Protein–RNA interactions for Protein: P47053

YJL043W, Uncharacterized protein YJL043W, yeastyeast

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJL043WP47053 YOL037CYOL037C 354 nt11.69□□□□□ -0.54
YJL043WP47053 ART5YGR068C 1761 nt11.64□□□□□ -0.55
YJL043WP47053 GFD2YCL036W 1701 nt11.62□□□□□ -0.55
YJL043WP47053 YBR220CYBR220C 1683 nt11.61□□□□□ -0.55
YJL043WP47053 PAC11YDR488C 1602 nt11.6□□□□□ -0.55
YJL043WP47053 TIR4YOR009W 1464 nt11.58□□□□□ -0.56
YJL043WP47053 IRC15YPL017C 1500 nt11.58□□□□□ -0.56
YJL043WP47053 BDF1YLR399C 2061 nt11.58□□□□□ -0.56
YJL043WP47053 SDH1YKL148C 1923 nt11.57□□□□□ -0.56
YJL043WP47053 RTS2YOR077W 699 nt11.55□□□□□ -0.56
YJL043WP47053 PET9YBL030C 957 nt11.54□□□□□ -0.56
YJL043WP47053 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.51□□□□□ -0.57
YJL043WP47053 GIS3YLR094C 1509 nt11.5□□□□□ -0.57
YJL043WP47053 YCH1YGR203W 447 nt11.5□□□□□ -0.57
YJL043WP47053 SCC4YER147C 1875 nt11.49□□□□□ -0.57
YJL043WP47053 YJL152WYJL152W 360 nt11.48□□□□□ -0.57
YJL043WP47053 YMR057CYMR057C 372 nt11.46□□□□□ -0.57
YJL043WP47053 TAT1YBR069C 1860 nt11.44□□□□□ -0.58
YJL043WP47053 YLR281CYLR281C 468 nt11.42□□□□□ -0.58
YJL043WP47053 WHI5YOR083W 888 nt11.42□□□□□ -0.58
YJL043WP47053 NVJ2YPR091C 2313 nt11.4□□□□□ -0.58
YJL043WP47053 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.39□□□□□ -0.59
YJL043WP47053 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.39□□□□□ -0.59
YJL043WP47053 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.39□□□□□ -0.59
YJL043WP47053 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.39□□□□□ -0.59
YJL043WP47053 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.39□□□□□ -0.59
YJL043WP47053 CUE1YMR264W 612 nt11.38□□□□□ -0.59
YJL043WP47053 FPS1YLL043W 2010 nt11.33□□□□□ -0.6
YJL043WP47053 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.31□□□□□ -0.6
YJL043WP47053 PUS2YGL063W 1113 nt11.27□□□□□ -0.61
YJL043WP47053 YIL100WYIL100W 354 nt11.26□□□□□ -0.61
YJL043WP47053 YSC84YHR016C 1407 nt11.24□□□□□ -0.61
YJL043WP47053 YLR236CYLR236C 324 nt11.23□□□□□ -0.61
YJL043WP47053 IDH1YNL037C 1083 nt11.21□□□□□ -0.61
YJL043WP47053 SEC11YIR022W 504 nt11.19□□□□□ -0.62
YJL043WP47053 DSK2YMR276W 1122 nt11.18□□□□□ -0.62
YJL043WP47053 RRT12YCR045C 1476 nt11.17□□□□□ -0.62
YJL043WP47053 PCH2YBR186W 1695 nt11.17□□□□□ -0.62
YJL043WP47053 YHL050CYHL050C 2094 nt11.16□□□□□ -0.62
YJL043WP47053 YNL195CYNL195C 786 nt11.15□□□□□ -0.62
YJL043WP47053 GBP2YCL011C 1284 nt11.15□□□□□ -0.62
YJL043WP47053 IMP2'YIL154C 1041 nt11.14□□□□□ -0.63
YJL043WP47053 GUT2YIL155C 1950 nt11.11□□□□□ -0.63
YJL043WP47053 YPR011CYPR011C 981 nt11.11□□□□□ -0.63
YJL043WP47053 RRD1YIL153W 1182 nt11.07□□□□□ -0.64
YJL043WP47053 TCD2YKL027W 1344 nt11.05□□□□□ -0.64
YJL043WP47053 YDR433WYDR433W 441 nt11.04□□□□□ -0.64
YJL043WP47053 DED1YOR204W 1815 nt11.02□□□□□ -0.65
YJL043WP47053 FMP45YDL222C 930 nt11□□□□□ -0.65
YJL043WP47053 MXR2YCL033C 507 nt10.99□□□□□ -0.65
YJL043WP47053 LPX1YOR084W 1164 nt10.98□□□□□ -0.65
YJL043WP47053 MOT3YMR070W 1473 nt10.98□□□□□ -0.65
YJL043WP47053 Q0182Q0182 405 nt10.97□□□□□ -0.65
YJL043WP47053 ERV46YAL042W 1248 nt10.95□□□□□ -0.66
YJL043WP47053 PIB2YGL023C 1908 nt10.94□□□□□ -0.66
YJL043WP47053 FMP52YER004W 696 nt10.94□□□□□ -0.66
YJL043WP47053 FMT1YBL013W 1206 nt10.93□□□□□ -0.66
YJL043WP47053 RTF1YGL244W 1677 nt10.92□□□□□ -0.66
YJL043WP47053 YKR040CYKR040C 504 nt10.88□□□□□ -0.67
YJL043WP47053 BOP3YNL042W 1191 nt10.87□□□□□ -0.67
YJL043WP47053 PCM1YEL058W 1674 nt10.85□□□□□ -0.67
YJL043WP47053 CWP1YKL096W 720 nt10.85□□□□□ -0.67
YJL043WP47053 ADH2YMR303C 1047 nt10.84□□□□□ -0.67
YJL043WP47053 SOR2YDL246C 1074 nt10.83□□□□□ -0.68
YJL043WP47053 SOR1YJR159W 1074 nt10.83□□□□□ -0.68
YJL043WP47053 LCB1YMR296C 1677 nt10.82□□□□□ -0.68
YJL043WP47053 NCP1YHR042W 2076 nt10.82□□□□□ -0.68
YJL043WP47053 YCL042WYCL042W 360 nt10.82□□□□□ -0.68
YJL043WP47053 FRD1YEL047C 1413 nt10.79□□□□□ -0.68
YJL043WP47053 SNF6YHL025W 999 nt10.79□□□□□ -0.68
YJL043WP47053 SIM1YIL123W 1431 nt10.77□□□□□ -0.68
YJL043WP47053 SPP1YPL138C 1062 nt10.76□□□□□ -0.69
YJL043WP47053 PTK1YKL198C 1989 nt10.74□□□□□ -0.69
YJL043WP47053 BIO4YNR057C 714 nt10.71□□□□□ -0.69
YJL043WP47053 YIH1YCR059C 777 nt10.64□□□□□ -0.71
YJL043WP47053 RNQ1YCL028W 1218 nt10.61□□□□□ -0.71
YJL043WP47053 PTH1YHR189W 573 nt10.6□□□□□ -0.71
YJL043WP47053 DIC1YLR348C 897 nt10.59□□□□□ -0.71
YJL043WP47053 LYS4YDR234W 2082 nt10.58□□□□□ -0.72
YJL043WP47053 YLL053CYLL053C 459 nt10.58□□□□□ -0.72
YJL043WP47053 YFL054CYFL054C 1941 nt10.57□□□□□ -0.72
YJL043WP47053 UME6YDR207C 2511 nt10.57□□□□□ -0.72
YJL043WP47053 ERF2YLR246W 1080 nt10.54□□□□□ -0.72
YJL043WP47053 CRR1YLR213C 1269 nt10.53□□□□□ -0.72
YJL043WP47053 RTG1YOL067C 534 nt10.53□□□□□ -0.72
YJL043WP47053 MRPL8YJL063C 717 nt10.51□□□□□ -0.73
YJL043WP47053 YLR235CYLR235C 399 nt10.51□□□□□ -0.73
YJL043WP47053 FTR1YER145C 1215 nt10.49□□□□□ -0.73
YJL043WP47053 ATF2YGR177C 1608 nt10.48□□□□□ -0.73
YJL043WP47053 SPT8YLR055C 1809 nt10.47□□□□□ -0.73
YJL043WP47053 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.47□□□□□ -0.73
YJL043WP47053 YEL076CYEL076C 651 nt10.47□□□□□ -0.73
YJL043WP47053 YLR464WYLR464W 651 nt10.47□□□□□ -0.73
YJL043WP47053 TRM5YHR070W 1500 nt10.46□□□□□ -0.74
YJL043WP47053 GAL1YBR020W 1587 nt10.46□□□□□ -0.74
YJL043WP47053 TIM23YNR017W 669 nt10.45□□□□□ -0.74
YJL043WP47053 HEM12YDR047W 1089 nt10.42□□□□□ -0.74
YJL043WP47053 YFL067WYFL067W 528 nt10.42□□□□□ -0.74
YJL043WP47053 YLR179CYLR179C 606 nt10.42□□□□□ -0.74
YJL043WP47053 YKL030WYKL030W 606 nt10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8.6 ms