT102P53330 RTG1YOL067C 534 nt12.65□□□□□ -0.38
RTT102P53330 SCC4YER147C 1875 nt12.64□□□□□ -0.39
RTT102P53330 YBR220CYBR220C 1683 nt12.64□□□□□ -0.39
RTT102P53330 FRD1YEL047C 1413 nt12.63□□□□□ -0.39
RTT102P53330 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.62□□□□□ -0.39
RTT102P53330 YEL076CYEL076C 651 nt12.62□□□□□ -0.39
RTT102P53330 YLR464WYLR464W 651 nt12.62□□□□□ -0.39
RTT102P53330 YIL100WYIL100W 354 nt12.61□□□□□ -0.39
RTT102P53330 FMT1YBL013W 1206 nt12.61□□□□□ -0.39
RTT102P53330 ADO1YJR105W 1023 nt12.59□□□□□ -0.39
RTT102P53330 YCL042WYCL042W 360 nt12.56□□□□□ -0.4
RTT102P53330 SOR2YDL246C 1074 nt12.54□□□□□ -0.4
RTT102P53330 SOR1YJR159W 1074 nt12.54□□□□□ -0.4
RTT102P53330 FMP52YER004W 696 nt12.51□□□□□ -0.41
RTT102P53330 PTH1YHR189W 573 nt12.47□□□□□ -0.41
RTT102P53330 CWP1YKL096W 720 nt12.46□□□□□ -0.41
RTT102P53330 ADH2YMR303C 1047 nt12.43□□□□□ -0.42
RTT102P53330 HUA1YGR268C 597 nt12.41□□□□□ -0.42
RTT102P53330 YLR235CYLR235C 399 nt12.4□□□□□ -0.42
RTT102P53330 YNL195CYNL195C 786 nt12.37□□□□□ -0.43
RTT102P53330 PCM1YEL058W 1674 nt12.36□□□□□ -0.43
RTT102P53330 YKL030WYKL030W 606 nt12.36□□□□□ -0.43
RTT102P53330 RRT12YCR045C 1476 nt12.34□□□□□ -0.43
RTT102P53330 SNF6YHL025W 999 nt12.31□□□□□ -0.44
RTT102P53330 LCB1YMR296C 1677 nt12.31□□□□□ -0.44
RTT102P53330 YSC84YHR016C 1407 nt12.3□□□□□ -0.44
RTT102P53330 UBX6YJL048C 1191 nt12.3□□□□□ -0.44
RTT102P53330 BDF1YLR399C 2061 nt12.26□□□□□ -0.45
RTT102P53330 DIC1YLR348C 897 nt12.26□□□□□ -0.45
RTT102P53330 YHL050CYHL050C 2094 nt12.25□□□□□ -0.45
RTT102P53330 TIM23YNR017W 669 nt12.22□□□□□ -0.45
RTT102P53330 RNQ1YCL028W 1218 nt12.21□□□□□ -0.45
RTT102P53330 YIH1YCR059C 777 nt12.2□□□□□ -0.46
RTT102P53330 YDR094WYDR094W 336 nt12.17□□□□□ -0.46
RTT102P53330 SEC11YIR022W 504 nt12.14□□□□□ -0.47
RTT102P53330 YLR179CYLR179C 606 nt12.14□□□□□ -0.47
RTT102P53330 TAT1YBR069C 1860 nt12.12□□□□□ -0.47
RTT102P53330 BIO4YNR057C 714 nt12.11□□□□□ -0.47
RTT102P53330 SIM1YIL123W 1431 nt12.11□□□□□ -0.47
RTT102P53330 YLL053CYLL053C 459 nt12.09□□□□□ -0.47
RTT102P53330 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt12.06□□□□□ -0.48
RTT102P53330 YPR064WYPR064W 420 nt12.06□□□□□ -0.48
RTT102P53330 PCH2YBR186W 1695 nt12.03□□□□□ -0.48
RTT102P53330 WSC2YNL283C 1512 nt12.03□□□□□ -0.48
RTT102P53330 AHT1YHR093W 549 nt12.02□□□□□ -0.49
RTT102P53330 FTR1YER145C 1215 nt12.01□□□□□ -0.49
RTT102P53330 TAD3YLR316C 969 nt12□□□□□ -0.49
RTT102P53330 GAL1YBR020W 1587 nt11.98□□□□□ -0.49
RTT102P53330 AQY1YPR192W 918 nt11.97□□□□□ -0.49
RTT102P53330 GUT2YIL155C 1950 nt11.96□□□□□ -0.5
RTT102P53330 TRM5YHR070W 1500 nt11.95□□□□□ -0.5
RTT102P53330 YFR018CYFR018C 1092 nt11.92□□□□□ -0.5
RTT102P53330 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.91□□□□□ -0.5
RTT102P53330 NCP1YHR042W 2076 nt11.91□□□□□ -0.5
RTT102P53330 ERF2YLR246W 1080 nt11.9□□□□□ -0.5
RTT102P53330 ATF2YGR177C 1608 nt11.89□□□□□ -0.51
RTT102P53330 STB1YNL309W 1263 nt11.87□□□□□ -0.51
RTT102P53330 PRE6YOL038W 765 nt11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.8 ms