Protein–RNA interactions for Protein: P38187

UBP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, yeastyeast

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBP13P38187 PUS2YGL063W 1113 nt13.45□□□□□ -0.26
UBP13P38187 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.45□□□□□ -0.26
UBP13P38187 RPP2AYOL039W 321 nt13.44□□□□□ -0.26
UBP13P38187 PTP1YDL230W 1008 nt13.35□□□□□ -0.27
UBP13P38187 SSA4YER103W 1929 nt13.35□□□□□ -0.27
UBP13P38187 YJL152WYJL152W 360 nt13.33□□□□□ -0.28
UBP13P38187 DCW1YKL046C 1350 nt13.32□□□□□ -0.28
UBP13P38187 ART5YGR068C 1761 nt13.26□□□□□ -0.29
UBP13P38187 TIR4YOR009W 1464 nt13.25□□□□□ -0.29
UBP13P38187 IMP2'YIL154C 1041 nt13.24□□□□□ -0.29
UBP13P38187 YCH1YGR203W 447 nt13.23□□□□□ -0.29
UBP13P38187 DSK2YMR276W 1122 nt13.23□□□□□ -0.29
UBP13P38187 CAC2YML102W 1407 nt13.22□□□□□ -0.29
UBP13P38187 PET9YBL030C 957 nt13.22□□□□□ -0.29
UBP13P38187 EMI2YDR516C 1503 nt13.18□□□□□ -0.3
UBP13P38187 GFD2YCL036W 1701 nt13.17□□□□□ -0.3
UBP13P38187 YPR011CYPR011C 981 nt13.16□□□□□ -0.3
UBP13P38187 YLR236CYLR236C 324 nt13.13□□□□□ -0.31
UBP13P38187 YMR057CYMR057C 372 nt13.13□□□□□ -0.31
UBP13P38187 YMR090WYMR090W 684 nt13.12□□□□□ -0.31
UBP13P38187 IDH1YNL037C 1083 nt13.11□□□□□ -0.31
UBP13P38187 FMP45YDL222C 930 nt13.1□□□□□ -0.31
UBP13P38187 YDL221WYDL221W 552 nt13.09□□□□□ -0.31
UBP13P38187 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt13.04□□□□□ -0.32
UBP13P38187 IRC15YPL017C 1500 nt13.02□□□□□ -0.33
UBP13P38187 MOT3YMR070W 1473 nt13□□□□□ -0.33
UBP13P38187 RTS2YOR077W 699 nt13□□□□□ -0.33
UBP13P38187 GBP2YCL011C 1284 nt13□□□□□ -0.33
UBP13P38187 YDR433WYDR433W 441 nt12.96□□□□□ -0.33
UBP13P38187 GIS3YLR094C 1509 nt12.93□□□□□ -0.34
UBP13P38187 ERV46YAL042W 1248 nt12.93□□□□□ -0.34
UBP13P38187 LPX1YOR084W 1164 nt12.93□□□□□ -0.34
UBP13P38187 BDF1YLR399C 2061 nt12.93□□□□□ -0.34
UBP13P38187 FPS1YLL043W 2010 nt12.92□□□□□ -0.34
UBP13P38187 CUE1YMR264W 612 nt12.91□□□□□ -0.34
UBP13P38187 SDH1YKL148C 1923 nt12.9□□□□□ -0.34
UBP13P38187 YBR220CYBR220C 1683 nt12.88□□□□□ -0.35
UBP13P38187 YKR040CYKR040C 504 nt12.86□□□□□ -0.35
UBP13P38187 SCC4YER147C 1875 nt12.85□□□□□ -0.35
UBP13P38187 TCD2YKL027W 1344 nt12.85□□□□□ -0.35
UBP13P38187 MXR2YCL033C 507 nt12.82□□□□□ -0.36
UBP13P38187 NVJ2YPR091C 2313 nt12.82□□□□□ -0.36
UBP13P38187 YIL100WYIL100W 354 nt12.78□□□□□ -0.36
UBP13P38187 PAC11YDR488C 1602 nt12.75□□□□□ -0.37
UBP13P38187 RRD1YIL153W 1182 nt12.75□□□□□ -0.37
UBP13P38187 TAT1YBR069C 1860 nt12.74□□□□□ -0.37
UBP13P38187 DED1YOR204W 1815 nt12.74□□□□□ -0.37
UBP13P38187 SPP1YPL138C 1062 nt12.7□□□□□ -0.38
UBP13P38187 FMP52YER004W 696 nt12.61□□□□□ -0.39
UBP13P38187 FMT1YBL013W 1206 nt12.61□□□□□ -0.39
UBP13P38187 YCL042WYCL042W 360 nt12.61□□□□□ -0.39
UBP13P38187 FRD1YEL047C 1413 nt12.6□□□□□ -0.39
UBP13P38187 YNL195CYNL195C 786 nt12.59□□□□□ -0.39
UBP13P38187 SOR2YDL246C 1074 nt12.54□□□□□ -0.4
UBP13P38187 SOR1YJR159W 1074 nt12.54□□□□□ -0.4
UBP13P38187 MRPL8YJL063C 717 nt12.53□□□□□ -0.4
UBP13P38187 CWP1YKL096W 720 nt12.52□□□□□ -0.41
UBP13P38187 RRT12YCR045C 1476 nt12.51□□□□□ -0.41
UBP13P38187 YSC84YHR016C 1407 nt12.5□□□□□ -0.41
UBP13P38187 Q0182Q0182 405 nt12.47□□□□□ -0.41
UBP13P38187 ADH2YMR303C 1047 nt12.47□□□□□ -0.41
UBP13P38187 RTG1YOL067C 534 nt12.47□□□□□ -0.41
UBP13P38187 PCM1YEL058W 1674 nt12.45□□□□□ -0.42
UBP13P38187 YHL050CYHL050C 2094 nt12.44□□□□□ -0.42
UBP13P38187 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.44□□□□□ -0.42
UBP13P38187 YEL076CYEL076C 651 nt12.44□□□□□ -0.42
UBP13P38187 YLR464WYLR464W 651 nt12.44□□□□□ -0.42
UBP13P38187 SEC11YIR022W 504 nt12.43□□□□□ -0.42
UBP13P38187 ADO1YJR105W 1023 nt12.42□□□□□ -0.42
UBP13P38187 PTH1YHR189W 573 nt12.41□□□□□ -0.42
UBP13P38187 SNF6YHL025W 999 nt12.4□□□□□ -0.42
UBP13P38187 YLR235CYLR235C 399 nt12.38□□□□□ -0.43
UBP13P38187 YKL030WYKL030W 606 nt12.32□□□□□ -0.44
UBP13P38187 PCH2YBR186W 1695 nt12.31□□□□□ -0.44
UBP13P38187 HUA1YGR268C 597 nt12.3□□□□□ -0.44
UBP13P38187 DIC1YLR348C 897 nt12.27□□□□□ -0.45
UBP13P38187 RNQ1YCL028W 1218 nt12.27□□□□□ -0.45
UBP13P38187 YIH1YCR059C 777 nt12.26□□□□□ -0.45
UBP13P38187 LCB1YMR296C 1677 nt12.26□□□□□ -0.45
UBP13P38187 SIM1YIL123W 1431 nt12.24□□□□□ -0.45
UBP13P38187 GUT2YIL155C 1950 nt12.23□□□□□ -0.45
UBP13P38187 TIM23YNR017W 669 nt12.21□□□□□ -0.45
UBP13P38187 BIO4YNR057C 714 nt12.19□□□□□ -0.46
UBP13P38187 YLL053CYLL053C 459 nt12.16□□□□□ -0.46
UBP13P38187 YLR179CYLR179C 606 nt12.15□□□□□ -0.46
UBP13P38187 PIB2YGL023C 1908 nt12.09□□□□□ -0.47
UBP13P38187 BOP3YNL042W 1191 nt12.09□□□□□ -0.47
UBP13P38187 NCP1YHR042W 2076 nt12.09□□□□□ -0.47
UBP13P38187 RTF1YGL244W 1677 nt12.07□□□□□ -0.48
UBP13P38187 FTR1YER145C 1215 nt12.07□□□□□ -0.48
UBP13P38187 YPR064WYPR064W 420 nt12.07□□□□□ -0.48
UBP13P38187 AQY1YPR192W 918 nt12.05□□□□□ -0.48
UBP13P38187 GAL1YBR020W 1587 nt12.05□□□□□ -0.48
UBP13P38187 ERF2YLR246W 1080 nt12.03□□□□□ -0.48
UBP13P38187 AHT1YHR093W 549 nt12.02□□□□□ -0.49
UBP13P38187 TRM5YHR070W 1500 nt12.01□□□□□ -0.49
UBP13P38187 WSC2YNL283C 1512 nt12.01□□□□□ -0.49
UBP13P38187 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt12□□□□□ -0.49
UBP13P38187 UBX6YJL048C 1191 nt12□□□□□ -0.49
UBP13P38187 TAD3YLR316C 969 nt11.99□□□□□ -0.49
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