Protein–RNA interactions for Protein: P38176

AVT5, Vacuolar amino acid transporter 5, yeastyeast

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT5P38176 YSC84YHR016C 1407 nt10.11□□□□□ -0.79
AVT5P38176 YGR021WYGR021W 873 nt10.11□□□□□ -0.79
AVT5P38176 SHU1YHL006C 453 nt10.1□□□□□ -0.79
AVT5P38176 CCT6YDR188W 1641 nt10.07□□□□□ -0.8
AVT5P38176 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.07□□□□□ -0.8
AVT5P38176 PTP1YDL230W 1008 nt10.05□□□□□ -0.8
AVT5P38176 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.05□□□□□ -0.8
AVT5P38176 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.05□□□□□ -0.8
AVT5P38176 RPP2AYOL039W 321 nt10.05□□□□□ -0.8
AVT5P38176 HOM6YJR139C 1080 nt10.01□□□□□ -0.81
AVT5P38176 IRC15YPL017C 1500 nt10.01□□□□□ -0.81
AVT5P38176 MCH5YOR306C 1566 nt10.01□□□□□ -0.81
AVT5P38176 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10□□□□□ -0.81
AVT5P38176 BOP3YNL042W 1191 nt10□□□□□ -0.81
AVT5P38176 PTK1YKL198C 1989 nt10□□□□□ -0.81
AVT5P38176 YHL050CYHL050C 2094 nt9.99□□□□□ -0.81
AVT5P38176 GIS3YLR094C 1509 nt9.98□□□□□ -0.81
AVT5P38176 SIS1YNL007C 1059 nt9.98□□□□□ -0.81
AVT5P38176 YKL097CYKL097C 411 nt9.97□□□□□ -0.81
AVT5P38176 MNP1YGL068W 585 nt9.88□□□□□ -0.83
AVT5P38176 RKM5YLR137W 1104 nt9.87□□□□□ -0.83
AVT5P38176 RRT12YCR045C 1476 nt9.86□□□□□ -0.83
AVT5P38176 MOT3YMR070W 1473 nt9.83□□□□□ -0.84
AVT5P38176 YFL054CYFL054C 1941 nt9.81□□□□□ -0.84
AVT5P38176 ART5YGR068C 1761 nt9.8□□□□□ -0.84
AVT5P38176 ALG12YNR030W 1656 nt9.8□□□□□ -0.84
AVT5P38176 YCH1YGR203W 447 nt9.78□□□□□ -0.84
AVT5P38176 PET9YBL030C 957 nt9.78□□□□□ -0.84
AVT5P38176 GFD2YCL036W 1701 nt9.78□□□□□ -0.84
AVT5P38176 SPT8YLR055C 1809 nt9.75□□□□□ -0.85
AVT5P38176 HSP60YLR259C 1719 nt9.74□□□□□ -0.85
AVT5P38176 YNL195CYNL195C 786 nt9.74□□□□□ -0.85
AVT5P38176 RTS2YOR077W 699 nt9.73□□□□□ -0.85
AVT5P38176 YOL037CYOL037C 354 nt9.71□□□□□ -0.86
AVT5P38176 YJL225CYJL225C 5277 nt9.69□□□□□ -0.86
AVT5P38176 TIR4YOR009W 1464 nt9.68□□□□□ -0.86
AVT5P38176 NPL3YDR432W 1245 nt9.63□□□□□ -0.87
AVT5P38176 CUE1YMR264W 612 nt9.63□□□□□ -0.87
AVT5P38176 NCP1YHR042W 2076 nt9.62□□□□□ -0.87
AVT5P38176 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt9.62□□□□□ -0.87
AVT5P38176 YMR057CYMR057C 372 nt9.61□□□□□ -0.87
AVT5P38176 YJL152WYJL152W 360 nt9.58□□□□□ -0.88
AVT5P38176 NAR1YNL240C 1476 nt9.56□□□□□ -0.88
AVT5P38176 YOR139CYOR139C 393 nt9.56□□□□□ -0.88
AVT5P38176 GLK1YCL040W 1503 nt9.55□□□□□ -0.88
AVT5P38176 YIL100WYIL100W 354 nt9.54□□□□□ -0.88
AVT5P38176 YLR236CYLR236C 324 nt9.52□□□□□ -0.89
AVT5P38176 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt9.5□□□□□ -0.89
AVT5P38176 SWE1YJL187C 2460 nt9.5□□□□□ -0.89
AVT5P38176 RDN37-1RDN37-1 5354 nt9.5□□□□□ -0.89
AVT5P38176 RDN37-2RDN37-2 5354 nt9.5□□□□□ -0.89
AVT5P38176 YLR281CYLR281C 468 nt9.47□□□□□ -0.89
AVT5P38176 WHI5YOR083W 888 nt9.47□□□□□ -0.89
AVT5P38176 DSK2YMR276W 1122 nt9.43□□□□□ -0.9
AVT5P38176 IDH1YNL037C 1083 nt9.37□□□□□ -0.91
AVT5P38176 IMP2'YIL154C 1041 nt9.35□□□□□ -0.91
AVT5P38176 AAC1YMR056C 930 nt9.35□□□□□ -0.91
AVT5P38176 CMP2YML057W 1815 nt9.35□□□□□ -0.91
AVT5P38176 FUR4YBR021W 1902 nt9.31□□□□□ -0.92
AVT5P38176 LCB1YMR296C 1677 nt9.3□□□□□ -0.92
AVT5P38176 GBP2YCL011C 1284 nt9.3□□□□□ -0.92
AVT5P38176 PRP4YPR178W 1398 nt9.29□□□□□ -0.92
AVT5P38176 PUS2YGL063W 1113 nt9.29□□□□□ -0.92
AVT5P38176 TCD2YKL027W 1344 nt9.26□□□□□ -0.93
AVT5P38176 FMP52YER004W 696 nt9.25□□□□□ -0.93
AVT5P38176 RRD1YIL153W 1182 nt9.25□□□□□ -0.93
AVT5P38176 DPS1YLL018C 1674 nt9.24□□□□□ -0.93
AVT5P38176 BIO5YNR056C 1686 nt9.23□□□□□ -0.93
AVT5P38176 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt9.23□□□□□ -0.93
AVT5P38176 YEL076CYEL076C 651 nt9.23□□□□□ -0.93
AVT5P38176 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt9.23□□□□□ -0.93
AVT5P38176 IMT4tM(CAU)E 72 nt9.23□□□□□ -0.93
AVT5P38176 IMT3tM(CAU)J3 72 nt9.23□□□□□ -0.93
AVT5P38176 IMT1tM(CAU)O1 72 nt9.23□□□□□ -0.93
AVT5P38176 IMT2tM(CAU)P 72 nt9.23□□□□□ -0.93
AVT5P38176 CYT2YKL087C 675 nt9.23□□□□□ -0.93
AVT5P38176 YLR464WYLR464W 651 nt9.23□□□□□ -0.93
AVT5P38176 PBP1YGR178C 2169 nt9.2□□□□□ -0.94
AVT5P38176 DED1YOR204W 1815 nt9.19□□□□□ -0.94
AVT5P38176 HSL7YBR133C 2484 nt9.19□□□□□ -0.94
AVT5P38176 YDR433WYDR433W 441 nt9.16□□□□□ -0.94
AVT5P38176 BIO4YNR057C 714 nt9.16□□□□□ -0.94
AVT5P38176 BMT6YLR063W 1098 nt9.15□□□□□ -0.94
AVT5P38176 PCM1YEL058W 1674 nt9.13□□□□□ -0.95
AVT5P38176 FMP45YDL222C 930 nt9.12□□□□□ -0.95
AVT5P38176 FMT1YBL013W 1206 nt9.11□□□□□ -0.95
AVT5P38176 YPR011CYPR011C 981 nt9.11□□□□□ -0.95
AVT5P38176 HEL2YDR266C 1920 nt9.1□□□□□ -0.95
AVT5P38176 SNF1YDR477W 1902 nt9.1□□□□□ -0.95
AVT5P38176 ERV46YAL042W 1248 nt9.1□□□□□ -0.95
AVT5P38176 LYS4YDR234W 2082 nt9.09□□□□□ -0.95
AVT5P38176 SIM1YIL123W 1431 nt9.08□□□□□ -0.96
AVT5P38176 CWP1YKL096W 720 nt9.08□□□□□ -0.96
AVT5P38176 SNF6YHL025W 999 nt9.07□□□□□ -0.96
AVT5P38176 YKR040CYKR040C 504 nt9.07□□□□□ -0.96
AVT5P38176 MXR2YCL033C 507 nt9.07□□□□□ -0.96
AVT5P38176 YCL042WYCL042W 360 nt9.07□□□□□ -0.96
AVT5P38176 SOR2YDL246C 1074 nt9.06□□□□□ -0.96
AVT5P38176 SOR1YJR159W 1074 nt9.06□□□□□ -0.96
AVT5P38176 ADH2YMR303C 1047 nt9.05□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 40.6 ms