Protein–RNA interactions for Protein: P53187

HOP2, Homologous-pairing protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HOP2P53187 PTP1YDL230W 1008 nt12.91□□□□□ -0.34
HOP2P53187 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.88□□□□□ -0.35
HOP2P53187 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.88□□□□□ -0.35
HOP2P53187 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.88□□□□□ -0.35
HOP2P53187 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.88□□□□□ -0.35
HOP2P53187 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.88□□□□□ -0.35
HOP2P53187 TAT1YBR069C 1860 nt12.88□□□□□ -0.35
HOP2P53187 PUS2YGL063W 1113 nt12.85□□□□□ -0.35
HOP2P53187 YJL152WYJL152W 360 nt12.85□□□□□ -0.35
HOP2P53187 ART5YGR068C 1761 nt12.84□□□□□ -0.35
HOP2P53187 CAC2YML102W 1407 nt12.82□□□□□ -0.36
HOP2P53187 EMI2YDR516C 1503 nt12.82□□□□□ -0.36
HOP2P53187 YMR090WYMR090W 684 nt12.81□□□□□ -0.36
HOP2P53187 TIR4YOR009W 1464 nt12.79□□□□□ -0.36
HOP2P53187 YCH1YGR203W 447 nt12.79□□□□□ -0.36
HOP2P53187 PET9YBL030C 957 nt12.79□□□□□ -0.36
HOP2P53187 GFD2YCL036W 1701 nt12.76□□□□□ -0.37
HOP2P53187 YDL221WYDL221W 552 nt12.72□□□□□ -0.37
HOP2P53187 PAC11YDR488C 1602 nt12.72□□□□□ -0.37
HOP2P53187 IMP2'YIL154C 1041 nt12.7□□□□□ -0.38
HOP2P53187 YMR057CYMR057C 372 nt12.69□□□□□ -0.38
HOP2P53187 DSK2YMR276W 1122 nt12.67□□□□□ -0.38
HOP2P53187 YBR220CYBR220C 1683 nt12.65□□□□□ -0.38
HOP2P53187 IDH1YNL037C 1083 nt12.63□□□□□ -0.39
HOP2P53187 IRC15YPL017C 1500 nt12.62□□□□□ -0.39
HOP2P53187 RTS2YOR077W 699 nt12.61□□□□□ -0.39
HOP2P53187 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.6□□□□□ -0.39
HOP2P53187 SDH1YKL148C 1923 nt12.56□□□□□ -0.4
HOP2P53187 YLR236CYLR236C 324 nt12.56□□□□□ -0.4
HOP2P53187 GIS3YLR094C 1509 nt12.55□□□□□ -0.4
HOP2P53187 YPR011CYPR011C 981 nt12.54□□□□□ -0.4
HOP2P53187 FMP45YDL222C 930 nt12.52□□□□□ -0.41
HOP2P53187 SCC4YER147C 1875 nt12.51□□□□□ -0.41
HOP2P53187 CUE1YMR264W 612 nt12.51□□□□□ -0.41
HOP2P53187 GBP2YCL011C 1284 nt12.51□□□□□ -0.41
HOP2P53187 FPS1YLL043W 2010 nt12.5□□□□□ -0.41
HOP2P53187 YDR433WYDR433W 441 nt12.45□□□□□ -0.42
HOP2P53187 YIL100WYIL100W 354 nt12.41□□□□□ -0.42
HOP2P53187 TCD2YKL027W 1344 nt12.38□□□□□ -0.43
HOP2P53187 ERV46YAL042W 1248 nt12.38□□□□□ -0.43
HOP2P53187 LPX1YOR084W 1164 nt12.37□□□□□ -0.43
HOP2P53187 YJL225CYJL225C 5277 nt12.35□□□□□ -0.43
HOP2P53187 MOT3YMR070W 1473 nt12.35□□□□□ -0.43
HOP2P53187 NVJ2YPR091C 2313 nt12.34□□□□□ -0.43
HOP2P53187 SEC11YIR022W 504 nt12.33□□□□□ -0.44
HOP2P53187 PCH2YBR186W 1695 nt12.32□□□□□ -0.44
HOP2P53187 YKR040CYKR040C 504 nt12.32□□□□□ -0.44
HOP2P53187 MXR2YCL033C 507 nt12.3□□□□□ -0.44
HOP2P53187 RRD1YIL153W 1182 nt12.29□□□□□ -0.44
HOP2P53187 GUT2YIL155C 1950 nt12.28□□□□□ -0.44
HOP2P53187 YNL195CYNL195C 786 nt12.26□□□□□ -0.45
HOP2P53187 DED1YOR204W 1815 nt12.25□□□□□ -0.45
HOP2P53187 YSC84YHR016C 1407 nt12.19□□□□□ -0.46
HOP2P53187 FMP52YER004W 696 nt12.17□□□□□ -0.46
HOP2P53187 YCL042WYCL042W 360 nt12.15□□□□□ -0.46
HOP2P53187 RRT12YCR045C 1476 nt12.14□□□□□ -0.47
HOP2P53187 FMT1YBL013W 1206 nt12.13□□□□□ -0.47
HOP2P53187 YHL050CYHL050C 2094 nt12.1□□□□□ -0.47
HOP2P53187 SPP1YPL138C 1062 nt12.1□□□□□ -0.47
HOP2P53187 FRD1YEL047C 1413 nt12.1□□□□□ -0.47
HOP2P53187 PIB2YGL023C 1908 nt12.09□□□□□ -0.47
HOP2P53187 SOR2YDL246C 1074 nt12.07□□□□□ -0.48
HOP2P53187 SOR1YJR159W 1074 nt12.07□□□□□ -0.48
HOP2P53187 CWP1YKL096W 720 nt12.07□□□□□ -0.48
HOP2P53187 ADH2YMR303C 1047 nt12.03□□□□□ -0.48
HOP2P53187 PCM1YEL058W 1674 nt12.03□□□□□ -0.48
HOP2P53187 RDN37-1RDN37-1 5354 nt12□□□□□ -0.49
HOP2P53187 RDN37-2RDN37-2 5354 nt12□□□□□ -0.49
HOP2P53187 SNF6YHL025W 999 nt11.99□□□□□ -0.49
HOP2P53187 RTF1YGL244W 1677 nt11.97□□□□□ -0.49
HOP2P53187 PTH1YHR189W 573 nt11.9□□□□□ -0.5
HOP2P53187 YLR235CYLR235C 399 nt11.89□□□□□ -0.51
HOP2P53187 BOP3YNL042W 1191 nt11.88□□□□□ -0.51
HOP2P53187 MRPL8YJL063C 717 nt11.87□□□□□ -0.51
HOP2P53187 SIM1YIL123W 1431 nt11.86□□□□□ -0.51
HOP2P53187 RTG1YOL067C 534 nt11.85□□□□□ -0.51
HOP2P53187 RNQ1YCL028W 1218 nt11.83□□□□□ -0.52
HOP2P53187 YIH1YCR059C 777 nt11.82□□□□□ -0.52
HOP2P53187 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.82□□□□□ -0.52
HOP2P53187 YEL076CYEL076C 651 nt11.82□□□□□ -0.52
HOP2P53187 DIC1YLR348C 897 nt11.82□□□□□ -0.52
HOP2P53187 YLR464WYLR464W 651 nt11.82□□□□□ -0.52
HOP2P53187 LCB1YMR296C 1677 nt11.81□□□□□ -0.52
HOP2P53187 ADO1YJR105W 1023 nt11.81□□□□□ -0.52
HOP2P53187 YKL030WYKL030W 606 nt11.81□□□□□ -0.52
HOP2P53187 PTK1YKL198C 1989 nt11.8□□□□□ -0.52
HOP2P53187 BIO4YNR057C 714 nt11.8□□□□□ -0.52
HOP2P53187 NCP1YHR042W 2076 nt11.75□□□□□ -0.53
HOP2P53187 TIM23YNR017W 669 nt11.74□□□□□ -0.53
HOP2P53187 HUA1YGR268C 597 nt11.73□□□□□ -0.53
HOP2P53187 YLL053CYLL053C 459 nt11.73□□□□□ -0.53
HOP2P53187 YLR179CYLR179C 606 nt11.69□□□□□ -0.54
HOP2P53187 FTR1YER145C 1215 nt11.65□□□□□ -0.54
HOP2P53187 ERF2YLR246W 1080 nt11.65□□□□□ -0.54
HOP2P53187 AQY1YPR192W 918 nt11.62□□□□□ -0.55
HOP2P53187 GAL1YBR020W 1587 nt11.61□□□□□ -0.55
HOP2P53187 YPR064WYPR064W 420 nt11.6□□□□□ -0.55
HOP2P53187 TRM5YHR070W 1500 nt11.6□□□□□ -0.55
HOP2P53187 YFL067WYFL067W 528 nt11.58□□□□□ -0.56
HOP2P53187 LYS4YDR234W 2082 nt11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.4 ms