Protein–RNA interactions for Protein: P47976

CTH1, mRNA decay factor CTH1, yeastyeast

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTH1P47976 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt15.48■□□□□ 0.07
CTH1P47976 INM2YDR287W 879 nt15.47■□□□□ 0.07
CTH1P47976 TRM9YML014W 840 nt15.46■□□□□ 0.07
CTH1P47976 ERV46YAL042W 1248 nt15.43■□□□□ 0.06
CTH1P47976 FPR4YLR449W 1179 nt15.41■□□□□ 0.06
CTH1P47976 FUN26YAL022C 1554 nt15.38■□□□□ 0.05
CTH1P47976 YDR094WYDR094W 336 nt15.38■□□□□ 0.05
CTH1P47976 BUD23YCR047C 828 nt15.37■□□□□ 0.05
CTH1P47976 NAB2YGL122C 1578 nt15.36■□□□□ 0.05
CTH1P47976 DAL1YIR027C 1383 nt15.34■□□□□ 0.05
CTH1P47976 FIS1YIL065C 468 nt15.3■□□□□ 0.04
CTH1P47976 YDR433WYDR433W 441 nt15.28■□□□□ 0.04
CTH1P47976 YJL152WYJL152W 360 nt15.28■□□□□ 0.04
CTH1P47976 HUA1YGR268C 597 nt15.25■□□□□ 0.03
CTH1P47976 CCT6YDR188W 1641 nt15.25■□□□□ 0.03
CTH1P47976 PHO4YFR034C 939 nt15.22■□□□□ 0.03
CTH1P47976 YKR040CYKR040C 504 nt15.21■□□□□ 0.03
CTH1P47976 IDH1YNL037C 1083 nt15.21■□□□□ 0.03
CTH1P47976 SBA1YKL117W 651 nt15.18■□□□□ 0.02
CTH1P47976 MXR2YCL033C 507 nt15.14■□□□□ 0.01
CTH1P47976 GBP2YCL011C 1284 nt15.02■□□□□ -0
CTH1P47976 SUF2tP(AGG)C 72 nt15.01□□□□□ -0.01
CTH1P47976 SUF10tP(AGG)N 72 nt15.01□□□□□ -0.01
CTH1P47976 SPT5YML010W 3192 nt14.98□□□□□ -0.01
CTH1P47976 ALF1YNL148C 765 nt14.95□□□□□ -0.02
CTH1P47976 YPS1YLR120C 1710 nt14.89□□□□□ -0.03
CTH1P47976 TIR4YOR009W 1464 nt14.85□□□□□ -0.03
CTH1P47976 PAU16YKL224C 372 nt14.81□□□□□ -0.04
CTH1P47976 PTH1YHR189W 573 nt14.78□□□□□ -0.04
CTH1P47976 FRD1YEL047C 1413 nt14.72□□□□□ -0.05
CTH1P47976 YKL030WYKL030W 606 nt14.69□□□□□ -0.06
CTH1P47976 TCD2YKL027W 1344 nt14.68□□□□□ -0.06
CTH1P47976 YDR095CYDR095C 411 nt14.65□□□□□ -0.06
CTH1P47976 CAC2YML102W 1407 nt14.64□□□□□ -0.07
CTH1P47976 SSA4YER103W 1929 nt14.63□□□□□ -0.07
CTH1P47976 PRE6YOL038W 765 nt14.61□□□□□ -0.07
CTH1P47976 YLR235CYLR235C 399 nt14.6□□□□□ -0.07
CTH1P47976 LCB1YMR296C 1677 nt14.59□□□□□ -0.07
CTH1P47976 YMR057CYMR057C 372 nt14.59□□□□□ -0.07
CTH1P47976 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt14.59□□□□□ -0.07
CTH1P47976 DED1YOR204W 1815 nt14.57□□□□□ -0.08
CTH1P47976 YFR018CYFR018C 1092 nt14.54□□□□□ -0.08
CTH1P47976 RRT5YFR032C 870 nt14.54□□□□□ -0.08
CTH1P47976 ART5YGR068C 1761 nt14.5□□□□□ -0.09
CTH1P47976 RRD1YIL153W 1182 nt14.46□□□□□ -0.09
CTH1P47976 SNF6YHL025W 999 nt14.43□□□□□ -0.1
CTH1P47976 YCL042WYCL042W 360 nt14.42□□□□□ -0.1
CTH1P47976 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt14.41□□□□□ -0.1
CTH1P47976 FMT1YBL013W 1206 nt14.39□□□□□ -0.11
CTH1P47976 PET9YBL030C 957 nt14.38□□□□□ -0.11
CTH1P47976 RPP2AYOL039W 321 nt14.37□□□□□ -0.11
CTH1P47976 MEP2YNL142W 1500 nt14.36□□□□□ -0.11
CTH1P47976 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt14.36□□□□□ -0.11
CTH1P47976 SOR2YDL246C 1074 nt14.34□□□□□ -0.11
CTH1P47976 SOR1YJR159W 1074 nt14.34□□□□□ -0.11
CTH1P47976 GFD2YCL036W 1701 nt14.32□□□□□ -0.12
CTH1P47976 PTP1YDL230W 1008 nt14.29□□□□□ -0.12
CTH1P47976 DIC1YLR348C 897 nt14.26□□□□□ -0.13
CTH1P47976 FPS1YLL043W 2010 nt14.23□□□□□ -0.13
CTH1P47976 YFL066CYFL066C 1179 nt14.2□□□□□ -0.14
CTH1P47976 TIM23YNR017W 669 nt14.2□□□□□ -0.14
CTH1P47976 DCW1YKL046C 1350 nt14.18□□□□□ -0.14
CTH1P47976 NAT4YMR069W 858 nt14.17□□□□□ -0.14
CTH1P47976 CWP1YKL096W 720 nt14.14□□□□□ -0.15
CTH1P47976 BDF1YLR399C 2061 nt14.14□□□□□ -0.15
CTH1P47976 YMR244WYMR244W 1068 nt14.11□□□□□ -0.15
CTH1P47976 RTS2YOR077W 699 nt14.11□□□□□ -0.15
CTH1P47976 YLR179CYLR179C 606 nt14.09□□□□□ -0.15
CTH1P47976 ADH2YMR303C 1047 nt14.07□□□□□ -0.16
CTH1P47976 YPR064WYPR064W 420 nt14.06□□□□□ -0.16
CTH1P47976 TAD3YLR316C 969 nt14.03□□□□□ -0.16
CTH1P47976 GLK1YCL040W 1503 nt14□□□□□ -0.17
CTH1P47976 PEX25YPL112C 1185 nt14□□□□□ -0.17
CTH1P47976 MSF1YPR047W 1410 nt13.98□□□□□ -0.17
CTH1P47976 WSC2YNL283C 1512 nt13.98□□□□□ -0.17
CTH1P47976 FMP52YER004W 696 nt13.97□□□□□ -0.17
CTH1P47976 EMI2YDR516C 1503 nt13.94□□□□□ -0.18
CTH1P47976 TAT1YBR069C 1860 nt13.93□□□□□ -0.18
CTH1P47976 AHT1YHR093W 549 nt13.89□□□□□ -0.19
CTH1P47976 YNL115CYNL115C 1935 nt13.88□□□□□ -0.19
CTH1P47976 YBR220CYBR220C 1683 nt13.86□□□□□ -0.19
CTH1P47976 THI74YDR438W 1113 nt13.86□□□□□ -0.19
CTH1P47976 CUE1YMR264W 612 nt13.86□□□□□ -0.19
CTH1P47976 GLR1YPL091W 1452 nt13.84□□□□□ -0.19
CTH1P47976 YSP3YOR003W 1437 nt13.83□□□□□ -0.2
CTH1P47976 MIR1YJR077C 936 nt13.83□□□□□ -0.2
CTH1P47976 IRC15YPL017C 1500 nt13.8□□□□□ -0.2
CTH1P47976 YDL221WYDL221W 552 nt13.79□□□□□ -0.2
CTH1P47976 RBG2YGR173W 1107 nt13.79□□□□□ -0.2
CTH1P47976 BDH1YAL060W 1149 nt13.79□□□□□ -0.2
CTH1P47976 YMR090WYMR090W 684 nt13.78□□□□□ -0.2
CTH1P47976 PCM1YEL058W 1674 nt13.76□□□□□ -0.21
CTH1P47976 RNQ1YCL028W 1218 nt13.76□□□□□ -0.21
CTH1P47976 SDH1YKL148C 1923 nt13.72□□□□□ -0.21
CTH1P47976 YIH1YCR059C 777 nt13.7□□□□□ -0.22
CTH1P47976 YIL100WYIL100W 354 nt13.67□□□□□ -0.22
CTH1P47976 YLR415CYLR415C 339 nt13.67□□□□□ -0.22
CTH1P47976 DAT1YML113W 747 nt13.67□□□□□ -0.22
CTH1P47976 GIS3YLR094C 1509 nt13.66□□□□□ -0.22
CTH1P47976 YSC84YHR016C 1407 nt13.63□□□□□ -0.23
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