Protein–RNA interactions for Protein: P36012

CSE4, Histone H3-like centromeric protein CSE4, yeastyeast

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSE4P36012 Q0182Q0182 405 nt16.18■□□□□ 0.18
CSE4P36012 SUF2tP(AGG)C 72 nt16.17■□□□□ 0.18
CSE4P36012 SUF10tP(AGG)N 72 nt16.17■□□□□ 0.18
CSE4P36012 ALF1YNL148C 765 nt16.17■□□□□ 0.18
CSE4P36012 YPS1YLR120C 1710 nt16.07■□□□□ 0.16
CSE4P36012 SPT5YML010W 3192 nt16.06■□□□□ 0.16
CSE4P36012 YJL152WYJL152W 360 nt16.06■□□□□ 0.16
CSE4P36012 YDR095CYDR095C 411 nt16.05■□□□□ 0.16
CSE4P36012 MRPL8YJL063C 717 nt16.03■□□□□ 0.16
CSE4P36012 LPX1YOR084W 1164 nt16.01■□□□□ 0.15
CSE4P36012 ERV46YAL042W 1248 nt15.96■□□□□ 0.15
CSE4P36012 SIS1YNL007C 1059 nt15.96■□□□□ 0.15
CSE4P36012 IDH1YNL037C 1083 nt15.92■□□□□ 0.14
CSE4P36012 SPP1YPL138C 1062 nt15.92■□□□□ 0.14
CSE4P36012 TIR4YOR009W 1464 nt15.86■□□□□ 0.13
CSE4P36012 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt15.85■□□□□ 0.13
CSE4P36012 YDR433WYDR433W 441 nt15.82■□□□□ 0.12
CSE4P36012 ADO1YJR105W 1023 nt15.79■□□□□ 0.12
CSE4P36012 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt15.78■□□□□ 0.12
CSE4P36012 YEL076CYEL076C 651 nt15.78■□□□□ 0.12
CSE4P36012 YKR040CYKR040C 504 nt15.78■□□□□ 0.12
CSE4P36012 YLR464WYLR464W 651 nt15.78■□□□□ 0.12
CSE4P36012 RTG1YOL067C 534 nt15.77■□□□□ 0.12
CSE4P36012 GBP2YCL011C 1284 nt15.75■□□□□ 0.11
CSE4P36012 RPP2AYOL039W 321 nt15.74■□□□□ 0.11
CSE4P36012 MXR2YCL033C 507 nt15.7■□□□□ 0.1
CSE4P36012 MEP2YNL142W 1500 nt15.68■□□□□ 0.1
CSE4P36012 PTP1YDL230W 1008 nt15.68■□□□□ 0.1
CSE4P36012 ART5YGR068C 1761 nt15.67■□□□□ 0.1
CSE4P36012 CAC2YML102W 1407 nt15.65■□□□□ 0.1
CSE4P36012 UBX6YJL048C 1191 nt15.64■□□□□ 0.09
CSE4P36012 YMR057CYMR057C 372 nt15.63■□□□□ 0.09
CSE4P36012 PET9YBL030C 957 nt15.62■□□□□ 0.09
CSE4P36012 GFD2YCL036W 1701 nt15.56■□□□□ 0.08
CSE4P36012 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt15.55■□□□□ 0.08
CSE4P36012 DCW1YKL046C 1350 nt15.5■□□□□ 0.07
CSE4P36012 TCD2YKL027W 1344 nt15.48■□□□□ 0.07
CSE4P36012 DED1YOR204W 1815 nt15.41■□□□□ 0.06
CSE4P36012 HUA1YGR268C 597 nt15.41■□□□□ 0.06
CSE4P36012 FRD1YEL047C 1413 nt15.39■□□□□ 0.05
CSE4P36012 RRD1YIL153W 1182 nt15.37■□□□□ 0.05
CSE4P36012 FPS1YLL043W 2010 nt15.36■□□□□ 0.05
CSE4P36012 SSA4YER103W 1929 nt15.34■□□□□ 0.05
CSE4P36012 YDR094WYDR094W 336 nt15.3■□□□□ 0.04
CSE4P36012 RTS2YOR077W 699 nt15.3■□□□□ 0.04
CSE4P36012 FMT1YBL013W 1206 nt15.25■□□□□ 0.03
CSE4P36012 EMI2YDR516C 1503 nt15.25■□□□□ 0.03
CSE4P36012 PTH1YHR189W 573 nt15.24■□□□□ 0.03
CSE4P36012 IRC15YPL017C 1500 nt15.22■□□□□ 0.03
CSE4P36012 SOR2YDL246C 1074 nt15.19■□□□□ 0.02
CSE4P36012 SOR1YJR159W 1074 nt15.19■□□□□ 0.02
CSE4P36012 YCL042WYCL042W 360 nt15.19■□□□□ 0.02
CSE4P36012 YKL030WYKL030W 606 nt15.17■□□□□ 0.02
CSE4P36012 CUE1YMR264W 612 nt15.17■□□□□ 0.02
CSE4P36012 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt15.14■□□□□ 0.01
CSE4P36012 YLR235CYLR235C 399 nt15.14■□□□□ 0.01
CSE4P36012 YDL221WYDL221W 552 nt15.13■□□□□ 0.01
CSE4P36012 LCB1YMR296C 1677 nt15.08■□□□□ 0
CSE4P36012 GIS3YLR094C 1509 nt15.07■□□□□ 0
CSE4P36012 FMP52YER004W 696 nt15.02■□□□□ -0
CSE4P36012 CWP1YKL096W 720 nt15□□□□□ -0.01
CSE4P36012 YMR090WYMR090W 684 nt15□□□□□ -0.01
CSE4P36012 YBR220CYBR220C 1683 nt14.99□□□□□ -0.01
CSE4P36012 ADH2YMR303C 1047 nt14.96□□□□□ -0.01
CSE4P36012 SDH1YKL148C 1923 nt14.96□□□□□ -0.02
CSE4P36012 YIL100WYIL100W 354 nt14.94□□□□□ -0.02
CSE4P36012 SCC4YER147C 1875 nt14.87□□□□□ -0.03
CSE4P36012 TIM23YNR017W 669 nt14.86□□□□□ -0.03
CSE4P36012 DIC1YLR348C 897 nt14.83□□□□□ -0.04
CSE4P36012 YFR018CYFR018C 1092 nt14.8□□□□□ -0.04
CSE4P36012 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt14.8□□□□□ -0.04
CSE4P36012 PAU16YKL224C 372 nt14.8□□□□□ -0.04
CSE4P36012 PCM1YEL058W 1674 nt14.8□□□□□ -0.04
CSE4P36012 BDF1YLR399C 2061 nt14.79□□□□□ -0.04
CSE4P36012 SNF6YHL025W 999 nt14.76□□□□□ -0.05
CSE4P36012 YLR179CYLR179C 606 nt14.75□□□□□ -0.05
CSE4P36012 PRE6YOL038W 765 nt14.73□□□□□ -0.05
CSE4P36012 RNQ1YCL028W 1218 nt14.7□□□□□ -0.06
CSE4P36012 YIH1YCR059C 777 nt14.69□□□□□ -0.06
CSE4P36012 RRT5YFR032C 870 nt14.68□□□□□ -0.06
CSE4P36012 SBA1YKL117W 651 nt14.68□□□□□ -0.06
CSE4P36012 YPR064WYPR064W 420 nt14.68□□□□□ -0.06
CSE4P36012 WSC2YNL283C 1512 nt14.65□□□□□ -0.06
CSE4P36012 TAD3YLR316C 969 nt14.64□□□□□ -0.07
CSE4P36012 AHT1YHR093W 549 nt14.62□□□□□ -0.07
CSE4P36012 TAT1YBR069C 1860 nt14.57□□□□□ -0.08
CSE4P36012 YNL195CYNL195C 786 nt14.55□□□□□ -0.08
CSE4P36012 RRT12YCR045C 1476 nt14.55□□□□□ -0.08
CSE4P36012 YHL050CYHL050C 2094 nt14.51□□□□□ -0.09
CSE4P36012 YFL066CYFL066C 1179 nt14.51□□□□□ -0.09
CSE4P36012 YLL053CYLL053C 459 nt14.51□□□□□ -0.09
CSE4P36012 YSC84YHR016C 1407 nt14.5□□□□□ -0.09
CSE4P36012 BIO4YNR057C 714 nt14.47□□□□□ -0.09
CSE4P36012 FTR1YER145C 1215 nt14.44□□□□□ -0.1
CSE4P36012 PEX25YPL112C 1185 nt14.44□□□□□ -0.1
CSE4P36012 AQY1YPR192W 918 nt14.43□□□□□ -0.1
CSE4P36012 BDH1YAL060W 1149 nt14.41□□□□□ -0.1
CSE4P36012 YSP3YOR003W 1437 nt14.41□□□□□ -0.1
CSE4P36012 GAL1YBR020W 1587 nt14.4□□□□□ -0.1
CSE4P36012 SIM1YIL123W 1431 nt14.39□□□□□ -0.11
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