Protein–RNA interactions for Protein: P39543

SOP4, Protein SOP4, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SOP4P39543 SEC11YIR022W 504 nt11.5□□□□□ -0.57
SOP4P39543 GFD2YCL036W 1701 nt11.49□□□□□ -0.57
SOP4P39543 ART5YGR068C 1761 nt11.48□□□□□ -0.57
SOP4P39543 RTS2YOR077W 699 nt11.46□□□□□ -0.57
SOP4P39543 YSC84YHR016C 1407 nt11.43□□□□□ -0.58
SOP4P39543 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.4□□□□□ -0.58
SOP4P39543 PET9YBL030C 957 nt11.35□□□□□ -0.59
SOP4P39543 YGR021WYGR021W 873 nt11.34□□□□□ -0.59
SOP4P39543 YHL050CYHL050C 2094 nt11.33□□□□□ -0.6
SOP4P39543 PIB2YGL023C 1908 nt11.31□□□□□ -0.6
SOP4P39543 HOM6YJR139C 1080 nt11.3□□□□□ -0.6
SOP4P39543 CUE1YMR264W 612 nt11.3□□□□□ -0.6
SOP4P39543 RRT12YCR045C 1476 nt11.3□□□□□ -0.6
SOP4P39543 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.28□□□□□ -0.6
SOP4P39543 TIR4YOR009W 1464 nt11.27□□□□□ -0.6
SOP4P39543 SHU1YHL006C 453 nt11.26□□□□□ -0.61
SOP4P39543 RTF1YGL244W 1677 nt11.24□□□□□ -0.61
SOP4P39543 YCH1YGR203W 447 nt11.23□□□□□ -0.61
SOP4P39543 MNP1YGL068W 585 nt11.22□□□□□ -0.61
SOP4P39543 YMR057CYMR057C 372 nt11.21□□□□□ -0.61
SOP4P39543 FPS1YLL043W 2010 nt11.2□□□□□ -0.62
SOP4P39543 YNL195CYNL195C 786 nt11.19□□□□□ -0.62
SOP4P39543 YIL100WYIL100W 354 nt11.17□□□□□ -0.62
SOP4P39543 BOP3YNL042W 1191 nt11.14□□□□□ -0.63
SOP4P39543 RKM5YLR137W 1104 nt11.13□□□□□ -0.63
SOP4P39543 NVJ2YPR091C 2313 nt11.08□□□□□ -0.64
SOP4P39543 YLR236CYLR236C 324 nt11.07□□□□□ -0.64
SOP4P39543 PTK1YKL198C 1989 nt11.07□□□□□ -0.64
SOP4P39543 NPL3YDR432W 1245 nt11.02□□□□□ -0.65
SOP4P39543 YJL152WYJL152W 360 nt11□□□□□ -0.65
SOP4P39543 NCP1YHR042W 2076 nt10.96□□□□□ -0.66
SOP4P39543 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.94□□□□□ -0.66
SOP4P39543 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.93□□□□□ -0.66
SOP4P39543 YFL054CYFL054C 1941 nt10.88□□□□□ -0.67
SOP4P39543 YKL097CYKL097C 411 nt10.84□□□□□ -0.67
SOP4P39543 LCB1YMR296C 1677 nt10.82□□□□□ -0.68
SOP4P39543 SPT8YLR055C 1809 nt10.78□□□□□ -0.68
SOP4P39543 YOL037CYOL037C 354 nt10.75□□□□□ -0.69
SOP4P39543 RRD1YIL153W 1182 nt10.7□□□□□ -0.7
SOP4P39543 BOR1YNL275W 1731 nt10.68□□□□□ -0.7
SOP4P39543 SIM1YIL123W 1431 nt10.66□□□□□ -0.7
SOP4P39543 WHI5YOR083W 888 nt10.63□□□□□ -0.71
SOP4P39543 PCM1YEL058W 1674 nt10.62□□□□□ -0.71
SOP4P39543 FMP52YER004W 696 nt10.61□□□□□ -0.71
SOP4P39543 GBP2YCL011C 1284 nt10.61□□□□□ -0.71
SOP4P39543 IDH1YNL037C 1083 nt10.6□□□□□ -0.71
SOP4P39543 SWE1YJL187C 2460 nt10.6□□□□□ -0.71
SOP4P39543 DED1YOR204W 1815 nt10.59□□□□□ -0.71
SOP4P39543 LYS4YDR234W 2082 nt10.57□□□□□ -0.72
SOP4P39543 YLR281CYLR281C 468 nt10.56□□□□□ -0.72
SOP4P39543 FMT1YBL013W 1206 nt10.56□□□□□ -0.72
SOP4P39543 TCD2YKL027W 1344 nt10.56□□□□□ -0.72
SOP4P39543 YOR139CYOR139C 393 nt10.53□□□□□ -0.72
SOP4P39543 ADH2YMR303C 1047 nt10.52□□□□□ -0.73
SOP4P39543 BIO4YNR057C 714 nt10.52□□□□□ -0.73
SOP4P39543 CWP1YKL096W 720 nt10.51□□□□□ -0.73
SOP4P39543 SNF6YHL025W 999 nt10.49□□□□□ -0.73
SOP4P39543 HSP60YLR259C 1719 nt10.47□□□□□ -0.73
SOP4P39543 Q0182Q0182 405 nt10.41□□□□□ -0.74
SOP4P39543 MXR2YCL033C 507 nt10.4□□□□□ -0.74
SOP4P39543 YDR433WYDR433W 441 nt10.38□□□□□ -0.75
SOP4P39543 ERF2YLR246W 1080 nt10.38□□□□□ -0.75
SOP4P39543 CRR1YLR213C 1269 nt10.37□□□□□ -0.75
SOP4P39543 GLK1YCL040W 1503 nt10.36□□□□□ -0.75
SOP4P39543 UME6YDR207C 2511 nt10.36□□□□□ -0.75
SOP4P39543 SOR2YDL246C 1074 nt10.34□□□□□ -0.75
SOP4P39543 SOR1YJR159W 1074 nt10.34□□□□□ -0.75
SOP4P39543 YIH1YCR059C 777 nt10.33□□□□□ -0.76
SOP4P39543 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.33□□□□□ -0.76
SOP4P39543 IMP2'YIL154C 1041 nt10.33□□□□□ -0.76
SOP4P39543 DSK2YMR276W 1122 nt10.33□□□□□ -0.76
SOP4P39543 YLL053CYLL053C 459 nt10.32□□□□□ -0.76
SOP4P39543 YCL042WYCL042W 360 nt10.32□□□□□ -0.76
SOP4P39543 FUR4YBR021W 1902 nt10.32□□□□□ -0.76
SOP4P39543 FMP45YDL222C 930 nt10.31□□□□□ -0.76
SOP4P39543 PUS2YGL063W 1113 nt10.31□□□□□ -0.76
SOP4P39543 MIC10YCL057C-A 294 nt10.31□□□□□ -0.76
SOP4P39543 HEM12YDR047W 1089 nt10.29□□□□□ -0.76
SOP4P39543 YPR011CYPR011C 981 nt10.28□□□□□ -0.76
SOP4P39543 CCA1YER168C 1641 nt10.27□□□□□ -0.77
SOP4P39543 ATF2YGR177C 1608 nt10.27□□□□□ -0.77
SOP4P39543 ALG12YNR030W 1656 nt10.27□□□□□ -0.77
SOP4P39543 RNQ1YCL028W 1218 nt10.26□□□□□ -0.77
SOP4P39543 RAX1YOR301W 1308 nt10.24□□□□□ -0.77
SOP4P39543 SNG1YGR197C 1644 nt10.23□□□□□ -0.77
SOP4P39543 FRD1YEL047C 1413 nt10.23□□□□□ -0.77
SOP4P39543 MCH5YOR306C 1566 nt10.22□□□□□ -0.77
SOP4P39543 LPX1YOR084W 1164 nt10.21□□□□□ -0.77
SOP4P39543 FTR1YER145C 1215 nt10.19□□□□□ -0.78
SOP4P39543 YFL067WYFL067W 528 nt10.19□□□□□ -0.78
SOP4P39543 ERV46YAL042W 1248 nt10.18□□□□□ -0.78
SOP4P39543 YKR040CYKR040C 504 nt10.18□□□□□ -0.78
SOP4P39543 PRP4YPR178W 1398 nt10.17□□□□□ -0.78
SOP4P39543 TRM5YHR070W 1500 nt10.17□□□□□ -0.78
SOP4P39543 GAL1YBR020W 1587 nt10.15□□□□□ -0.78
SOP4P39543 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.15□□□□□ -0.78
SOP4P39543 YEL076CYEL076C 651 nt10.15□□□□□ -0.78
SOP4P39543 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.15□□□□□ -0.78
SOP4P39543 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.15□□□□□ -0.78
SOP4P39543 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.15□□□□□ -0.78
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