Protein–RNA interactions for Protein: P40486

SHQ1, Protein SHQ1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHQ1P40486 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.45□□□□□ -0.26
SHQ1P40486 YMR090WYMR090W 684 nt13.45□□□□□ -0.26
SHQ1P40486 RKM5YLR137W 1104 nt13.42□□□□□ -0.26
SHQ1P40486 TAT1YBR069C 1860 nt13.37□□□□□ -0.27
SHQ1P40486 SDH1YKL148C 1923 nt13.36□□□□□ -0.27
SHQ1P40486 IRC15YPL017C 1500 nt13.34□□□□□ -0.27
SHQ1P40486 ART5YGR068C 1761 nt13.32□□□□□ -0.28
SHQ1P40486 GFD2YCL036W 1701 nt13.3□□□□□ -0.28
SHQ1P40486 GIS3YLR094C 1509 nt13.24□□□□□ -0.29
SHQ1P40486 SCC4YER147C 1875 nt13.24□□□□□ -0.29
SHQ1P40486 RTS2YOR077W 699 nt13.22□□□□□ -0.29
SHQ1P40486 TIR4YOR009W 1464 nt13.2□□□□□ -0.3
SHQ1P40486 PET9YBL030C 957 nt13.18□□□□□ -0.3
SHQ1P40486 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.17□□□□□ -0.3
SHQ1P40486 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.17□□□□□ -0.3
SHQ1P40486 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.17□□□□□ -0.3
SHQ1P40486 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.17□□□□□ -0.3
SHQ1P40486 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.17□□□□□ -0.3
SHQ1P40486 YLR281CYLR281C 468 nt13.11□□□□□ -0.31
SHQ1P40486 YCH1YGR203W 447 nt13.08□□□□□ -0.32
SHQ1P40486 YMR057CYMR057C 372 nt13.08□□□□□ -0.32
SHQ1P40486 PUS2YGL063W 1113 nt13.04□□□□□ -0.32
SHQ1P40486 WHI5YOR083W 888 nt13.04□□□□□ -0.32
SHQ1P40486 CUE1YMR264W 612 nt13.03□□□□□ -0.32
SHQ1P40486 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13□□□□□ -0.33
SHQ1P40486 YJL152WYJL152W 360 nt12.98□□□□□ -0.33
SHQ1P40486 YSC84YHR016C 1407 nt12.97□□□□□ -0.33
SHQ1P40486 PCH2YBR186W 1695 nt12.97□□□□□ -0.33
SHQ1P40486 FPS1YLL043W 2010 nt12.96□□□□□ -0.34
SHQ1P40486 SEC11YIR022W 504 nt12.95□□□□□ -0.34
SHQ1P40486 GUT2YIL155C 1950 nt12.92□□□□□ -0.34
SHQ1P40486 YHL050CYHL050C 2094 nt12.91□□□□□ -0.34
SHQ1P40486 RRT12YCR045C 1476 nt12.9□□□□□ -0.34
SHQ1P40486 YIL100WYIL100W 354 nt12.86□□□□□ -0.35
SHQ1P40486 IMP2'YIL154C 1041 nt12.86□□□□□ -0.35
SHQ1P40486 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.82□□□□□ -0.36
SHQ1P40486 YLR236CYLR236C 324 nt12.81□□□□□ -0.36
SHQ1P40486 DSK2YMR276W 1122 nt12.8□□□□□ -0.36
SHQ1P40486 YNL195CYNL195C 786 nt12.78□□□□□ -0.36
SHQ1P40486 PIB2YGL023C 1908 nt12.76□□□□□ -0.37
SHQ1P40486 MOT3YMR070W 1473 nt12.72□□□□□ -0.37
SHQ1P40486 FMP45YDL222C 930 nt12.7□□□□□ -0.38
SHQ1P40486 RTF1YGL244W 1677 nt12.65□□□□□ -0.38
SHQ1P40486 YPR011CYPR011C 981 nt12.64□□□□□ -0.39
SHQ1P40486 IDH1YNL037C 1083 nt12.62□□□□□ -0.39
SHQ1P40486 RRD1YIL153W 1182 nt12.6□□□□□ -0.39
SHQ1P40486 GBP2YCL011C 1284 nt12.59□□□□□ -0.39
SHQ1P40486 BOP3YNL042W 1191 nt12.57□□□□□ -0.4
SHQ1P40486 DED1YOR204W 1815 nt12.53□□□□□ -0.4
SHQ1P40486 NCP1YHR042W 2076 nt12.52□□□□□ -0.4
SHQ1P40486 PAC11YDR488C 1602 nt12.52□□□□□ -0.4
SHQ1P40486 PTK1YKL198C 1989 nt12.49□□□□□ -0.41
SHQ1P40486 ERV46YAL042W 1248 nt12.49□□□□□ -0.41
SHQ1P40486 TCD2YKL027W 1344 nt12.48□□□□□ -0.41
SHQ1P40486 LCB1YMR296C 1677 nt12.45□□□□□ -0.42
SHQ1P40486 YDR433WYDR433W 441 nt12.45□□□□□ -0.42
SHQ1P40486 FMT1YBL013W 1206 nt12.45□□□□□ -0.42
SHQ1P40486 LPX1YOR084W 1164 nt12.45□□□□□ -0.42
SHQ1P40486 FMP52YER004W 696 nt12.42□□□□□ -0.42
SHQ1P40486 MXR2YCL033C 507 nt12.42□□□□□ -0.42
SHQ1P40486 YKR040CYKR040C 504 nt12.4□□□□□ -0.42
SHQ1P40486 PCM1YEL058W 1674 nt12.38□□□□□ -0.43
SHQ1P40486 MRPL8YJL063C 717 nt12.37□□□□□ -0.43
SHQ1P40486 ADH2YMR303C 1047 nt12.35□□□□□ -0.43
SHQ1P40486 CWP1YKL096W 720 nt12.34□□□□□ -0.43
SHQ1P40486 SIM1YIL123W 1431 nt12.31□□□□□ -0.44
SHQ1P40486 SOR2YDL246C 1074 nt12.26□□□□□ -0.45
SHQ1P40486 SNF6YHL025W 999 nt12.26□□□□□ -0.45
SHQ1P40486 SOR1YJR159W 1074 nt12.26□□□□□ -0.45
SHQ1P40486 YFL054CYFL054C 1941 nt12.25□□□□□ -0.45
SHQ1P40486 ADO1YJR105W 1023 nt12.24□□□□□ -0.45
SHQ1P40486 SPP1YPL138C 1062 nt12.24□□□□□ -0.45
SHQ1P40486 BIO4YNR057C 714 nt12.23□□□□□ -0.45
SHQ1P40486 YCL042WYCL042W 360 nt12.22□□□□□ -0.45
SHQ1P40486 FRD1YEL047C 1413 nt12.2□□□□□ -0.46
SHQ1P40486 LYS4YDR234W 2082 nt12.19□□□□□ -0.46
SHQ1P40486 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.17□□□□□ -0.46
SHQ1P40486 YEL076CYEL076C 651 nt12.17□□□□□ -0.46
SHQ1P40486 YLR464WYLR464W 651 nt12.17□□□□□ -0.46
SHQ1P40486 SPT8YLR055C 1809 nt12.15□□□□□ -0.46
SHQ1P40486 RTG1YOL067C 534 nt12.13□□□□□ -0.47
SHQ1P40486 YIH1YCR059C 777 nt12.11□□□□□ -0.47
SHQ1P40486 YLL053CYLL053C 459 nt12.06□□□□□ -0.48
SHQ1P40486 RNQ1YCL028W 1218 nt12.06□□□□□ -0.48
SHQ1P40486 CRR1YLR213C 1269 nt12.03□□□□□ -0.48
SHQ1P40486 ERF2YLR246W 1080 nt12.03□□□□□ -0.48
SHQ1P40486 HUA1YGR268C 597 nt12.01□□□□□ -0.49
SHQ1P40486 DIC1YLR348C 897 nt11.99□□□□□ -0.49
SHQ1P40486 ATF2YGR177C 1608 nt11.97□□□□□ -0.49
SHQ1P40486 SWE1YJL187C 2460 nt11.97□□□□□ -0.49
SHQ1P40486 YLR235CYLR235C 399 nt11.96□□□□□ -0.49
SHQ1P40486 FTR1YER145C 1215 nt11.94□□□□□ -0.5
SHQ1P40486 MIC10YCL057C-A 294 nt11.94□□□□□ -0.5
SHQ1P40486 NVJ2YPR091C 2313 nt11.93□□□□□ -0.5
SHQ1P40486 PTH1YHR189W 573 nt11.93□□□□□ -0.5
SHQ1P40486 GAL1YBR020W 1587 nt11.91□□□□□ -0.5
SHQ1P40486 TRM5YHR070W 1500 nt11.91□□□□□ -0.5
SHQ1P40486 YKL030WYKL030W 606 nt11.9□□□□□ -0.5
SHQ1P40486 HEM12YDR047W 1089 nt11.89□□□□□ -0.51
SHQ1P40486 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.89□□□□□ -0.51
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