Protein–RNA interactions for Protein: P53047

RTA1, Protein RTA1, yeastyeast

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTA1P53047 YDL221WYDL221W 552 nt12.62□□□□□ -0.39
RTA1P53047 NPL3YDR432W 1245 nt12.57□□□□□ -0.4
RTA1P53047 YOR139CYOR139C 393 nt12.56□□□□□ -0.4
RTA1P53047 ART5YGR068C 1761 nt12.55□□□□□ -0.4
RTA1P53047 YBR220CYBR220C 1683 nt12.51□□□□□ -0.41
RTA1P53047 GFD2YCL036W 1701 nt12.51□□□□□ -0.41
RTA1P53047 PET9YBL030C 957 nt12.5□□□□□ -0.41
RTA1P53047 SDH1YKL148C 1923 nt12.49□□□□□ -0.41
RTA1P53047 YCH1YGR203W 447 nt12.48□□□□□ -0.41
RTA1P53047 IRC15YPL017C 1500 nt12.47□□□□□ -0.41
RTA1P53047 BDF1YLR399C 2061 nt12.46□□□□□ -0.41
RTA1P53047 TIR4YOR009W 1464 nt12.46□□□□□ -0.42
RTA1P53047 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.43□□□□□ -0.42
RTA1P53047 YJL152WYJL152W 360 nt12.41□□□□□ -0.42
RTA1P53047 SCC4YER147C 1875 nt12.4□□□□□ -0.42
RTA1P53047 RTS2YOR077W 699 nt12.4□□□□□ -0.42
RTA1P53047 GIS3YLR094C 1509 nt12.39□□□□□ -0.43
RTA1P53047 YMR057CYMR057C 372 nt12.36□□□□□ -0.43
RTA1P53047 WHI5YOR083W 888 nt12.33□□□□□ -0.44
RTA1P53047 YLR281CYLR281C 468 nt12.32□□□□□ -0.44
RTA1P53047 TAT1YBR069C 1860 nt12.31□□□□□ -0.44
RTA1P53047 CUE1YMR264W 612 nt12.29□□□□□ -0.44
RTA1P53047 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.23□□□□□ -0.45
RTA1P53047 FPS1YLL043W 2010 nt12.2□□□□□ -0.46
RTA1P53047 YIL100WYIL100W 354 nt12.19□□□□□ -0.46
RTA1P53047 YLR236CYLR236C 324 nt12.18□□□□□ -0.46
RTA1P53047 PUS2YGL063W 1113 nt12.15□□□□□ -0.46
RTA1P53047 SEC11YIR022W 504 nt12.15□□□□□ -0.46
RTA1P53047 IDH1YNL037C 1083 nt12.12□□□□□ -0.47
RTA1P53047 YNL195CYNL195C 786 nt12.11□□□□□ -0.47
RTA1P53047 YSC84YHR016C 1407 nt12.11□□□□□ -0.47
RTA1P53047 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.1□□□□□ -0.47
RTA1P53047 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.1□□□□□ -0.47
RTA1P53047 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.1□□□□□ -0.47
RTA1P53047 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.1□□□□□ -0.47
RTA1P53047 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.1□□□□□ -0.47
RTA1P53047 IMP2'YIL154C 1041 nt12.1□□□□□ -0.47
RTA1P53047 PCH2YBR186W 1695 nt12.06□□□□□ -0.48
RTA1P53047 DSK2YMR276W 1122 nt12.05□□□□□ -0.48
RTA1P53047 GBP2YCL011C 1284 nt12.04□□□□□ -0.48
RTA1P53047 RRT12YCR045C 1476 nt12.02□□□□□ -0.48
RTA1P53047 YHL050CYHL050C 2094 nt12.01□□□□□ -0.49
RTA1P53047 GUT2YIL155C 1950 nt11.99□□□□□ -0.49
RTA1P53047 TCD2YKL027W 1344 nt11.94□□□□□ -0.5
RTA1P53047 YDR433WYDR433W 441 nt11.91□□□□□ -0.5
RTA1P53047 RRD1YIL153W 1182 nt11.91□□□□□ -0.5
RTA1P53047 YPR011CYPR011C 981 nt11.91□□□□□ -0.5
RTA1P53047 FMP52YER004W 696 nt11.85□□□□□ -0.51
RTA1P53047 DED1YOR204W 1815 nt11.84□□□□□ -0.51
RTA1P53047 FMP45YDL222C 930 nt11.84□□□□□ -0.51
RTA1P53047 ERV46YAL042W 1248 nt11.81□□□□□ -0.52
RTA1P53047 MXR2YCL033C 507 nt11.8□□□□□ -0.52
RTA1P53047 RTF1YGL244W 1677 nt11.8□□□□□ -0.52
RTA1P53047 LPX1YOR084W 1164 nt11.79□□□□□ -0.52
RTA1P53047 BOP3YNL042W 1191 nt11.78□□□□□ -0.52
RTA1P53047 YKR040CYKR040C 504 nt11.77□□□□□ -0.53
RTA1P53047 FMT1YBL013W 1206 nt11.75□□□□□ -0.53
RTA1P53047 PIB2YGL023C 1908 nt11.74□□□□□ -0.53
RTA1P53047 PCM1YEL058W 1674 nt11.71□□□□□ -0.53
RTA1P53047 CWP1YKL096W 720 nt11.71□□□□□ -0.53
RTA1P53047 YCL042WYCL042W 360 nt11.71□□□□□ -0.53
RTA1P53047 ADH2YMR303C 1047 nt11.68□□□□□ -0.54
RTA1P53047 SOR2YDL246C 1074 nt11.66□□□□□ -0.54
RTA1P53047 SNF6YHL025W 999 nt11.66□□□□□ -0.54
RTA1P53047 SOR1YJR159W 1074 nt11.66□□□□□ -0.54
RTA1P53047 LCB1YMR296C 1677 nt11.64□□□□□ -0.55
RTA1P53047 NCP1YHR042W 2076 nt11.64□□□□□ -0.55
RTA1P53047 SIM1YIL123W 1431 nt11.63□□□□□ -0.55
RTA1P53047 FRD1YEL047C 1413 nt11.61□□□□□ -0.55
RTA1P53047 PTK1YKL198C 1989 nt11.57□□□□□ -0.56
RTA1P53047 BIO4YNR057C 714 nt11.54□□□□□ -0.56
RTA1P53047 YIH1YCR059C 777 nt11.5□□□□□ -0.57
RTA1P53047 RNQ1YCL028W 1218 nt11.48□□□□□ -0.57
RTA1P53047 SPP1YPL138C 1062 nt11.46□□□□□ -0.57
RTA1P53047 YJL225CYJL225C 5277 nt11.46□□□□□ -0.57
RTA1P53047 PAC11YDR488C 1602 nt11.43□□□□□ -0.58
RTA1P53047 YFL054CYFL054C 1941 nt11.43□□□□□ -0.58
RTA1P53047 YLL053CYLL053C 459 nt11.42□□□□□ -0.58
RTA1P53047 DIC1YLR348C 897 nt11.42□□□□□ -0.58
RTA1P53047 ERF2YLR246W 1080 nt11.41□□□□□ -0.58
RTA1P53047 PTH1YHR189W 573 nt11.38□□□□□ -0.59
RTA1P53047 YLR235CYLR235C 399 nt11.38□□□□□ -0.59
RTA1P53047 LYS4YDR234W 2082 nt11.38□□□□□ -0.59
RTA1P53047 CRR1YLR213C 1269 nt11.34□□□□□ -0.59
RTA1P53047 FTR1YER145C 1215 nt11.33□□□□□ -0.6
RTA1P53047 YFL067WYFL067W 528 nt11.29□□□□□ -0.6
RTA1P53047 SPT8YLR055C 1809 nt11.29□□□□□ -0.6
RTA1P53047 GAL1YBR020W 1587 nt11.28□□□□□ -0.6
RTA1P53047 ATF2YGR177C 1608 nt11.28□□□□□ -0.6
RTA1P53047 TIM23YNR017W 669 nt11.28□□□□□ -0.6
RTA1P53047 TRM5YHR070W 1500 nt11.27□□□□□ -0.61
RTA1P53047 HEM12YDR047W 1089 nt11.26□□□□□ -0.61
RTA1P53047 YKL030WYKL030W 606 nt11.26□□□□□ -0.61
RTA1P53047 DDR2YOL052C-A 186 nt11.26□□□□□ -0.61
RTA1P53047 AQY1YPR192W 918 nt11.26□□□□□ -0.61
RTA1P53047 YLR179CYLR179C 606 nt11.24□□□□□ -0.61
RTA1P53047 MIC10YCL057C-A 294 nt11.2□□□□□ -0.62
RTA1P53047 SNG1YGR197C 1644 nt11.2□□□□□ -0.62
RTA1P53047 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.18□□□□□ -0.62
RTA1P53047 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.18□□□□□ -0.62
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