Protein–RNA interactions for Protein: P53316

YGR250C, Uncharacterized RNA-binding protein YGR250C, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YGR250CP53316 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.73□□□□□ -0.53
YGR250CP53316 YJL152WYJL152W 360 nt11.68□□□□□ -0.54
YGR250CP53316 SIS1YNL007C 1059 nt11.67□□□□□ -0.54
YGR250CP53316 MEP2YNL142W 1500 nt11.66□□□□□ -0.54
YGR250CP53316 RPP2AYOL039W 321 nt11.66□□□□□ -0.54
YGR250CP53316 IMP2'YIL154C 1041 nt11.65□□□□□ -0.54
YGR250CP53316 SPT5YML010W 3192 nt11.62□□□□□ -0.55
YGR250CP53316 DSK2YMR276W 1122 nt11.58□□□□□ -0.56
YGR250CP53316 YCH1YGR203W 447 nt11.55□□□□□ -0.56
YGR250CP53316 IDH1YNL037C 1083 nt11.52□□□□□ -0.57
YGR250CP53316 FMP45YDL222C 930 nt11.48□□□□□ -0.57
YGR250CP53316 PET9YBL030C 957 nt11.48□□□□□ -0.57
YGR250CP53316 TIR4YOR009W 1464 nt11.46□□□□□ -0.57
YGR250CP53316 ART5YGR068C 1761 nt11.46□□□□□ -0.58
YGR250CP53316 PTP1YDL230W 1008 nt11.45□□□□□ -0.58
YGR250CP53316 YMR090WYMR090W 684 nt11.45□□□□□ -0.58
YGR250CP53316 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.44□□□□□ -0.58
YGR250CP53316 DCW1YKL046C 1350 nt11.42□□□□□ -0.58
YGR250CP53316 YLR236CYLR236C 324 nt11.39□□□□□ -0.59
YGR250CP53316 CAC2YML102W 1407 nt11.38□□□□□ -0.59
YGR250CP53316 YMR057CYMR057C 372 nt11.38□□□□□ -0.59
YGR250CP53316 GFD2YCL036W 1701 nt11.38□□□□□ -0.59
YGR250CP53316 EMI2YDR516C 1503 nt11.36□□□□□ -0.59
YGR250CP53316 YDR433WYDR433W 441 nt11.35□□□□□ -0.59
YGR250CP53316 GBP2YCL011C 1284 nt11.35□□□□□ -0.59
YGR250CP53316 YPR011CYPR011C 981 nt11.31□□□□□ -0.6
YGR250CP53316 YDL221WYDL221W 552 nt11.29□□□□□ -0.6
YGR250CP53316 ERV46YAL042W 1248 nt11.26□□□□□ -0.61
YGR250CP53316 RTS2YOR077W 699 nt11.26□□□□□ -0.61
YGR250CP53316 LPX1YOR084W 1164 nt11.24□□□□□ -0.61
YGR250CP53316 TCD2YKL027W 1344 nt11.24□□□□□ -0.61
YGR250CP53316 SSA4YER103W 1929 nt11.22□□□□□ -0.61
YGR250CP53316 YKR040CYKR040C 504 nt11.21□□□□□ -0.61
YGR250CP53316 CUE1YMR264W 612 nt11.18□□□□□ -0.62
YGR250CP53316 YIL100WYIL100W 354 nt11.17□□□□□ -0.62
YGR250CP53316 IRC15YPL017C 1500 nt11.17□□□□□ -0.62
YGR250CP53316 FPS1YLL043W 2010 nt11.13□□□□□ -0.63
YGR250CP53316 MXR2YCL033C 507 nt11.12□□□□□ -0.63
YGR250CP53316 GIS3YLR094C 1509 nt11.12□□□□□ -0.63
YGR250CP53316 SDH1YKL148C 1923 nt11.11□□□□□ -0.63
YGR250CP53316 SCC4YER147C 1875 nt11.1□□□□□ -0.63
YGR250CP53316 YCL042WYCL042W 360 nt11.06□□□□□ -0.64
YGR250CP53316 YNL195CYNL195C 786 nt11.03□□□□□ -0.64
YGR250CP53316 YBR220CYBR220C 1683 nt11.03□□□□□ -0.64
YGR250CP53316 MRPL8YJL063C 717 nt11.02□□□□□ -0.65
YGR250CP53316 RRD1YIL153W 1182 nt11.01□□□□□ -0.65
YGR250CP53316 FMP52YER004W 696 nt10.99□□□□□ -0.65
YGR250CP53316 SPP1YPL138C 1062 nt10.99□□□□□ -0.65
YGR250CP53316 ADO1YJR105W 1023 nt10.98□□□□□ -0.65
YGR250CP53316 DED1YOR204W 1815 nt10.96□□□□□ -0.65
YGR250CP53316 FRD1YEL047C 1413 nt10.91□□□□□ -0.66
YGR250CP53316 BDF1YLR399C 2061 nt10.91□□□□□ -0.66
YGR250CP53316 SOR2YDL246C 1074 nt10.9□□□□□ -0.66
YGR250CP53316 SOR1YJR159W 1074 nt10.9□□□□□ -0.66
YGR250CP53316 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.89□□□□□ -0.67
YGR250CP53316 YEL076CYEL076C 651 nt10.89□□□□□ -0.67
YGR250CP53316 YLR464WYLR464W 651 nt10.89□□□□□ -0.67
YGR250CP53316 CWP1YKL096W 720 nt10.88□□□□□ -0.67
YGR250CP53316 YLR235CYLR235C 399 nt10.87□□□□□ -0.67
YGR250CP53316 FMT1YBL013W 1206 nt10.84□□□□□ -0.67
YGR250CP53316 HUA1YGR268C 597 nt10.83□□□□□ -0.68
YGR250CP53316 SNF6YHL025W 999 nt10.82□□□□□ -0.68
YGR250CP53316 RTG1YOL067C 534 nt10.82□□□□□ -0.68
YGR250CP53316 PTH1YHR189W 573 nt10.81□□□□□ -0.68
YGR250CP53316 ADH2YMR303C 1047 nt10.79□□□□□ -0.68
YGR250CP53316 YKL030WYKL030W 606 nt10.78□□□□□ -0.68
YGR250CP53316 YSC84YHR016C 1407 nt10.77□□□□□ -0.68
YGR250CP53316 PCM1YEL058W 1674 nt10.77□□□□□ -0.69
YGR250CP53316 SEC11YIR022W 504 nt10.76□□□□□ -0.69
YGR250CP53316 PAC11YDR488C 1602 nt10.73□□□□□ -0.69
YGR250CP53316 TAT1YBR069C 1860 nt10.72□□□□□ -0.69
YGR250CP53316 RRT12YCR045C 1476 nt10.72□□□□□ -0.69
YGR250CP53316 NVJ2YPR091C 2313 nt10.69□□□□□ -0.7
YGR250CP53316 DIC1YLR348C 897 nt10.69□□□□□ -0.7
YGR250CP53316 LCB1YMR296C 1677 nt10.66□□□□□ -0.7
YGR250CP53316 TIM23YNR017W 669 nt10.66□□□□□ -0.7
YGR250CP53316 RNQ1YCL028W 1218 nt10.65□□□□□ -0.7
YGR250CP53316 YHL050CYHL050C 2094 nt10.64□□□□□ -0.71
YGR250CP53316 YIH1YCR059C 777 nt10.63□□□□□ -0.71
YGR250CP53316 YLR179CYLR179C 606 nt10.63□□□□□ -0.71
YGR250CP53316 SIM1YIL123W 1431 nt10.63□□□□□ -0.71
YGR250CP53316 YPR064WYPR064W 420 nt10.58□□□□□ -0.72
YGR250CP53316 PCH2YBR186W 1695 nt10.57□□□□□ -0.72
YGR250CP53316 BIO4YNR057C 714 nt10.55□□□□□ -0.72
YGR250CP53316 AQY1YPR192W 918 nt10.54□□□□□ -0.72
YGR250CP53316 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.53□□□□□ -0.72
YGR250CP53316 YLL053CYLL053C 459 nt10.53□□□□□ -0.72
YGR250CP53316 YDR094WYDR094W 336 nt10.49□□□□□ -0.73
YGR250CP53316 ERF2YLR246W 1080 nt10.48□□□□□ -0.73
YGR250CP53316 FTR1YER145C 1215 nt10.47□□□□□ -0.73
YGR250CP53316 UBX6YJL048C 1191 nt10.46□□□□□ -0.73
YGR250CP53316 TAD3YLR316C 969 nt10.46□□□□□ -0.73
YGR250CP53316 GUT2YIL155C 1950 nt10.45□□□□□ -0.74
YGR250CP53316 BOP3YNL042W 1191 nt10.45□□□□□ -0.74
YGR250CP53316 DDR2YOL052C-A 186 nt10.45□□□□□ -0.74
YGR250CP53316 YFL067WYFL067W 528 nt10.44□□□□□ -0.74
YGR250CP53316 GAL1YBR020W 1587 nt10.43□□□□□ -0.74
YGR250CP53316 YJL225CYJL225C 5277 nt10.42□□□□□ -0.74
YGR250CP53316 AHT1YHR093W 549 nt10.42□□□□□ -0.74
YGR250CP53316 TRM5YHR070W 1500 nt10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 32.2 ms