Protein–RNA interactions for Protein: P39981

AVT2, Vacuolar amino acid transporter 2, yeastyeast

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT2P39981 SIS1YNL007C 1059 nt12.87□□□□□ -0.35
AVT2P39981 SSA4YER103W 1929 nt12.84□□□□□ -0.35
AVT2P39981 PTP1YDL230W 1008 nt12.83□□□□□ -0.36
AVT2P39981 RPP2AYOL039W 321 nt12.81□□□□□ -0.36
AVT2P39981 DCW1YKL046C 1350 nt12.81□□□□□ -0.36
AVT2P39981 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.8□□□□□ -0.36
AVT2P39981 DSK2YMR276W 1122 nt12.72□□□□□ -0.37
AVT2P39981 YPR011CYPR011C 981 nt12.72□□□□□ -0.37
AVT2P39981 MOT3YMR070W 1473 nt12.71□□□□□ -0.38
AVT2P39981 CAC2YML102W 1407 nt12.71□□□□□ -0.38
AVT2P39981 TIR4YOR009W 1464 nt12.69□□□□□ -0.38
AVT2P39981 IMP2'YIL154C 1041 nt12.68□□□□□ -0.38
AVT2P39981 YLR236CYLR236C 324 nt12.68□□□□□ -0.38
AVT2P39981 ART5YGR068C 1761 nt12.67□□□□□ -0.38
AVT2P39981 FMP45YDL222C 930 nt12.66□□□□□ -0.38
AVT2P39981 YCH1YGR203W 447 nt12.64□□□□□ -0.39
AVT2P39981 GFD2YCL036W 1701 nt12.62□□□□□ -0.39
AVT2P39981 YJL152WYJL152W 360 nt12.62□□□□□ -0.39
AVT2P39981 EMI2YDR516C 1503 nt12.62□□□□□ -0.39
AVT2P39981 PET9YBL030C 957 nt12.58□□□□□ -0.4
AVT2P39981 YDL221WYDL221W 552 nt12.53□□□□□ -0.4
AVT2P39981 YMR057CYMR057C 372 nt12.52□□□□□ -0.41
AVT2P39981 IRC15YPL017C 1500 nt12.51□□□□□ -0.41
AVT2P39981 IDH1YNL037C 1083 nt12.48□□□□□ -0.41
AVT2P39981 RTS2YOR077W 699 nt12.45□□□□□ -0.42
AVT2P39981 LPX1YOR084W 1164 nt12.45□□□□□ -0.42
AVT2P39981 YMR090WYMR090W 684 nt12.44□□□□□ -0.42
AVT2P39981 ERV46YAL042W 1248 nt12.43□□□□□ -0.42
AVT2P39981 BDF1YLR399C 2061 nt12.41□□□□□ -0.42
AVT2P39981 GIS3YLR094C 1509 nt12.41□□□□□ -0.42
AVT2P39981 YBR220CYBR220C 1683 nt12.39□□□□□ -0.43
AVT2P39981 FPS1YLL043W 2010 nt12.39□□□□□ -0.43
AVT2P39981 SDH1YKL148C 1923 nt12.38□□□□□ -0.43
AVT2P39981 YDR433WYDR433W 441 nt12.37□□□□□ -0.43
AVT2P39981 GBP2YCL011C 1284 nt12.36□□□□□ -0.43
AVT2P39981 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.35□□□□□ -0.43
AVT2P39981 CUE1YMR264W 612 nt12.33□□□□□ -0.44
AVT2P39981 YKR040CYKR040C 504 nt12.31□□□□□ -0.44
AVT2P39981 SCC4YER147C 1875 nt12.31□□□□□ -0.44
AVT2P39981 SPP1YPL138C 1062 nt12.3□□□□□ -0.44
AVT2P39981 MRPL8YJL063C 717 nt12.29□□□□□ -0.44
AVT2P39981 MXR2YCL033C 507 nt12.26□□□□□ -0.45
AVT2P39981 TAT1YBR069C 1860 nt12.23□□□□□ -0.45
AVT2P39981 DED1YOR204W 1815 nt12.22□□□□□ -0.45
AVT2P39981 RRD1YIL153W 1182 nt12.21□□□□□ -0.45
AVT2P39981 TCD2YKL027W 1344 nt12.18□□□□□ -0.46
AVT2P39981 RTG1YOL067C 534 nt12.15□□□□□ -0.46
AVT2P39981 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.14□□□□□ -0.47
AVT2P39981 YEL076CYEL076C 651 nt12.14□□□□□ -0.47
AVT2P39981 YLR464WYLR464W 651 nt12.14□□□□□ -0.47
AVT2P39981 ADO1YJR105W 1023 nt12.13□□□□□ -0.47
AVT2P39981 YIL100WYIL100W 354 nt12.12□□□□□ -0.47
AVT2P39981 FMT1YBL013W 1206 nt12.09□□□□□ -0.47
AVT2P39981 FRD1YEL047C 1413 nt12.03□□□□□ -0.48
AVT2P39981 RRT12YCR045C 1476 nt12.01□□□□□ -0.49
AVT2P39981 YHL050CYHL050C 2094 nt11.99□□□□□ -0.49
AVT2P39981 SOR2YDL246C 1074 nt11.99□□□□□ -0.49
AVT2P39981 FMP52YER004W 696 nt11.99□□□□□ -0.49
AVT2P39981 SOR1YJR159W 1074 nt11.99□□□□□ -0.49
AVT2P39981 YSC84YHR016C 1407 nt11.99□□□□□ -0.49
AVT2P39981 YCL042WYCL042W 360 nt11.95□□□□□ -0.5
AVT2P39981 YNL195CYNL195C 786 nt11.92□□□□□ -0.5
AVT2P39981 HUA1YGR268C 597 nt11.91□□□□□ -0.5
AVT2P39981 ADH2YMR303C 1047 nt11.91□□□□□ -0.5
AVT2P39981 CWP1YKL096W 720 nt11.9□□□□□ -0.5
AVT2P39981 PTH1YHR189W 573 nt11.89□□□□□ -0.51
AVT2P39981 UBX6YJL048C 1191 nt11.88□□□□□ -0.51
AVT2P39981 PCM1YEL058W 1674 nt11.87□□□□□ -0.51
AVT2P39981 SEC11YIR022W 504 nt11.87□□□□□ -0.51
AVT2P39981 YLR235CYLR235C 399 nt11.83□□□□□ -0.52
AVT2P39981 PCH2YBR186W 1695 nt11.83□□□□□ -0.52
AVT2P39981 YKL030WYKL030W 606 nt11.82□□□□□ -0.52
AVT2P39981 GUT2YIL155C 1950 nt11.78□□□□□ -0.52
AVT2P39981 SNF6YHL025W 999 nt11.78□□□□□ -0.52
AVT2P39981 LCB1YMR296C 1677 nt11.75□□□□□ -0.53
AVT2P39981 YDR094WYDR094W 336 nt11.73□□□□□ -0.53
AVT2P39981 PIB2YGL023C 1908 nt11.69□□□□□ -0.54
AVT2P39981 YIH1YCR059C 777 nt11.69□□□□□ -0.54
AVT2P39981 NCP1YHR042W 2076 nt11.69□□□□□ -0.54
AVT2P39981 DIC1YLR348C 897 nt11.68□□□□□ -0.54
AVT2P39981 RNQ1YCL028W 1218 nt11.68□□□□□ -0.54
AVT2P39981 BIO4YNR057C 714 nt11.67□□□□□ -0.54
AVT2P39981 SIM1YIL123W 1431 nt11.66□□□□□ -0.54
AVT2P39981 TIM23YNR017W 669 nt11.64□□□□□ -0.55
AVT2P39981 YLL053CYLL053C 459 nt11.6□□□□□ -0.55
AVT2P39981 RTF1YGL244W 1677 nt11.59□□□□□ -0.55
AVT2P39981 YLR179CYLR179C 606 nt11.56□□□□□ -0.56
AVT2P39981 BOP3YNL042W 1191 nt11.55□□□□□ -0.56
AVT2P39981 PAC11YDR488C 1602 nt11.55□□□□□ -0.56
AVT2P39981 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.53□□□□□ -0.56
AVT2P39981 FTR1YER145C 1215 nt11.51□□□□□ -0.57
AVT2P39981 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.51□□□□□ -0.57
AVT2P39981 YPR064WYPR064W 420 nt11.5□□□□□ -0.57
AVT2P39981 LYS4YDR234W 2082 nt11.5□□□□□ -0.57
AVT2P39981 WSC2YNL283C 1512 nt11.5□□□□□ -0.57
AVT2P39981 GAL1YBR020W 1587 nt11.49□□□□□ -0.57
AVT2P39981 PTK1YKL198C 1989 nt11.47□□□□□ -0.57
AVT2P39981 AHT1YHR093W 549 nt11.46□□□□□ -0.57
AVT2P39981 ATF2YGR177C 1608 nt11.46□□□□□ -0.58
AVT2P39981 TRM5YHR070W 1500 nt11.45□□□□□ -0.58
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