Protein–RNA interactions for Protein: P38329

VHC1, Vacuolar cation-chloride cotransporter 1, yeastyeast

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Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHC1P38329 SDH1YKL148C 1923 nt12.8□□□□□ -0.36
VHC1P38329 TAT1YBR069C 1860 nt12.78□□□□□ -0.36
VHC1P38329 IRC15YPL017C 1500 nt12.78□□□□□ -0.36
VHC1P38329 ART5YGR068C 1761 nt12.78□□□□□ -0.36
VHC1P38329 GFD2YCL036W 1701 nt12.76□□□□□ -0.37
VHC1P38329 SCC4YER147C 1875 nt12.69□□□□□ -0.38
VHC1P38329 GIS3YLR094C 1509 nt12.68□□□□□ -0.38
VHC1P38329 PET9YBL030C 957 nt12.68□□□□□ -0.38
VHC1P38329 TIR4YOR009W 1464 nt12.67□□□□□ -0.38
VHC1P38329 RTS2YOR077W 699 nt12.65□□□□□ -0.38
VHC1P38329 YOL037CYOL037C 354 nt12.63□□□□□ -0.39
VHC1P38329 YCH1YGR203W 447 nt12.62□□□□□ -0.39
VHC1P38329 NPL3YDR432W 1245 nt12.6□□□□□ -0.39
VHC1P38329 YOR139CYOR139C 393 nt12.59□□□□□ -0.39
VHC1P38329 YMR057CYMR057C 372 nt12.55□□□□□ -0.4
VHC1P38329 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.54□□□□□ -0.4
VHC1P38329 CUE1YMR264W 612 nt12.52□□□□□ -0.41
VHC1P38329 YJL152WYJL152W 360 nt12.48□□□□□ -0.41
VHC1P38329 FPS1YLL043W 2010 nt12.44□□□□□ -0.42
VHC1P38329 SEC11YIR022W 504 nt12.43□□□□□ -0.42
VHC1P38329 YSC84YHR016C 1407 nt12.42□□□□□ -0.42
VHC1P38329 PCH2YBR186W 1695 nt12.42□□□□□ -0.42
VHC1P38329 YLR281CYLR281C 468 nt12.38□□□□□ -0.43
VHC1P38329 WHI5YOR083W 888 nt12.38□□□□□ -0.43
VHC1P38329 YHL050CYHL050C 2094 nt12.36□□□□□ -0.43
VHC1P38329 GUT2YIL155C 1950 nt12.36□□□□□ -0.43
VHC1P38329 YIL100WYIL100W 354 nt12.35□□□□□ -0.43
VHC1P38329 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.33□□□□□ -0.44
VHC1P38329 RRT12YCR045C 1476 nt12.33□□□□□ -0.44
VHC1P38329 YLR236CYLR236C 324 nt12.32□□□□□ -0.44
VHC1P38329 YNL195CYNL195C 786 nt12.26□□□□□ -0.45
VHC1P38329 PIB2YGL023C 1908 nt12.2□□□□□ -0.46
VHC1P38329 IDH1YNL037C 1083 nt12.17□□□□□ -0.46
VHC1P38329 PUS2YGL063W 1113 nt12.16□□□□□ -0.46
VHC1P38329 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.12□□□□□ -0.47
VHC1P38329 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.12□□□□□ -0.47
VHC1P38329 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.12□□□□□ -0.47
VHC1P38329 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.12□□□□□ -0.47
VHC1P38329 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.12□□□□□ -0.47
VHC1P38329 RRD1YIL153W 1182 nt12.12□□□□□ -0.47
VHC1P38329 GBP2YCL011C 1284 nt12.12□□□□□ -0.47
VHC1P38329 RTF1YGL244W 1677 nt12.11□□□□□ -0.47
VHC1P38329 IMP2'YIL154C 1041 nt12.09□□□□□ -0.47
VHC1P38329 DSK2YMR276W 1122 nt12.09□□□□□ -0.47
VHC1P38329 BOP3YNL042W 1191 nt12.06□□□□□ -0.48
VHC1P38329 DED1YOR204W 1815 nt12.05□□□□□ -0.48
VHC1P38329 YPR011CYPR011C 981 nt12.05□□□□□ -0.48
VHC1P38329 TCD2YKL027W 1344 nt12.02□□□□□ -0.49
VHC1P38329 NCP1YHR042W 2076 nt12.01□□□□□ -0.49
VHC1P38329 FMP52YER004W 696 nt11.98□□□□□ -0.49
VHC1P38329 FMT1YBL013W 1206 nt11.97□□□□□ -0.49
VHC1P38329 YDR433WYDR433W 441 nt11.96□□□□□ -0.49
VHC1P38329 PTK1YKL198C 1989 nt11.96□□□□□ -0.5
VHC1P38329 FMP45YDL222C 930 nt11.95□□□□□ -0.5
VHC1P38329 MXR2YCL033C 507 nt11.94□□□□□ -0.5
VHC1P38329 LCB1YMR296C 1677 nt11.94□□□□□ -0.5
VHC1P38329 PAC11YDR488C 1602 nt11.91□□□□□ -0.5
VHC1P38329 PCM1YEL058W 1674 nt11.9□□□□□ -0.5
VHC1P38329 ERV46YAL042W 1248 nt11.89□□□□□ -0.51
VHC1P38329 LPX1YOR084W 1164 nt11.89□□□□□ -0.51
VHC1P38329 CWP1YKL096W 720 nt11.85□□□□□ -0.51
VHC1P38329 ADH2YMR303C 1047 nt11.85□□□□□ -0.51
VHC1P38329 SOR2YDL246C 1074 nt11.82□□□□□ -0.52
VHC1P38329 SOR1YJR159W 1074 nt11.82□□□□□ -0.52
VHC1P38329 YKR040CYKR040C 504 nt11.82□□□□□ -0.52
VHC1P38329 SIM1YIL123W 1431 nt11.81□□□□□ -0.52
VHC1P38329 SNF6YHL025W 999 nt11.79□□□□□ -0.52
VHC1P38329 YCL042WYCL042W 360 nt11.76□□□□□ -0.53
VHC1P38329 FRD1YEL047C 1413 nt11.76□□□□□ -0.53
VHC1P38329 BIO4YNR057C 714 nt11.75□□□□□ -0.53
VHC1P38329 YFL054CYFL054C 1941 nt11.72□□□□□ -0.53
VHC1P38329 LYS4YDR234W 2082 nt11.69□□□□□ -0.54
VHC1P38329 YIH1YCR059C 777 nt11.66□□□□□ -0.54
VHC1P38329 SPT8YLR055C 1809 nt11.63□□□□□ -0.55
VHC1P38329 RNQ1YCL028W 1218 nt11.62□□□□□ -0.55
VHC1P38329 Q0182Q0182 405 nt11.6□□□□□ -0.55
VHC1P38329 YLL053CYLL053C 459 nt11.59□□□□□ -0.55
VHC1P38329 ERF2YLR246W 1080 nt11.58□□□□□ -0.56
VHC1P38329 SPP1YPL138C 1062 nt11.56□□□□□ -0.56
VHC1P38329 CRR1YLR213C 1269 nt11.55□□□□□ -0.56
VHC1P38329 DIC1YLR348C 897 nt11.53□□□□□ -0.56
VHC1P38329 MOT3YMR070W 1473 nt11.51□□□□□ -0.57
VHC1P38329 ATF2YGR177C 1608 nt11.49□□□□□ -0.57
VHC1P38329 FTR1YER145C 1215 nt11.49□□□□□ -0.57
VHC1P38329 PTH1YHR189W 573 nt11.47□□□□□ -0.57
VHC1P38329 SWE1YJL187C 2460 nt11.46□□□□□ -0.57
VHC1P38329 GAL1YBR020W 1587 nt11.45□□□□□ -0.58
VHC1P38329 MIC10YCL057C-A 294 nt11.44□□□□□ -0.58
VHC1P38329 TRM5YHR070W 1500 nt11.43□□□□□ -0.58
VHC1P38329 HEM12YDR047W 1089 nt11.42□□□□□ -0.58
VHC1P38329 YFL067WYFL067W 528 nt11.42□□□□□ -0.58
VHC1P38329 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.41□□□□□ -0.58
VHC1P38329 YLR235CYLR235C 399 nt11.41□□□□□ -0.58
VHC1P38329 SNG1YGR197C 1644 nt11.41□□□□□ -0.58
VHC1P38329 DDR2YOL052C-A 186 nt11.37□□□□□ -0.59
VHC1P38329 TIM23YNR017W 669 nt11.36□□□□□ -0.59
VHC1P38329 NVJ2YPR091C 2313 nt11.35□□□□□ -0.59
VHC1P38329 AQY1YPR192W 918 nt11.34□□□□□ -0.59
VHC1P38329 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.33□□□□□ -0.6
VHC1P38329 YLR179CYLR179C 606 nt11.32□□□□□ -0.6
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