Protein–RNA interactions for Protein: P40072

SLX8, E3 ubiquitin-protein ligase complex SLX5-SLX8 subunit SLX8, yeastyeast

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Length 274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLX8P40072 PTP1YDL230W 1008 nt12.46□□□□□ -0.41
SLX8P40072 RPP2AYOL039W 321 nt12.42□□□□□ -0.42
SLX8P40072 DCW1YKL046C 1350 nt12.42□□□□□ -0.42
SLX8P40072 YLR281CYLR281C 468 nt12.41□□□□□ -0.42
SLX8P40072 MET8YBR213W 825 nt12.38□□□□□ -0.43
SLX8P40072 SSA4YER103W 1929 nt12.37□□□□□ -0.43
SLX8P40072 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.36□□□□□ -0.43
SLX8P40072 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.36□□□□□ -0.43
SLX8P40072 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.36□□□□□ -0.43
SLX8P40072 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.36□□□□□ -0.43
SLX8P40072 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.36□□□□□ -0.43
SLX8P40072 WHI5YOR083W 888 nt12.34□□□□□ -0.43
SLX8P40072 CAC2YML102W 1407 nt12.32□□□□□ -0.44
SLX8P40072 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.32□□□□□ -0.44
SLX8P40072 Q0010Q0010 387 nt12.32□□□□□ -0.44
SLX8P40072 CLB6YGR109C 1143 nt12.26□□□□□ -0.45
SLX8P40072 TIR4YOR009W 1464 nt12.26□□□□□ -0.45
SLX8P40072 ART5YGR068C 1761 nt12.25□□□□□ -0.45
SLX8P40072 EMI2YDR516C 1503 nt12.25□□□□□ -0.45
SLX8P40072 PUS2YGL063W 1113 nt12.22□□□□□ -0.45
SLX8P40072 GFD2YCL036W 1701 nt12.22□□□□□ -0.45
SLX8P40072 NVJ2YPR091C 2313 nt12.21□□□□□ -0.45
SLX8P40072 YCH1YGR203W 447 nt12.21□□□□□ -0.45
SLX8P40072 PET9YBL030C 957 nt12.2□□□□□ -0.46
SLX8P40072 YDL221WYDL221W 552 nt12.18□□□□□ -0.46
SLX8P40072 YJR154WYJR154W 1041 nt12.17□□□□□ -0.46
SLX8P40072 IRC15YPL017C 1500 nt12.15□□□□□ -0.46
SLX8P40072 CSM2YIL132C 642 nt12.13□□□□□ -0.47
SLX8P40072 YJL152WYJL152W 360 nt12.12□□□□□ -0.47
SLX8P40072 YPR011CYPR011C 981 nt12.12□□□□□ -0.47
SLX8P40072 YMR090WYMR090W 684 nt12.1□□□□□ -0.47
SLX8P40072 YMR057CYMR057C 372 nt12.08□□□□□ -0.48
SLX8P40072 YLR236CYLR236C 324 nt12.07□□□□□ -0.48
SLX8P40072 DSK2YMR276W 1122 nt12.07□□□□□ -0.48
SLX8P40072 IMP2'YIL154C 1041 nt12.06□□□□□ -0.48
SLX8P40072 YBR220CYBR220C 1683 nt12.06□□□□□ -0.48
SLX8P40072 GIS3YLR094C 1509 nt12.03□□□□□ -0.48
SLX8P40072 SDH1YKL148C 1923 nt12.03□□□□□ -0.48
SLX8P40072 RTS2YOR077W 699 nt12.01□□□□□ -0.49
SLX8P40072 CUE1YMR264W 612 nt11.96□□□□□ -0.49
SLX8P40072 BDF1YLR399C 2061 nt11.95□□□□□ -0.5
SLX8P40072 IDH1YNL037C 1083 nt11.95□□□□□ -0.5
SLX8P40072 PAC11YDR488C 1602 nt11.95□□□□□ -0.5
SLX8P40072 SCC4YER147C 1875 nt11.94□□□□□ -0.5
SLX8P40072 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt11.93□□□□□ -0.5
SLX8P40072 FMP45YDL222C 930 nt11.92□□□□□ -0.5
SLX8P40072 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.89□□□□□ -0.51
SLX8P40072 ERV46YAL042W 1248 nt11.88□□□□□ -0.51
SLX8P40072 GBP2YCL011C 1284 nt11.87□□□□□ -0.51
SLX8P40072 LPX1YOR084W 1164 nt11.84□□□□□ -0.51
SLX8P40072 RRD1YIL153W 1182 nt11.81□□□□□ -0.52
SLX8P40072 PAU21YOR394W 495 nt11.81□□□□□ -0.52
SLX8P40072 PAU22YPL282C 495 nt11.81□□□□□ -0.52
SLX8P40072 DED1YOR204W 1815 nt11.8□□□□□ -0.52
SLX8P40072 BSP1YPR171W 1731 nt11.8□□□□□ -0.52
SLX8P40072 YDR433WYDR433W 441 nt11.79□□□□□ -0.52
SLX8P40072 TAT1YBR069C 1860 nt11.78□□□□□ -0.52
SLX8P40072 YKR040CYKR040C 504 nt11.76□□□□□ -0.53
SLX8P40072 MXR2YCL033C 507 nt11.76□□□□□ -0.53
SLX8P40072 TCD2YKL027W 1344 nt11.74□□□□□ -0.53
SLX8P40072 YIL100WYIL100W 354 nt11.72□□□□□ -0.53
SLX8P40072 FMT1YBL013W 1206 nt11.69□□□□□ -0.54
SLX8P40072 ARO7YPR060C 771 nt11.69□□□□□ -0.54
SLX8P40072 PAB1YER165W 1734 nt11.68□□□□□ -0.54
SLX8P40072 YHL050CYHL050C 2094 nt11.65□□□□□ -0.54
SLX8P40072 YSC84YHR016C 1407 nt11.64□□□□□ -0.55
SLX8P40072 RRT12YCR045C 1476 nt11.63□□□□□ -0.55
SLX8P40072 SPP1YPL138C 1062 nt11.63□□□□□ -0.55
SLX8P40072 RSC4YKR008W 1878 nt11.63□□□□□ -0.55
SLX8P40072 FMP52YER004W 696 nt11.62□□□□□ -0.55
SLX8P40072 FRD1YEL047C 1413 nt11.6□□□□□ -0.55
SLX8P40072 SOR2YDL246C 1074 nt11.59□□□□□ -0.55
SLX8P40072 SOR1YJR159W 1074 nt11.59□□□□□ -0.55
SLX8P40072 SEC11YIR022W 504 nt11.58□□□□□ -0.56
SLX8P40072 MAS1YLR163C 1389 nt11.57□□□□□ -0.56
SLX8P40072 YNL195CYNL195C 786 nt11.54□□□□□ -0.56
SLX8P40072 PCH2YBR186W 1695 nt11.53□□□□□ -0.56
SLX8P40072 ADH2YMR303C 1047 nt11.5□□□□□ -0.57
SLX8P40072 SSN3YPL042C 1668 nt11.49□□□□□ -0.57
SLX8P40072 PCM1YEL058W 1674 nt11.49□□□□□ -0.57
SLX8P40072 GUT2YIL155C 1950 nt11.48□□□□□ -0.57
SLX8P40072 CWP1YKL096W 720 nt11.48□□□□□ -0.57
SLX8P40072 YCL042WYCL042W 360 nt11.48□□□□□ -0.57
SLX8P40072 RTG1YOL067C 534 nt11.44□□□□□ -0.58
SLX8P40072 PIB2YGL023C 1908 nt11.41□□□□□ -0.58
SLX8P40072 XDJ1YLR090W 1380 nt11.39□□□□□ -0.59
SLX8P40072 MRPL8YJL063C 717 nt11.38□□□□□ -0.59
SLX8P40072 NCP1YHR042W 2076 nt11.38□□□□□ -0.59
SLX8P40072 SNF6YHL025W 999 nt11.37□□□□□ -0.59
SLX8P40072 MCM5YLR274W 2328 nt11.37□□□□□ -0.59
SLX8P40072 LCB1YMR296C 1677 nt11.36□□□□□ -0.59
SLX8P40072 ADO1YJR105W 1023 nt11.35□□□□□ -0.59
SLX8P40072 YIH1YCR059C 777 nt11.34□□□□□ -0.59
SLX8P40072 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.32□□□□□ -0.6
SLX8P40072 YEL076CYEL076C 651 nt11.32□□□□□ -0.6
SLX8P40072 PTH1YHR189W 573 nt11.32□□□□□ -0.6
SLX8P40072 YLR464WYLR464W 651 nt11.32□□□□□ -0.6
SLX8P40072 RNQ1YCL028W 1218 nt11.31□□□□□ -0.6
SLX8P40072 YDR306CYDR306C 1437 nt11.3□□□□□ -0.6
SLX8P40072 NAS6YGR232W 687 nt11.3□□□□□ -0.6
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